Association of Microbiome Patterns With Chronic Opioid Use

Utredarna antar att det kommer att finnas distinkta egenskaper i sammansättningen av mikrobiomet hos kroniska opioidanvändare jämfört med friska kontroller (kontroller identifierade från nationell databas). Samtyckande patienter (n~ 100) - som kommer att identifieras på institutionens klinik för kronisk smärta - kommer att tillhandahålla fekala prover för analys av mikrobiomsammansättning. Dessutom kommer ytterligare data att samlas in, inklusive patientens ålder, kön, kroppsmassaindex, komorbiditeter, opioiddosering/-frekvens, smärtpoäng och smärtegenskaper. Denna ytterligare information kommer att fastställas genom ett grundläggande intagsformulär och den korta smärtinventeringen. Utredarna har tillgång till Human Microbiome Project Database och kommer att få matchade prover för att representera friska kontroller (retrospektiv allmänt tillgänglig databas).

Samtycke: Efter förhandsscreening av berättigade patienter från kliniken för kronisk smärta, kommer patienterna antingen att ge sitt samtycke personligen (vid deras klinikbesök), som i så fall kommer att fylla i intagsundersökningarna personligen och få hem en mikrobiom utrustning. Satsen kommer att kräva att patienterna torkar av sin avföring. Detta kommer sedan att skickas tillbaka till utredarna. All frakt betalas i förskott av forskargruppen. Patienter kan också ge sitt samtycke via telefon, i så fall kommer samtyckesformuläret att undertecknas via HIPAA-säkrat DocuSign. Undersökningar kommer sedan att skickas till patienten via e-post via Redcaps tjänster. Mikrobiomsatsen kommer att skickas till patientens bostad.

Statistisk analys: Mikrobiomdata är mycket dimensionella och kommer därför att analyseras med hjälp av flera metoder. Sammansättningsdata kommer att bedömas med hjälp av QIIME2-pipeline där alfa- och beta-diversitetsmätningar och taxonomiska relativa förekomster kommer att jämföras med hjälp av icke-parametriska och linjära standardmodeller (Wilcoxon Rank-Sum och Kruskal-Wallis-tester är vanligast baserat på standardmikrobiomdata) . Sekundära analyser kommer att innefatta att jämföra mikrobiomkompositioner bland undergrupper av kroniska opioidanvändare baserat på deras totala dagliga dosering.

Beräkning av provstorlek: Eftersom detta är en pilotstudie utförde utredarna ingen effektanalys. Snarare kommer de att rekrytera 100 ämnen. Resultaten från denna studie kommer att användas för att designa och driva en större finansierad prospektiv studie.