Integrace genomiky nádorů a proteomiky močových exosomů k vytvoření vícevrstvého rámce biomarkerů pro včasnou stratifikaci rizika a post-terapeutický dohled u pacientů s čerstvou diagnózou karcinomu štítné žlázy

Tato prospektivní klinická studie je navržena k zařazení pacientů ve věku 18 až 80 let s nově diagnostikovaným papilárním karcinomem štítné žlázy (PTC) nebo vysoce suspektními folikulárními neoplasmy, včetně lézí s potenciálem pro špatně diferencovaný karcinom štítné žlázy. Způsobilí pacienti museli podstoupit jemnou jehlovou aspirační cytologii (FNAC) jako součást diagnostického vyšetření. (Toto je rutinní vyšetření, kterým by subjekt prošel bez ohledu na účast ve studii.) Cytologické zprávy a následná komplexní chirurgicko-patologická hodnocení budou systematicky dokumentovány a přezkoumány, aby byla zajištěna přesná klasifikace každého případu. Během prvních dvou let realizace studie plánujeme zařadit 100 po sobě jdoucích pacientů s neléčeným nebo "čerstvým" karcinomem štítné žlázy. U osob podstupujících chirurgický výkon bude profilování exosomálních peptidů v moči provedeno ve dvou standardizovaných časových bodech: (1) předoperačně a (2) čtyři týdny po tyreoidektomii, což umožní posouzení dynamiky perioperativních biomarkerů. Chirurgická léčba – u většiny případů se předpokládá totální tyreoidektomie – bude provedena podle standardního klinického úsudku zkušenými endokrinními chirurgy. Pooperační patologické hodnocení bude zahrnovat pečlivou charakterizaci tumorové morfologie, invazních vzorců a molekulárních znaků na základě finálních histopatologických zpráv. Paralelně tato studie zahrnuje robustní genomické vyšetření tumoru podpořené našimi dříve vyvinutými a validovanými platformami sekvenování nové generace (NGS). V rámci předchozího financování Národní radou pro vědu a technologii (NSTC) vyšetřovatelé vytvořili panel genů specifický pro karcinom štítné žlázy založený na DNA, cílící na 50 klíčových onkogenních driverů, a doplňkový panel fúzí založený na RNA pokrývající 19 klinicky relevantních genových přestaveb. Tyto panely byly sestaveny prostřednictvím komplexního dotazování mezinárodně uznávaných genomických repozitářů rakoviny, založeného na dříve úspěšně dokončeném profilování somatických variant u 51 pacientů s metastatickým karcinomem štítné žlázy, včetně 29 analýz párových primárních a metastatických tumorů, což prokazuje silnou schopnost pro vysokorozlišující srovnávací genomiku rakoviny. Dále vyšetřovatelé prokázali technickou způsobilost v analýze polyguaninových markerů pro fylogenetickou inferenci evoluce tumoru a dříve provedli sekvenování celého genomu (WGS) a genotypování HLA ve velkých asociačních studiích. Pozoruhodně, WGS-bazovaná vyšetření vyšetřovatelů identifikovala genetickou predispozici k agranulocytóze indukované tyreostatiky prostřednictvím rigorózní dvoufázové analytické strategie. Celkově tento integrovaný design studie umožňuje simultánní hodnocení genomické iniciace a progrese spolu s expresí exosomálních peptidů v moči, což tuto práci staví do pozice k objasnění mechanistických vztahů mezi molekulární biologií tumoru a neinvazivními biomarkery pro monitorování onemocnění a precizně vedenou léčbu.