RNASARC - Pehmytkudossarkoomien molekyyliseulontaohjelma, jossa on monimutkainen genominen profiili, NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-geenifuusioiden havaitsemiseksi. (RNASARC)
perjantai 23. elokuuta 2024 päivittänyt: Centre Leon Berard
Tämä tutkimus on monikeskus, prospektiivinen kohorttitutkimus, jonka tarkoituksena on kuvata pehmytkudossarkooman (STS) molekyyliprofiileja, joilla on monimutkaisia genomiprofiileja, erityisesti NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-geenifuusioiden ilmaantuvuuden arvioimiseksi tällaisten potilaiden ohjaamiseksi meneillään olevan tutkimuksen kautta. kliininen tutkimus entrektinibillä tarvittaessa.
Tutkiva translaatioohjelma korreloi myös tähän tutkimukseen immuunigeenin ilmentymisen analysoimiseksi.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Aktiivinen, ei rekrytointi
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Ilmoitettu suostumuslomakkeen (ICF) allekirjoituksen jälkeen formaliinilla kiinnitetty ja parafiiniin upotettu (FFPE) kasvainlohko (arkisto tai juuri kerätty tuumoribiopsia) kerätään kaikilta potilailta ja keskitetään Centre Léonin biologisten resurssien alustalle. Bérard.
Vastaanotossa tehdään keskuspatologinen tarkastus sen varmistamiseksi, että materiaalin laatu ja määrä ovat hyväksyttäviä: kaikissa kasvainnäytteessä tulee olla vähintään 20 % (mieluiten 30 %) kasvainsoluista ja sen pinta-alan on oltava > 5 mm2 (optimaalinen tila on pinta-ala 5-25 mm2). Jos kasvainnäytteen laatu ja määrä eivät täytä standardeja, potilaita pidetään "seulonnan epäonnistuneena". Jos standardit täyttyvät, sisällyttäminen vahvistetaan ja molekyyliseulonta aloitetaan sekä translaatiotutkimusohjelma.
Molekyyliseulonta NTRK1, 2,3, ROS1 tai ALK geenien uudelleenjärjestelyjen havaitsemiseksi on kaksivaiheinen prosessi, joka koostuu:
- Ensin immunohistokemian (IHC) määritys TRKA/B/C:n (koodaama NTRK1,2,3), ROS1:n tai ALK:n proteiiniekspression havaitsemiseksi. Vain positiiviset IHC-näytteet jatkavat molekyyliseulonnan toista vaihetta. Negatiiviset IHC-potilaat eivät vaadi muita NTRK-, ROS- tai ALK-geenien uudelleenjärjestelytestejä; kasvainnäytteitä käytetään kuitenkin edelleen osassa VII esitettyyn translaatiotutkimusohjelmaan ja kerätään tietoja näiden potilaiden kliinisestä kehityksestä.
- Toiseksi RNAseq-analyysi suoritetaan positiivisille IHC-näytteille spesifisten uudelleenjärjestelyjen havaitsemiseksi NTRK1-, NTRK2-, NTRK3-, ROS1- tai ALK-geeneissä.
- Molekyylianalyysien jälkeen seulontatulokset välitetään välittömästi (24 tunnin sisällä) tutkijoille, GSF-GETO Networkin ja Ignytan edustajille, jotta potilaille, joilla on NTRK1, NTRK2, NTRK3, ROS1 tai ALK, voidaan suositella uudelleenjärjestelyjä muodollisen kelpoisuuden määrittämiseksi mahdolliseen ilmoittautumiseen. kliininen tutkimus erityisesti entrektinibillä (STARTRK-2; NCT02568267).
