Utnyttja artificiell intelligens och multi-omics-data för att förutsäga opioidberoende

Det primära målet med detta förslag är att validera en ny genomisk och mikrobiom prediktiv modell som kan användas för att bedöma en persons risk att utveckla opioidanvändningsstörning (OUD). Följande kommer att testas: (1) MODUS (Measuring risk for Opioid Use Disorder Using SNPs), som är en genomisk panel som består av ett visst antal beprövade singelnukleotidpolymorfismer (SNP) som använder maskininlärning för att bestämma en individs risk; och (2) MICROUD (MICRObiome for Opioid Use Disorder), som kommer att vara en ny mikrobiom-prediktionspanel för OUD-risk. MODUS och MICROUD kommer att utvecklas med hjälp av befintliga offentliga datauppsättningar med genomiska och mikrobiomdata (t.ex. All of Us, Human Microbiome Project). Under utvecklingen av dessa prediktiva modeller, parallellt, kommer en extern prospektiv valideringskohort att rekryteras bestående av ämnen från University of California, San Diego, Veteran Affairs of San Diego och Veteran Affairs of Palo Alto (varje sida med separat IRB). Hypotesen är att MODUS och MICROUD kommer att ha hög prediktiv potential för att identifiera högriskpatienter för OUD.

Specifikt syfte 1. Validera en ny genomisk prediktiv panelanalys - kallad MODUS - i en prospektiv observationsstudie som syftar till att rekrytera 300 försökspersoner (~200 från UCSD och VA San Diego) med en historia av OUD. Denna genomiska panel kommer att utvecklas separat men sedan valideras på studiepopulationen. Hälsosam kontrolldata kommer att användas från en offentligt tillgänglig avidentifierad genomisk datauppsättning (All of Us Research Program) .

Specifikt syfte 2. Validera en ny mikrobiom prediktiv panelanalys - kallad MICROUD - i en prospektiv observationsstudie som syftar till att rekrytera 300 försökspersoner (~200 från UCSD och VA San Diego) med en historia av OUD. Denna mikrobiompanel kommer att utvecklas separat men sedan valideras på studiepopulationen. Hälsosamma kontrolldata kommer att användas från en offentligt tillgänglig avidentifierad mikrobiomdatauppsättning (Human Microbiome Project).