Integrering av tumörgenomik och urinär exosomproteomik för att etablera ett flerlagerbiomarkerramverk för tidig riskstratifiering och postbehandlingsövervakning hos patienter med färsk sköldkörtelcancer

Denna prospektiva kliniska studie är utformad för att rekrytera patienter, i åldern 18 till 80 år, med nyupptäckt papillärt tyreoideacancer (PTC) eller högt misstänkta follikulära mönsterneoplasi, inklusive lesioner med potential för lågdifferentierad tyreoideacancer. Berättigade patienter måste ha genomgått finnålsaspirationscytologi (FNAC) som en del av den diagnostiska utredningen. (Detta är en rutinundersökning som deltagaren skulle genomgå oavsett studiedeltagande.) Cytologiska rapporter och efterföljande omfattande kirurgisk-patologiska bedömningar kommer att systematiskt dokumenteras och granskas för att säkerställa en korrekt klassificering av varje fall. Under de första två åren av studiegenomförandet strävar vi efter att rekrytera 100 på varandra följande patienter som presenterar med obehandlad, eller "färsk", tyreoideacancer. För individer som genomgår kirurgi kommer urinärt exosomalt peptidprofilering att utföras vid två standardiserade tidpunkter: (1) preoperativt, och (2) fyra veckor efter tyreoidektomi, vilket möjliggör bedömning av perioperativa biomarkörsdynamik. Kirurgisk behandling – förväntad att vara total tyreoidektomi i de flesta fall – kommer att utföras enligt standard kliniskt omdöme av erfarna endokrina kirurger. Postoperativ patologisk utvärdering kommer att inkludera noggrann karakterisering av tumörmorfologi, invasionsmönster och molekylära egenskaper, baserat på avslutade histopatologiska rapporter. Parallellt med detta inkluderar denna studie en robust tumörgenomisk undersökning som stöds av våra tidigare utvecklade och validerade next-generation sequencing (NGS)-plattformar. Under tidigare finansiering från National Science and Technology Council (NSTC) etablerade forskarna ett tyreoideacancer-specifikt DNA-baserat genpanel som riktar sig mot 50 nyckeldrivande onkogener och ett kompletterande RNA-baserat fusionspanel som täcker 19 kliniskt relevanta genomarrangemang. Dessa panel utformades genom omfattande granskning av internationellt erkända cancergenomiska databaser, baserat på tidigare framgångsrikt genomförd somatisk variantprofilering hos 51 patienter med metastaserad tyreoideacancer, inklusive 29 parade primär-metastatiska tumöranalyser, vilket visar stark förmåga för högupplöst komparativ cancergenomik. Dessutom har forskarna etablerat teknisk skicklighet i polyguaninmarkörsanalys för fylogenetisk inferens av tumörevolution och har tidigare utfört helgenomsekvensering (WGS) och HLA-genotypning i storskaliga associationsstudier. Anmärkningsvärt identifierade forskarnas WGS-baserade undersökningar genetisk susceptibilitet för antityreoidealäkemedelsinducerad agranulocytos genom en rigorös tvåstegsanalysstrategi. Sammantaget möjliggör denna integrerade studiedesign samtidig utvärdering av genomisk initiering och progression tillsammans med urinärt exosomalt peptiduttryck, vilket positionerar detta arbete för att klargöra mekanistiska relationer mellan tumörmolekylärbiologi och icke-invasiva biomarkörer för sjukdomsövervakning och precisionsstyrd behandling.