Opintotyyppi
Interventio
Ilmoittautuminen (Todellinen)
376
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
-
Clermont-Ferrand, Ranska, 63011
- Centre Jean Perrin
-
Dijon, Ranska, 21079
- Centre Georges-Francois Leclerc
-
Lille, Ranska, 59000
- Centre Oscar Lambret
-
Limoges, Ranska
- CHU de Limoges Hopital Dupuytren
-
Lyon, Ranska, 69008
- Centre léon bérard
-
Nancy, Ranska, 54511 cedex
- Institut de Cancerologie de Lorraine
-
Nice, Ranska
- Centre Antoine Lacassagne
-
Paris, Ranska
- Institut Gustave Roussy
-
Rennes, Ranska
- Centre Eugène Marquis
-
Saint-Priest-en-Jarez, Ranska
- Institut de Cancérologie de la Loire Lucien Neuwirth
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
12 vuotta ja vanhemmat (Lapsi, Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- I1. Mies- tai naispotilaat, joiden ikä on ≥ 12 vuotta tietoisen suostumuslomakkeen (ICF) allekirjoitushetkellä.
- I2. Histologisesti vahvistettu diagnoosi pitkälle edenneestä/metastaattisesta STS-sairaudesta, jossa on monimutkainen genomiikka (esim. leiomyosarkooma [LMS], erilaistumaton pleomorfinen sarkooma [UPS], pleomorfinen liposarkooma/rabdomyosarkooma [P-LPS/P-RMS], neuronaalinen syöpäkasvain [perifeerinen hermoston angiosarkooma ], myksofibrosarkooma, fibrosarkooma).
- I3. Edustavan formaliinilla kiinnitetyn, parafiiniin upotetun (FFPE) kasvainnäytteen, jossa on vastaava hematoksyliini- ja eosiinivärjätyt objektilasit ja patologinen raportti, saatavuus:
joko kasvainarkiston lohko (alle 3 vuotta vanha) tai juuri kerätty de novo -biopsia, joka on tehty yhdestä helposti saatavilla olevasta vauriosta, joka näkyy lääketieteellisellä kuvantamisella ja joka on läpimitaltaan vähintään 10 mm:n perkutaanista näytteenottoa varten.
- I4. Kasvainnäyte, joka täyttää seuraavat laatu/määräkontrollin (QC) kriteerit, jotka vahvistettiin keskuspatologisessa tarkastelussa:
vähintään 20 % (ihanteellisesti 30 %) kasvainsoluista ja näytteen koko pinta-ala > 5 mm2 (ihanteellisesti 5-25 mm2).
- I5. Potilaan (ja laillisten huoltajien, jos ei ole emansipoitu alaikäinen) tulee ymmärtää, allekirjoittaa ja päivätää kirjallinen vapaaehtoisesti annettu suostumuslomake ennen protokollakohtaisten toimenpiteiden suorittamista. Potilaan tulee kyetä ja haluta noudattaa protokollan mukaisia tutkimusmenetelmiä.
- I6. Potilaalla tulee olla sairausvakuutus.
Ei sisällyttämiskriteerit:
- NI1. Potilaat, joiden kasvainnäyte ei ole arvioitavissa.
- NI2. Aiempi hoito hyväksytyillä tai tutkituilla TRK-, ROS1- tai ALK-estäjillä. Kaikki muu aiempi syövänvastainen hoito on sallittu ilman aikaisempien hoitolinjojen määrää.
- NI3. Raskaana olevat tai imettävät potilaat.
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Seulonta
- Jako: Ei käytössä
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / Arm |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Kokeellinen: NTRK-, ROS- ja ALK-molekyyliseulonta
Molekyyliseulonta NTRK1-, 2-, 3-, ROS- tai ALK-geenien uudelleenjärjestelyjen havaitsemiseksi on kaksivaiheinen prosessi, joka koostuu:
|
FFPE-kasvainlohko (arkisto tai juuri kerätty tuumoribiopsia) kerätään kaikilta ilmoittautuneilta potilailta ja keskitetään. Verinäytteet translaatiotutkimusta varten (valinnainen) (2 * 10 ml EDTA) |
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
potilaiden osuus, joilla on NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-geenifuusio (95 %:n luottamusväli)
Aikaikkuna: 24 kuukautta
|
Tällainen molekyylien esiseulonta mahdollistaa kelpoisten potilaiden, joilla on sarkooma, jossa on NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-fuusio, ohjaamisen kliiniseen tutkimukseen entrektinibillä, kun potilasta hoitava onkologi katsoo sen sopivaksi.
