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Disección genómica multidimensional del síndrome del cromosoma del anillo 14

3 de febrero de 2025 actualizado por: IRCCS Azienda Ospedaliero-Universitaria di Bologna
El anillo de MD explorará la hipótesis de que los efectos de posición y las alteraciones de TAD actúan como un patomecanismo sin precedentes en R (14) s. Esto contribuirá a una mejor comprensión de las correlaciones de genotipo a fenotipo, creando un recurso científico importante para el estudio de este y otros síndromes de anillo, con el objetivo final de ofrecer asesoramiento familiar mejorado, atención al paciente e identificar nuevas opciones terapéuticas potenciales.

Descripción general del estudio

Estado

Activo, no reclutando

Condiciones

Intervención / Tratamiento

Descripción detallada

El síndrome del anillo del cromosoma 14 [R (14) S] es un trastorno genético raro que se caracteriza principalmente por trastornos de desarrollo neurológico complejos y graves, que van desde la discapacidad intelectual hasta el comportamiento agresivo/hiperactivo y la epilepsia resistente a los fármacos. De hecho, la epilepsia es el desafío clínico más importante en R (14) S, con una enorme dificultad para controlar las convulsiones severas y una fuerte necesidad de tratamientos innovadores y efectivos. La medicina de precisión para los pacientes R (14) S se facilitaría enormemente por el conocimiento de genes específicos involucrados en la patogénesis. Sin embargo, la fisiopatología de R (14) S todavía se desconoce en gran medida, y la identificación de las correlaciones de genotipo/fenotipo se complica por la concurrencia de los reordenamientos del cromosoma 14 y el grado desconocido de mosaicismo de R (14) en los tejidos más relevantes para enfermedad. Por un lado, a menudo se encuentran deleciones de diferentes tamaños, desde unos pocos cientos de KB hasta varios MB, en la región terminal 14Q. Estas son una explicación poco probable para la gravedad y la expresividad de la enfermedad R (14), ya que se ha observado que los portadores de deleciones lineales similares del cromosoma 14Q rara vez sufren de epilepsia. Por otro lado, la inestabilidad del anillo puede promover una mayor monosomía del cromosoma 14 en las áreas del cerebro relacionadas con la epilepsia (es aproximadamente el 20% en la sangre periférica).

Otra hipótesis fascinante es que el mecanismo y la expresividad de la enfermedad R (14) se impulsan principalmente por la interrupción de la conformación y el posicionamiento del cromosoma 14 dentro del núcleo causado por su circularización, con efectos dramáticos sobre las interacciones fisiológicas entre los loci genéticos y, en consecuencia, en el gen, en el gen. regulación. Esta idea revive una pregunta no resuelta en los trastornos citogenéticos, si la anormalidad cromosómica en sí misma produce un fenotipo clínico más allá de los efectos patógenos de la dosis del gen alterada. Los anillos pueden formarse a partir de cualquier cromosoma, y ​​la mayoría de los síndromes de anillo comparten fenotipos clínicos en gran medida similares. La epilepsia severa, por ejemplo, se ha descrito en R (7), R (17), R (18), R (20), R (21) y R (22) Síndromes además de R (14) s. Esta observación sugiere que la presencia de un bucle dentro del núcleo puede interrumpir el equilibrio de la expresión génica.

Tipo de estudio

Intervencionista

Inscripción (Actual)

15

Fase

  • No aplica

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Ubicaciones de estudio

      • Bologna, Italia, 40138
        • IRCCS Azienda Ospedaliero-Universitaria di Bologna

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

  • Niño
  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

No

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Diez LCL de pacientes R (14) S con deleciones 14Q de posición variable y extensión en 70%, y monosomía 14 de grado variable en 60%.
  • Cinco LCL de padres sin alteraciones citogenéticas.

Criterios de exclusión:

  • Diez LCL de pacientes R (14) S con deleciones 14Q de posición variable y extensión en 70%, y monosomía 14 de grado variable en 60%.
  • Cinco LCL de padres sin alteraciones citogenéticas.

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Propósito principal: Otro
  • Asignación: N / A
  • Modelo Intervencionista: Asignación de un solo grupo
  • Enmascaramiento: Ninguno (etiqueta abierta)

Armas e Intervenciones

Grupo de participantes/brazo
Intervención / Tratamiento
Otro: Líneas celulares de linfoblastoides (LCLS)
Se seleccionaron 10 LCL de los pacientes con R (14) S sin otras alteraciones citogenéticas, así como 5 LCL de padres sin alteraciones citogenéticas
Long Read Sequencing (LRS) y análisis de captura de conformación cromosómica de alto rendimiento (HI-C) para explorar y caracterizar funcionalmente el evento R (14) y su impacto en la arquitectura genómica tridimensional (3D) dentro de las células de R (14 ) S Pacientes

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Análisis LRS de SVS que ocurre en el cromosoma 14
Periodo de tiempo: 8 meses
  1. Resolviendo los puntos de interrupción de secuencia de la reordenamiento del anillo estructural en pacientes con R (14) s.
  2. Construya una firma molecular específica de células 3D de pacientes con R (14) S.
  3. Identificar mecanismos regulatorios que son importantes en la fisiopatología de R (14) s.
8 meses

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Periodo de tiempo
Correlaciones de genotipo-fenotipo basados ​​en el impacto del grado de mosaicismo r (14) en la capacidad de identificar características de HI-C.
Periodo de tiempo: 8 meses
8 meses

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Investigadores

  • Investigador principal: Tommaso Pippucci, Biologist, IRCCS Azienda Ospedaliero-Universitaria di Bologna

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

15 de diciembre de 2023

Finalización primaria (Estimado)

15 de marzo de 2025

Finalización del estudio (Estimado)

15 de marzo de 2025

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

28 de noviembre de 2024

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

3 de febrero de 2025

Publicado por primera vez (Actual)

25 de marzo de 2025

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

25 de marzo de 2025

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

3 de febrero de 2025

Última verificación

1 de noviembre de 2024

Más información

Términos relacionados con este estudio

Palabras clave

Otros números de identificación del estudio

  • MD-RING
  • RING 14 International Onlus (Otro número de subvención/financiamiento: RING 14 International Onlus)
  • PNRR-HEAL (Otro número de subvención/financiamiento: MUR)

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

NO

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

producto fabricado y exportado desde los EE. UU.

No

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