Lepsze określenie fenotypu i sygnatury epigenetycznej związanej z DDX3X.

Celem badaczy jest lepsze zrozumienie i zdefiniowanie zespołu genetycznego DDX3X.

To zaburzenie genetyczne zostało opisane w 2015 roku przez Lot Snijders Blok i in. (DOI https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2015.07.004:).

Od tej pierwszej publikacji 38 osobników płci żeńskiej niosących patogenną mutację DDX3X zgłoszono 15 kolejnych osobników.

Badacze dążą do lepszego zdefiniowania fenotypu osób z patogennymi wariantami DDX3X, aby lepiej zrozumieć funkcjonowanie intelektualne, a także mocne i słabe strony funkcjonowania intelektualnego poprzez zebranie już przeprowadzonych standaryzowanych ocen neuropsychologicznych, takich jak WPPSI/WISC i WAIS. W tym celu badacze zbiorą dane kliniczne i neuropsychologiczne, które zostały już przeprowadzone w kontekście opieki.

Na koniec badacze spróbują zidentyfikować sygnaturę epigenetyczną tej choroby genetycznej. W tym celu badacze pobiorą genomowe DNA z już pobranej krwi obwodowej do analizy genetycznej i prześlą zanonimizowaną partię próbek do naszego współpracownika, dr Bekima Sadicovika. Dr Bekim Sadicovik i jego zespół porównają epigenetyczne markery typu metylacji DNA z odpowiednimi kontrolami płci i wieku. Jeśli określone sondy są nieprawidłowo metylowane u osobników DDX3X, określi to specyficzną dla choroby sygnaturę epigenetyczną. Badacze będą wtedy mogli zaproponować sygnaturę epigenetyczną dla osób z niescharakteryzowanymi odmianami DDX3X (klasa 3, VUS). Ta metoda pozwoli określić, czy zmienność jest odpowiedzialna za chorobę, czy nie, bez przechodzenia przez etapy analizy funkcjonalnej, które są trudne do rutynowego wdrożenia.

Oczekiwane korzyści to lepsze zrozumienie choroby DDX3X, klucze do rehabilitacji neuropsychologicznej, lepsze zrozumienie funkcji ludzkiego mózgu, możliwość zaproponowania sygnatury epigenetycznej dla osób, u których nie można stwierdzić, czy zmienność w genie DDX3X jest patologiczna albo nie