Molekyylimuutoksista riippuen voidaan harkita muita terapeuttisia vaihtoehtoja.
|
24 kuukautta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Potilaiden, joilla on NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-geenifuusio, osuus STS:n histologisista alatyypeistä, joilla on monimutkainen genomiikka
Aikaikkuna: 24 kuukautta ensimmäisestä sisällyttämisestä
|
STS-potilaiden jakaminen NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-geenifuusioiden kanssa eri STS-alatyypeissä.
|
24 kuukautta ensimmäisestä sisällyttämisestä
|
|
Potilaiden, joilla on NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-geenifuusio, kliiniset ominaisuudet verrattuna potilaisiin, joilla ei ole NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-geenifuusiota.
Aikaikkuna: 24 kuukautta ensimmäisestä sisällyttämisestä
|
Kvantitatiivisten muuttujien vertailut arvioidaan Studentin t-testillä tai Wilcoxon-Mannin ja Whitneyn testillä tapauksen mukaan.
Laadullisten muuttujien vertailut arvioidaan X2-testillä tai Fisherin eksaktitestillä tapauksen mukaan.
|
24 kuukautta ensimmäisestä sisällyttämisestä
|
|
sisällyttämisen jälkeen aloitettuihin syövän vastaisiin hoitoihin.
Aikaikkuna: 36 kuukautta
|
syövän vastaiset hoidot, jotka aloitettiin sisällyttämisen jälkeen potilailla, joilla on NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-geenifuusio, ja potilailla, joilla ei ole NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-geenifuusiota.
|
36 kuukautta
|
|
Kokonaiseloonjääminen (OS)
Aikaikkuna: 36 kuukautta
|
Kokonaiseloonjääminen (OS) potilailla, joilla on NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-geenifuusio, ja potilailla, joilla ei ole NTRK1/2/3-, ROS1- tai ALK-geenifuusiota.
Se mitataan STS-diagnoosin päivämäärästä mistä tahansa syystä johtuvaan kuolemaan.
Analyysin aikana elossa olevat potilaat sensuroidaan viimeisen yhteydenottopäivänä.
Käyttöjärjestelmä arvioidaan Kaplan-Meier-menetelmällä, ja se kuvataan mediaanien ja siihen liittyvän kaksipuolisen 95 %:n luottamusvälin (CI) avulla.
|
36 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Armelle DUFRESNE, MD, Centre léon bérard
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Shaw AT, Ou SH, Bang YJ, Camidge DR, Solomon BJ, Salgia R, Riely GJ, Varella-Garcia M, Shapiro GI, Costa DB, Doebele RC, Le LP, Zheng Z, Tan W, Stephenson P, Shreeve SM, Tye LM, Christensen JG, Wilner KD, Clark JW, Iafrate AJ. Crizotinib in ROS1-rearranged non-small-cell lung cancer. N Engl J Med. 2014 Nov 20;371(21):1963-71. doi: 10.1056/NEJMoa1406766. Epub 2014 Sep 27.
- Jain S, Xu R, Prieto VG, Lee P. Molecular classification of soft tissue sarcomas and its clinical applications. Int J Clin Exp Pathol. 2010 Apr 23;3(4):416-28.
- Shaw AT, Kim DW, Mehra R, Tan DS, Felip E, Chow LQ, Camidge DR, Vansteenkiste J, Sharma S, De Pas T, Riely GJ, Solomon BJ, Wolf J, Thomas M, Schuler M, Liu G, Santoro A, Lau YY, Goldwasser M, Boral AL, Engelman JA. Ceritinib in ALK-rearranged non-small-cell lung cancer. N Engl J Med. 2014 Mar 27;370(13):1189-97. doi: 10.1056/NEJMoa1311107.
