HBV Virions bundne proteiner

Fremkomsten af ​​hepatocellulært karcinom (HCC) har foranlediget en søgen efter en grundig forståelse af biologien af ​​et af dets vigtigste årsagsstoffer, hepatitis B-virus (HBV). HBV-partikler erhverver via spirende og indkapsling cellulære proteiner. Der er stigende beviser på adskillige virale arter for, at virionbundne proteiner er tilbøjelige til at være involveret enten ved replikation, knopskydning/udgang eller indtræden/frigivelsestrin i den virale cyklus.

Identifikation af sådanne mål kan give ideelle kandidater til at opnå indsigt i afhængigheden af ​​HBV af en begrænset undergruppe af værtsproteiner, hvilket giver raffinerede sæt af genetisk stabile mål til terapi. Dette projekts mål er at opstille passende betingelser for robust og reproducerbar oprensning af HBV-virioner i kliniske prøver, efterfulgt af identifikation af deres HBV-bundne værtsproteiner og karakterisering af deres funktioner. Proteomisk profilering af HBV-partikler oprenset fra kliniske prøver vil blive overlejret med proteiner, der er identificeret og karakteriseret i cellekultur-dyrkede HBV-partikler, ved brug af kriterier for klinisk biomarkør opdagelsesgrad. Mål identificeret i begge prøvesæt vil blive udsat for in vitro undersøgelser ved hjælp af HBV-replikerende celler. Konventionelle biokemiske og billeddannende metoder vil blive anvendt for at: (i) fastslå deres fysiske association med HBV-virioner; (ii) definere modaliteterne for deres interaktion med HBV-proteiner; (iii) dechifrere topologien og subcellulær lokalisering af deres association med HBV-proteiner og virioner; (iv) kvantitativt vurdere deres funktionelle involvering i partikel knopskydning, udgang eller sekretion og infektivitet. En kandidat, der gav tilfredsstillende resultater i disse eksperimenter, vil blive afsløret og yderligere undersøgt på det strukturelle biologiniveau i samarbejdsprogrammer.