Multidimensionell genomisk dissektion av ringkromosom 14 syndrom
Studieöversikt
Detaljerad beskrivning
Kromosom 14 Ring-syndrom [R (14) S] är en sällsynt genetisk störning som huvudsakligen kännetecknas av komplexa och allvarliga neuroutvecklingsstörningar, allt från intellektuell funktionshinder till aggressivt/hyperaktivt beteende och läkemedelsresistent epilepsi. Epilepsi är faktiskt den viktigaste kliniska utmaningen i R (14), med enorma svårigheter att kontrollera svåra anfall och ett starkt behov av innovativa och effektiva behandlingar. Precisionsmedicin för R (14) S -patienter skulle underlättas kraftigt av kunskap om specifika gener involverade i patogenes. Emellertid är patofysiologin för R (14) fortfarande till stor del okänd, och identifieringen av genotyp/fenotypkorrelationer är komplicerade av samuppträdandet av kromosom 14 omarrangemang och den okända graden av R (14) mosaik i vävnader som är mest relevanta för den sjukdom. Å ena sidan finns ofta borttagningar av olika storlekar, från några hundra kb till flera MB: er, i terminal 14Q -regionen. Dessa är en osannolik förklaring till svårighetsgraden och uttrycksfullheten hos R (14) sjukdom, eftersom det har observerats att bärare av liknande linjära borttagningar av kromosom 14q sällan lider av epilepsi. Å andra sidan kan ringinstabilitet främja ökad monosomi av kromosom 14 i epilepsirelaterade områden i hjärnan (den är cirka 20% i perifert blod).
En annan fascinerande hypotes är att mekanismen och uttrycksfullheten hos R (14) sjukdom främst drivs av störningen av kromosom 14 -konformation och positionering inom kärnan orsakad av dess cirkularisering, med dramatiska effekter på fysiologiska interaktioner mellan genetiska lokaler och följaktligen på genen på gen reglering. Denna idé återupplivar en olöst fråga vid cytogenetiska störningar, om den kromosomala abnormiteten i sig ger en klinisk fenotyp utöver de patogena effekterna av den förändrade gendosen. Ringar kan bildas från vilken kromosom som helst, och de flesta ringsyndrom delar till stor del liknande kliniska fenotyper. Allvarlig epilepsi har till exempel beskrivits i R (7), R (17), R (18), R (20), R (21) och R (22) syndrom utöver R (14) s. Denna observation antyder att närvaron av en slinga i kärnan själv kan störa balansen i genuttryck.
Studietyp
Inskrivning (Faktisk)
Fas
- Inte tillämpbar
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
-
Bologna, Italien, 40138
- IRCCS Azienda Ospedaliero-Universitaria di Bologna
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Barn
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Beskrivning
Inkluderingskriterier:
- Tio LCL: er av R (14) S -patienter med 14Q -borttagningar av varierande position och omfattning i 70%och monosomi 14 i varierande grad i 60%.
- Fem LCL av föräldrar utan cytogenetiska förändringar.
Uteslutningskriterier:
- Tio LCL: er av R (14) S -patienter med 14Q -borttagningar av varierande position och omfattning i 70%och monosomi 14 i varierande grad i 60%.
- Fem LCL av föräldrar utan cytogenetiska förändringar.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Primärt syfte: Övrig
- Tilldelning: N/A
- Interventionsmodell: Enskild gruppuppgift
- Maskning: Ingen (Open Label)
Vapen och interventioner
Deltagargrupp / Arm |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Övrig: Lymfoblastoidcellinjer (LCLS)
10 LCL från R (14) S -patienter utan andra cytogenetiska förändringar valdes, liksom 5 LCL från föräldrar utan cytogenetiska förändringar
|
Long Read sekvensering (LR) och kromosomkonformation (Hi-C) med hög genomströmning (Hi-C) för att utforska och funktionellt karakterisera R (14) -händelsen och dess påverkan på den tredimensionella (3D) genomiska arkitekturen inuti cellerna i R (14 ) S patienter
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
LRS -analys av SV: er som förekommer på kromosom 14
Tidsram: 8 månader
|
|
8 månader
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Tidsram |
|---|---|
|
Genotyp-fenotypkorrelationer baserade på effekterna av graden av mosaik r (14) på förmågan att identifiera Hi-C-funktioner.
Tidsram: 8 månader
|
8 månader
|
Samarbetspartners och utredare
Utredare
- Huvudutredare: Tommaso Pippucci, Biologist, IRCCS Azienda Ospedaliero-Universitaria di Bologna
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Beräknad)
Avslutad studie (Beräknad)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- MD-RING
- RING 14 International Onlus (Annat bidrag/finansieringsnummer: RING 14 International Onlus)
- PNRR-HEAL (Annat bidrag/finansieringsnummer: MUR)
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
produkt tillverkad i och exporterad från U.S.A.
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .