RNASARC - 用于检测 NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 基因融合的具有复杂基因组特征的软组织肉瘤的分子筛查程序。 (RNASARC)
2024年8月23日 更新者：Centre Leon Berard
该试验是一项多中心、前瞻性队列研究，旨在描述具有复杂基因组图谱的软组织肉瘤 (STS) 的分子图谱，特别是评估 NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 基因融合的发生率，以指导此类患者通过正在进行的适当时使用 entrectinib 进行临床试验。
探索性翻译程序也与该试验相关联，以分析免疫基因表达。
研究概览
详细说明
在签署知情同意书 (ICF) 后，将为所有入组患者收集福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 肿瘤块（存档或专门的新鲜收集的肿瘤活检），并集中在莱昂中心的生物资源平台贝拉尔。
在接待处，将进行中央病理检查以确认材料的质量和数量是否可接受：所有肿瘤样本应至少包含 20%（最好是 30%）的肿瘤细胞，并且表面积 > 5 mm2（最佳条件是表面积为 5-25 平方毫米）。 如果肿瘤样本的质量和数量不符合标准，则患者将被视为“筛查失败”。 如果符合标准，将确认纳入并启动分子筛选以及转化研究计划。
检测 NTRK1、2、3、ROS1 或 ALK 基因重排的分子筛选将分两步进行，包括：
- 首先，免疫组织化学 (IHC) 检测 TRKA/B/C（由 NTRK1、2、3 编码）、ROS1 或 ALK 的蛋白表达。 只有阳性 IHC 样本才会继续进行第二步分子筛选。 IHC 阴性的患者不需要进一步的 NTRK、ROS 或 ALK 基因重排检测；然而，肿瘤样本将进一步用于第 VII 节中介绍的其他转化研究计划，并将收集有关这些患者临床演变的数据
- 其次，将对阳性 IHC 样本进行 RNAseq 分析，以检测 NTRK1、NTRK2、NTRK3、ROS1 或 ALK 基因中的特定重排。
- 分子分析后，筛选结果将立即（在 24 小时内）传达给研究人员、GSF-GETO 网络和 Ignyta 代表，以便推荐具有 NTRK1、NTRK2、NTRK3、ROS1 或 ALK 重排的患者进行正式资格确定，以决定是否有可能参加临床试验，特别是 entrectinib（STARTRK-2；NCT02568267）。
研究类型
介入性
注册 (实际的)
376
阶段
- 不适用
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
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Clermont-Ferrand、法国、63011
- Centre Jean Perrin
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Dijon、法国、21079
- Centre Georges-Francois Leclerc
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Lille、法国、59000
- Centre Oscar Lambret
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Limoges、法国
- CHU de Limoges Hopital Dupuytren
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Lyon、法国、69008
- Centre Leon Berard
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Nancy、法国、54511 cedex
- Institut de Cancérologie de Lorraine
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Nice、法国
- Centre Antoine Lacassagne
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Paris、法国
- Institut Gustave Roussy
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Rennes、法国
- Centre Eugene Marquis
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Saint-Priest-en-Jarez、法国
- Institut de Cancérologie de la Loire Lucien Neuwirth
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
12年 及以上 (孩子、成人、年长者)
接受健康志愿者
不
描述
纳入标准：
- I1。在签署知情同意书 (ICF) 时年满 12 岁的男性或女性患者。
- I2。具有复杂基因组学的晚期/转移性疾病 STS 的组织学确诊（例如，平滑肌肉瘤 [LMS]、未分化多形性肉瘤 [UPS]、多形性脂肪肉瘤/横纹肌肉瘤 [P-LPS/P-RMS]、血管肉瘤、恶性周围神经鞘瘤 [MPNST ]、粘液纤维肉瘤、纤维肉瘤）。
- I3。具有代表性的福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 肿瘤样本的可用性，以及相应的苏木精和伊红染色载玻片和病理报告：
肿瘤档案块（小于 3 年）或从医学成像可见且可经皮取样的直径至少为 10 毫米的可及病变进行的专用新鲜从头活检。
- I4。肿瘤样本符合中央病理审查确认的质量/数量控制 (QC) 标准：
至少 20%（最好是 30%）的肿瘤细胞和样本大小表面积 > 5mm2（最好是 5-25mm2）。
- I5。患者（和法定监护人，如果未独立的未成年人）应该在执行任何协议特定程序之前理解、签署书面自愿知情同意书并注明日期。 患者应该能够并愿意按照协议遵守研究程序。
- I6。患者必须有医疗保险。
非入选标准：
- NI1。肿瘤样本不可评估的患者。
- NI2。先前使用已批准或正在研究的 TRK、ROS1 或 ALK 抑制剂进行治疗。 允许任何其他先前的抗癌治疗，没有先前治疗线数的限制。
- NI3。孕妇或哺乳期患者。
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
- 主要用途：放映
- 分配：不适用
- 介入模型：单组作业
- 屏蔽：无（打开标签）
武器和干预
参与者组/臂 |
干预/治疗 |
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实验性的：NTRK、ROS和ALK分子筛选
检测 NTRK1、2、3、ROS 或 ALK 基因重排的分子筛选将分两步进行，包括：
