Bättre avgränsning av DDX3X-relaterad fenotyp och epigenetisk signatur.

Utredarna strävar efter att bättre förstå och avgränsa det genetiska syndromet DDX3X.

Denna genetiska störning beskrevs 2015 av Lot Snijders Blok et al. (DOI https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2015.07.004:).

Sedan denna första publicering av 38 kvinnliga individer som bär på en patogen mutation DDX3X, har 15 fler individer rapporterats.

Utredarna försöker bättre definiera fenotypen av individer med patogena varianter av DDX3X, för att bättre förstå intellektuell funktion såväl som styrkor och svagheter med intellektuell funktion genom att samla in standardiserade neuropsykologiska bedömningar som redan utförts såsom WPPSI/WISC och WAIS. För detta ändamål kommer utredarna att samla in kliniska och neuropsykologiska data som redan utförts i vårdsammanhang.

Slutligen kommer utredarna att försöka identifiera en epigenetisk signatur i denna genetiska sjukdom. För detta ändamål kommer utredarna att samla in genomiskt DNA från perifert blod som redan samlats in för genetisk analys och skicka en anonymiserad sats av prover till vår samarbetspartner, Dr. Bekim Sadicovik. Dr. Bekim Sadicovik och hans team kommer att jämföra de epigenetiska markörerna av DNA-metyleringstyp med motsvarande köns- och ålderskontroller. Om specifika prober är onormalt metylerade i DDX3X-individer kommer detta att bestämma en sjukdomsspecifik epigenetisk signatur. Utredarna kommer sedan att kunna föreslå en epigenetisk signatur för individer med okarakteriserade DDX3X-variationer (klass 3, VUS). Denna metod kommer att göra det möjligt att definiera om variationen är ansvarig för sjukdomen eller inte utan att gå igenom funktionsanalyssteg som är svåra att implementera rutinmässigt.

De förväntade fördelarna är en bättre förståelse av DDX3X sjukdom, nycklar till neuropsykologisk rehabilitering, en bättre förståelse av mänskliga hjärnfunktioner, möjligheten att föreslå en epigenetisk signatur för personer hos vilka det inte är möjligt att avgöra om en variation i DDX3X-genen är patologisk. eller inte