Белки, связанные с вирионами HBV

Появление гепатоцеллюлярной карциномы (ГЦК) побудило к поиску полного понимания биологии одного из ее основных возбудителей, вируса гепатита В (ВГВ). Частицы HBV приобретают путем почкования и инкапсуляции клеточных белков. По некоторым видам вирусов появляется все больше свидетельств того, что связанные с вирионами белки склонны участвовать либо на стадиях репликации, отпочкования/выхода, либо на стадиях входа/высвобождения вирусного цикла.

Идентификация таких мишеней может дать идеальных кандидатов для понимания зависимости HBV от ограниченного подмножества белков-хозяев, таким образом предоставляя уточненные наборы генетически стабильных мишеней для терапии. Целью этого проекта является создание адекватных условий для надежной и воспроизводимой очистки вирионов ВГВ в клинических образцах с последующей идентификацией их белков-хозяев, связанных с ВГВ, и характеристикой их функций. Протеомное профилирование частиц HBV, выделенных из клинических образцов, будет наложено на белки, идентифицированные и охарактеризованные в частицах HBV, выращенных в клеточной культуре, с использованием критериев степени обнаружения клинических биомаркеров. Мишени, выявленные в обоих наборах образцов, будут подвергнуты исследованиям in vitro с использованием HBV-реплицирующихся клеток. Обычные биохимические методы и методы визуализации будут использоваться для того, чтобы: (i) установить их физическую связь с вирионами HBV; (ii) определить модальности их взаимодействия с белками HBV; (iii) расшифровать топологию и субклеточную локализацию их ассоциации с белками и вирионами HBV; (iv) количественно оценить их функциональное участие в почковании, выходе или секреции частиц и инфекционности. Кандидат, который дал удовлетворительные результаты в этих экспериментах, будет раскрыт и дополнительно исследован на уровне структурной биологии в рамках совместных исследовательских программ.