Białka związane z wirionami HBV

Pojawienie się raka wątrobowokomórkowego (HCC) skłoniło do poszukiwania dogłębnego zrozumienia biologii jednego z jego głównych czynników sprawczych, wirusa zapalenia wątroby typu B (HBV). Cząsteczki HBV nabywają się poprzez pączkowanie i enkapsydację białek komórkowych. Istnieje coraz więcej dowodów na temat kilku gatunków wirusów, że białka związane z wirionami są podatne na etapy replikacji, pączkowania/wychodzenia lub wejścia/uwalniania cyklu wirusowego.

Zidentyfikowanie takich celów może dostarczyć idealnych kandydatów do uzyskania wglądu w zależność HBV od ograniczonego podzbioru białek gospodarza, zapewniając w ten sposób wyrafinowane zestawy stabilnych genetycznie celów terapii. Celem tego projektu jest stworzenie odpowiednich warunków do solidnego i powtarzalnego oczyszczania wirionów HBV w próbkach klinicznych, a następnie identyfikacja ich białek gospodarza związanych z HBV i scharakteryzowanie ich funkcji. Profilowanie proteomiczne cząstek HBV oczyszczonych z próbek klinicznych zostanie nałożone na białka zidentyfikowane i scharakteryzowane w cząsteczkach HBV wyhodowanych w hodowli komórkowej, przy użyciu kryteriów stopnia odkrycia biomarkerów klinicznych. Cele zidentyfikowane w obu zestawach próbek zostaną poddane badaniom in vitro przy użyciu komórek replikujących HBV. Konwencjonalne metody biochemiczne i obrazowe zostaną wykorzystane w celu: (i) ustalenia ich fizycznego związku z wirionami HBV; (ii) zdefiniować modalności ich interakcji z białkami HBV; (iii) rozszyfrować topologię i subkomórkową lokalizację ich związku z białkami i wirionami HBV; (iv) ocenić ilościowo ich funkcjonalne zaangażowanie w pączkowanie cząstek, wydostawanie się lub wydzielanie oraz zakaźność. Kandydat, który uzyskał zadowalające wyniki w tych eksperymentach, zostanie ujawniony i dalej badany na poziomie biologii strukturalnej, w ramach wspólnych programów badawczych.