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FFPE 肿瘤块（存档或专门的新鲜收集的肿瘤活检）将为所有登记的患者收集并集中。 用于转化研究的血液采样（可选）（2*10mL EDTA） |
研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 基因融合的患者比例（95% 置信区间）
大体时间：24个月
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这种分子预筛选将允许在患者的治疗肿瘤学家判断合适时，指导符合条件的携带 NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 融合的肉瘤患者进行 entrectinib 的临床试验。
根据分子改变，可以设想其他治疗选择。
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24个月
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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具有复杂基因组学的 STS 的每个组织学亚型的 NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 基因融合患者的比例
大体时间：自首次纳入以来 24 个月
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将具有 NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 基因融合的 STS 患者划分为不同的 STS 亚型。
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自首次纳入以来 24 个月
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NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 基因融合患者与无 NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 基因融合患者的临床特征。
大体时间：自首次纳入以来 24 个月
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定量变量的比较将酌情通过学生 t 检验或 Wilcoxon-Mann 和 Whitney 检验进行评估。
定性变量的比较将酌情使用 X2 检验或 Fisher 精确检验进行评估。
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自首次纳入以来 24 个月
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自纳入以来开始抗癌治疗。
大体时间：36个月
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自纳入 NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 基因融合患者和无 NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 基因融合患者以来开始的抗癌治疗。
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36个月
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总生存期（OS）
大体时间：36个月
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NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 基因融合患者和无 NTRK1/2/3、ROS1 或 ALK 基因融合患者的总生存期 (OS)。
它将从 STS 诊断之日到任何原因导致的死亡之日计算。
在分析时还活着的患者将在最后一次联系之日被删失。
OS 将使用 Kaplan-Meier 方法进行估算，并将根据中位数以及相关的 2 侧 95% 置信区间 (CI) 进行描述
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36个月
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
- Shaw AT, Ou SH, Bang YJ, Camidge DR, Solomon BJ, Salgia R, Riely GJ, Varella-Garcia M, Shapiro GI, Costa DB, Doebele RC, Le LP, Zheng Z, Tan W, Stephenson P, Shreeve SM, Tye LM, Christensen JG, Wilner KD, Clark JW, Iafrate AJ. Crizotinib in ROS1-rearranged non-small-cell lung cancer. N Engl J Med. 2014 Nov 20;371(21):1963-71. doi: 10.1056/NEJMoa1406766. Epub 2014 Sep 27.
- Jain S, Xu R, Prieto VG, Lee P. Molecular classification of soft tissue sarcomas and its clinical applications. Int J Clin Exp Pathol. 2010 Apr 23;3(4):416-28.
- Shaw AT, Kim DW, Mehra R, Tan DS, Felip E, Chow LQ, Camidge DR, Vansteenkiste J, Sharma S, De Pas T, Riely GJ, Solomon BJ, Wolf J, Thomas M, Schuler M, Liu G, Santoro A, Lau YY, Goldwasser M, Boral AL, Engelman JA. Ceritinib in ALK-rearranged non-small-cell lung cancer. N Engl J Med. 2014 Mar 27;370(13):1189-97. doi: 10.1056/NEJMoa1311107.
- Fleitas T, Ibarrola-Villava M, Ribas G, Cervantes A. MassARRAY determination of somatic oncogenic mutations in solid tumors: Moving forward to personalized medicine. Cancer Treat Rev. 2016 Sep;49:57-64. doi: 10.1016/j.ctrv.2016.07.007. Epub 2016 Jul 29.
