Identifiering av molekylära biomarkörer för Cancer Target Therapy Effektivitet

Den ursprungliga beräkningsalgoritmen Oncobox utvecklades för att fastställa molekylära egenskaper hos enskilda tumörer. Det representerar lösningen för ett personligt urval av målterapier mot cancer. Metoden är baserad på analys av genuttrycksprofilen för ett cancerprov i jämförelse med motsvarande normala vävnadsbioprover för att välja de mest effektiva molekylära målen för deras hämning och följaktligen för att identifiera mer effektiva målläkemedel för cancerbehandling. Histologiskt material som erhållits från cancerpatienter under operation eller core-needle biopsi som en del av standardbehandling kommer att användas för analysen. Totalt RNA extraherat från tumörmaterialet kommer att utsättas för nästa generations sekvensering (NGS). Genom att jämföra transkriptomprofilen för tumörprovet med profilerna för motsvarande normala vävnadsprover kommer hastigheten för aktivering/deaktivering av molekylvägar att beräknas, liksom förhållandet mellan fall och normala för de individuella genprodukterna - molekylära mål för läkemedel. Baserat på dessa data kommer varje målläkemedel att tilldelas en poäng som återspeglar dess potentiella effekt för varje enskild tumörbehandling. Ett läkemedel med poängvärdet över 0,1 kommer att anses vara potentiellt effektivt, ett läkemedel med poängvärdet lika med eller under 0,1 - som potentiellt ineffektivt. Efter Oncobox-testet kommer 130 målläkemedel mot cancer att bedömas enligt deras förväntade effektivitet (se listan över kvalificerade målläkemedel nedan). Denna information kommer att vara fullt tillgänglig för en patient och hans/hennes läkare. Läkaren kommer att ordinera behandling efter hans/hennes övervägande, t.ex. utifrån vårdens standarder och patientens livsindikationer. Efter utnämningen av terapi kommer patienterna naturligt att delas in i följande tre observationsgrupper. Den första gruppen kommer att bildas från patienter som får målläkemedel med poängvärdet över 0,1 som monoterapi eller i kombination. Den andra gruppen - patienter som endast får icke-målläkemedel eller målläkemedel med poängvärdet lika med eller under 0,1 som monoterapi eller i kombination. Den tredje gruppen kommer att utgöras av patienter som får palliativ vård. Inom denna studie kommer dessa tre grupper att jämföras med respons på terapin enligt resultaten av instrumentella studier, med tid till progression och med tid till progression jämfört med föregående behandlingslinje (om någon). Dessutom kommer den totala överlevnaden att mätas i alla tre grupperna.

Kvalificerade målläkemedel:

1. Abemaciclib (LY2835219)
2. Afatinib
3. Aflibercept
4. Alectinib
5. Alemtuzumab
6. Alitretinoin
7. Anastrozol
8. Apalutamid, ARN-509
9. Arseniktrioxid
10. Atezolizumab
11. Avelumab
12. Axitinib
13. Belinostat
14. Bevacizumab
15. Bexaroten
16. Bicalutamid
17. Binimetinib (MEK162)
18. Blinatumomab
19. Bortezomib
20. Bosutinib
21. Brentuximab vedotin
22. Brigatinib
23. Cabazitaxel
24. Cabozantinib
25. Carfilzomib
26. Ceritinib (Zykadia, LDK378)
27. Cetuximab
28. Cobimetinib
29. Crizotinib
30. CYT387 (momelotinib)
31. Dabrafenib
32. Daratumumab
33. Dasatinib
34. Degarelix
35. Denileukin diftitox (Ontac)
36. Denosumab
37. Docetaxel
38. Dovitinib
39. Durvalumab
40. Elotuzumab
41. Encorafenib
42. Enzalutamid
43. Erlotinib
44. Estramustin
45. Everolimus
46. Exemestan
47. Flavopiridol (Alvociclib)
48. Foretinib
49. Fulvestrant
50. Ganetespib (STA-9090)
51. Gefitinib
52. Goserelin
53. Homoharringtonin (Omacetaxine mepesuccinat)
54. Ibritumomab tiuxetan
55. Ibrutinib
56. Idelalisib
57. Imatinib
58. Inotuzumab ozogamicin
59. Ipilimumab
60. Ixabepilone
61. Ixazomib (MLN9708)
62. Lapatinib
63. Lenalidomid
64. Lenvatinib
65. Letrozol
66. Leuprolid
67. Lomustine
68. Masitinib
69. Medroxiprogesteronacetat (MPA)
70. Megestrol
71. Metyltestosteron
72. Midostaurin
73. Mogamulizumab
74. Moxetumomab pasudotox
75. Necitumumab
76. Nilotinib
77. Nilutamid
78. Nimotuzumab
79. Nintedanib (BIBF 1120)
80. Niraparib
81. Nivolumab (BMS-936558)
82. Obinutuzumab
83. Ofatumumab
84. Olaparib
85. Olaratumab
86. Osimertinib
87. Paklitaxel
88. Palbociclib
89. Panitumumab
90. Panobinostat
91. Pazopanib
92. Pembrolizumab
93. Perifosin
94. Pertuzumab
95. Pomalidomid
96. Ponatinib
97. Ramucirumab (Cyramza)
98. Regorafenib
99. Ribociclib
100. Rigosertib
101. Rituximab
102. Romidepsin
103. Rucaparib
104. Ruxolitinib
105. Selumetinib
106. Siltuximab
107. Sonidegib (LDE225)
108. Sorafenib
109. Sunitinib
110. Tamoxifen
111. Tecemotide (Emepepimut-S, L-BLP25)
112. Temozolomid
113. Temsirolimus
114. Talidomid
115. Tivantinib
116. Tivozanib
117. Toremifene
118. Trametinib (Mekinst)
119. Trastuzumab
120. Trebananib
121. Vandetanib
122. Veliparib
123. Vemurafenib
124. Venetoclax
125. Vinblastin
126. Vincristine
127. Vindesine
128. Vinorelbin
129. Vismodegib
130. Vorinostat