Идентификация молекулярных биомаркеров эффективности таргетной терапии рака

Оригинальный вычислительный алгоритм Oncobox был разработан для определения молекулярных особенностей отдельных опухолей. Он представляет собой решение для персонализированного выбора целевой противоопухолевой терапии. Метод основан на анализе профиля экспрессии генов образца рака в сравнении с соответствующими биообразцами нормальной ткани с целью выбора наиболее эффективных молекулярных мишеней для их ингибирования и, соответственно, выявления более эффективных таргетных препаратов для лечения рака. Для анализа будет использован гистологический материал, полученный от онкологических больных во время операции или толстоигольной биопсии в рамках стандартного лечения. Суммарная РНК, выделенная из опухолевого материала, будет подвергнута секвенированию следующего поколения (NGS). Путем сравнения транскриптомного профиля образца опухоли с профилями соответствующих образцов нормальной ткани будет рассчитана скорость активации/деактивации молекулярных путей, а также отношения случай-норма для отдельных генных продуктов - молекулярных мишеней лекарственных препаратов. На основании этих данных каждому целевому лекарству будет присвоен балл, отражающий его потенциальную эффективность при лечении каждой отдельной опухоли. Препарат со значением балла выше 0,1 будет считаться потенциально эффективным, препарат со значением балла равным или ниже 0,1 - потенциально неэффективным. После теста Oncobox 130 целевых противоопухолевых препаратов будут оценены в соответствии с их прогнозируемой эффективностью (см. список подходящих целевых препаратов ниже). Эта информация будет полностью доступна пациенту и его лечащему врачу. Врач назначит лечение по своему усмотрению, т.е. исходя из стандартов оказания медицинской помощи и жизненных показаний пациента. После назначения терапии больные будут естественным образом разделены на следующие три группы наблюдения. Первую группу будут формировать из пациентов, получающих таргетные препараты со значением балла выше 0,1 в виде монотерапии или в комбинации. Вторая группа - пациенты, получающие только нецелевые препараты или таргетные препараты со значением балла, равным или ниже 0,1, в виде монотерапии или в комбинации. Третью группу составят пациенты, получающие паллиативную помощь. В рамках данного исследования эти три группы будут сравниваться по ответу на терапию по результатам инструментальных исследований, по времени до прогрессирования и по времени до прогрессирования по сравнению с предыдущей линией терапии (при ее наличии). Кроме того, во всех трех группах будет измеряться общая выживаемость.

Подходящие целевые препараты:

1. Абемациклиб (LY2835219)
2. афатиниб
3. Афлиберцепт
4. Алектиниб
5. алемтузумаб
6. Алитретиноин
7. Анастрозол
8. Апалутамид, ARN-509
9. Триоксид мышьяка
10. атезолизумаб
11. авелумаб
12. акситиниб
13. Белиностат
14. бевацизумаб
15. Бексаротин
16. бикалутамид
17. Биниметиниб (MEK162)
18. Блинатумомаб
19. бортезомиб
20. бозутиниб
21. Брентуксимаб ведотин
22. Бригатиниб
23. Кабазитаксел
24. Кабозантиниб
25. Карфилзомиб
26. Церитиниб (Зикадия, LDK378)
27. Цетуксимаб
28. Кобиметиниб
29. Кризотиниб
30. CYT387 (момелотиниб)
31. Дабрафениб
32. Даратумумаб
33. Дазатиниб
34. Дегареликс
35. Денилейкин дифтитокс (Онтак)
36. Деносумаб
37. доцетаксел
38. довитиниб
39. Дурвалумаб
40. Элотузумаб
41. Энкорафениб
42. энзалутамид
43. Эрлотиниб
44. Эстрамустин
45. Эверолимус
46. Экземестан
47. Флавопиридол (Альвоциклиб)
48. Форетиниб
49. Фулвестрант
50. Ганетеспиб (STA-9090)
51. Гефитиниб
52. Госерелин
53. Гомохаррингтонин (омацетаксин мепесукцинат)
54. Ибритумомаб тиуксетан
55. Ибрутиниб
56. Иделалисиб
57. Иматиниб
58. Инотузумаб озогамицин
59. Ипилимумаб
60. Иксабепилон
61. Иксазомиб (MLN9708)
62. лапатиниб
63. Леналидомид
64. ленватиниб
65. Летрозол
66. лейпролид
67. Ломустин
68. Маситиниб
69. Медроксипрогестерона ацетат (МПА)
70. Мегестрол
71. Метилтестостерон
72. Мидостаурин
73. Могамулизумаб
74. моксетумомаб пазудотокс
75. Нецитумумаб
76. нилотиниб
77. Нилутамид
78. нимотузумаб
79. Нинтеданиб (BIBF 1120)
80. Нирапариб
81. Ниволумаб (BMS-936558)
82. Обинутузумаб
83. офатумумаб
84. олапариб
85. Оларатумаб
86. Осимертиниб
87. Паклитаксел
88. Палбоциклиб
89. Панитумумаб
90. Панобиностат
91. пазопаниб
92. пембролизумаб
93. перифозин
94. Пертузумаб
95. Помалидомид
96. Понатиниб
97. Рамуцирумаб (Cyramza)
98. Регорафениб
99. Рибоциклиб
100. Ригосертиб
101. Ритуксимаб
102. Ромидепсин
103. Рукапариб
104. руксолитиниб
105. Селуметиниб
106. Силтуксимаб
107. Сонидегиб (LDE225)
108. сорафениб
109. сунитиниб
110. Тамоксифен
111. Тецемотид (эмепепимут-S, L-BLP25)
112. темозоломид
113. Темсиролимус
114. талидомид
115. Тивантиниб
116. тивозаниб
117. Торемифен
118. Траметиниб (Мекинст)
119. Трастузумаб
120. Требананиб
121. Вандетаниб
122. Велипариб
123. вемурафениб
124. Венетоклакс
125. Винбластин
126. Винкристин
127. Виндезин
128. винорелбин
129. Висмодегиб
130. Вориностат