- Schmidt KT, Chau CH, Price DK, Figg WD. Precision Oncology Medicine: The Clinical Relevance of Patient-Specific Biomarkers Used to Optimize Cancer Treatment. J Clin Pharmacol. 2016 Dec;56(12):1484-1499. doi: 10.1002/jcph.765. Epub 2016 Jun 17.
- Nakagawara A. Trk receptor tyrosine kinases: a bridge between cancer and neural development. Cancer Lett. 2001 Aug 28;169(2):107-14. doi: 10.1016/s0304-3835(01)00530-4.
- Pulciani S, Santos E, Lauver AV, Long LK, Aaronson SA, Barbacid M. Oncogenes in solid human tumours. Nature. 1982 Dec 9;300(5892):539-42. doi: 10.1038/300539a0. No abstract available.
- Martin-Zanca D, Hughes SH, Barbacid M. A human oncogene formed by the fusion of truncated tropomyosin and protein tyrosine kinase sequences. Nature. 1986 Feb 27-Mar 5;319(6056):743-8. doi: 10.1038/319743a0.
- Vaishnavi A, Le AT, Doebele RC. TRKing down an old oncogene in a new era of targeted therapy. Cancer Discov. 2015 Jan;5(1):25-34. doi: 10.1158/2159-8290.CD-14-0765. Epub 2014 Dec 19.
- Doebele RC, Davis LE, Vaishnavi A, Le AT, Estrada-Bernal A, Keysar S, Jimeno A, Varella-Garcia M, Aisner DL, Li Y, Stephens PJ, Morosini D, Tuch BB, Fernandes M, Nanda N, Low JA. An Oncogenic NTRK Fusion in a Patient with Soft-Tissue Sarcoma with Response to the Tropomyosin-Related Kinase Inhibitor LOXO-101. Cancer Discov. 2015 Oct;5(10):1049-57. doi: 10.1158/2159-8290.CD-15-0443. Epub 2015 Jul 27.
- Judson I, Verweij J, Gelderblom H, Hartmann JT, Schoffski P, Blay JY, Kerst JM, Sufliarsky J, Whelan J, Hohenberger P, Krarup-Hansen A, Alcindor T, Marreaud S, Litiere S, Hermans C, Fisher C, Hogendoorn PC, dei Tos AP, van der Graaf WT; European Organisation and Treatment of Cancer Soft Tissue and Bone Sarcoma Group. Doxorubicin alone versus intensified doxorubicin plus ifosfamide for first-line treatment of advanced or metastatic soft-tissue sarcoma: a randomised controlled phase 3 trial. Lancet Oncol. 2014 Apr;15(4):415-23. doi: 10.1016/S1470-2045(14)70063-4. Epub 2014 Mar 5.
- Ryan CW, Merimsky O, Agulnik M, Blay JY, Schuetze SM, Van Tine BA, Jones RL, Elias AD, Choy E, Alcindor T, Keedy VL, Reed DR, Taub RN, Italiano A, Garcia Del Muro X, Judson IR, Buck JY, Lebel F, Lewis JJ, Maki RG, Schoffski P. PICASSO III: A Phase III, Placebo-Controlled Study of Doxorubicin With or Without Palifosfamide in Patients With Metastatic Soft Tissue Sarcoma. J Clin Oncol. 2016 Nov 10;34(32):3898-3905. doi: 10.1200/JCO.2016.67.6684. Epub 2016 Sep 30.
- Tap WD, Jones RL, Van Tine BA, Chmielowski B, Elias AD, Adkins D, Agulnik M, Cooney MM, Livingston MB, Pennock G, Hameed MR, Shah GD, Qin A, Shahir A, Cronier DM, Ilaria R Jr, Conti I, Cosaert J, Schwartz GK. Olaratumab and doxorubicin versus doxorubicin alone for treatment of soft-tissue sarcoma: an open-label phase 1b and randomised phase 2 trial. Lancet. 2016 Jul 30;388(10043):488-97. doi: 10.1016/S0140-6736(16)30587-6. Epub 2016 Jun 9. Erratum In: Lancet. 2016 Jul 30;388(10043):464. doi: 10.1016/S0140-6736(16)31156-4.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2018年2月15日
初级完成 (估计的)
2024年12月15日
研究完成 (估计的)
2025年12月15日
研究注册日期
首次提交
2017年12月4日
首先提交符合 QC 标准的
2017年12月12日
首次发布 (实际的)
2017年12月18日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2024年8月26日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2024年8月23日
最后验证
2024年8月1日
更多信息
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