- Fleitas T, Ibarrola-Villava M, Ribas G, Cervantes A. MassARRAY determination of somatic oncogenic mutations in solid tumors: Moving forward to personalized medicine. Cancer Treat Rev. 2016 Sep;49:57-64. doi: 10.1016/j.ctrv.2016.07.007. Epub 2016 Jul 29.
- Schmidt KT, Chau CH, Price DK, Figg WD. Precision Oncology Medicine: The Clinical Relevance of Patient-Specific Biomarkers Used to Optimize Cancer Treatment. J Clin Pharmacol. 2016 Dec;56(12):1484-1499. doi: 10.1002/jcph.765. Epub 2016 Jun 17.
- Nakagawara A. Trk receptor tyrosine kinases: a bridge between cancer and neural development. Cancer Lett. 2001 Aug 28;169(2):107-14. doi: 10.1016/s0304-3835(01)00530-4.
- Pulciani S, Santos E, Lauver AV, Long LK, Aaronson SA, Barbacid M. Oncogenes in solid human tumours. Nature. 1982 Dec 9;300(5892):539-42. doi: 10.1038/300539a0. No abstract available.
- Martin-Zanca D, Hughes SH, Barbacid M. A human oncogene formed by the fusion of truncated tropomyosin and protein tyrosine kinase sequences. Nature. 1986 Feb 27-Mar 5;319(6056):743-8. doi: 10.1038/319743a0.
- Vaishnavi A, Le AT, Doebele RC. TRKing down an old oncogene in a new era of targeted therapy. Cancer Discov. 2015 Jan;5(1):25-34. doi: 10.1158/2159-8290.CD-14-0765. Epub 2014 Dec 19.
- Doebele RC, Davis LE, Vaishnavi A, Le AT, Estrada-Bernal A, Keysar S, Jimeno A, Varella-Garcia M, Aisner DL, Li Y, Stephens PJ, Morosini D, Tuch BB, Fernandes M, Nanda N, Low JA. An Oncogenic NTRK Fusion in a Patient with Soft-Tissue Sarcoma with Response to the Tropomyosin-Related Kinase Inhibitor LOXO-101. Cancer Discov. 2015 Oct;5(10):1049-57. doi: 10.1158/2159-8290.CD-15-0443. Epub 2015 Jul 27.
- Judson I, Verweij J, Gelderblom H, Hartmann JT, Schoffski P, Blay JY, Kerst JM, Sufliarsky J, Whelan J, Hohenberger P, Krarup-Hansen A, Alcindor T, Marreaud S, Litiere S, Hermans C, Fisher C, Hogendoorn PC, dei Tos AP, van der Graaf WT; European Organisation and Treatment of Cancer Soft Tissue and Bone Sarcoma Group. Doxorubicin alone versus intensified doxorubicin plus ifosfamide for first-line treatment of advanced or metastatic soft-tissue sarcoma: a randomised controlled phase 3 trial. Lancet Oncol. 2014 Apr;15(4):415-23. doi: 10.1016/S1470-2045(14)70063-4. Epub 2014 Mar 5.
- Ryan CW, Merimsky O, Agulnik M, Blay JY, Schuetze SM, Van Tine BA, Jones RL, Elias AD, Choy E, Alcindor T, Keedy VL, Reed DR, Taub RN, Italiano A, Garcia Del Muro X, Judson IR, Buck JY, Lebel F, Lewis JJ, Maki RG, Schoffski P. PICASSO III: A Phase III, Placebo-Controlled Study of Doxorubicin With or Without Palifosfamide in Patients With Metastatic Soft Tissue Sarcoma. J Clin Oncol. 2016 Nov 10;34(32):3898-3905. doi: 10.1200/JCO.2016.67.6684. Epub 2016 Sep 30.
- Tap WD, Jones RL, Van Tine BA, Chmielowski B, Elias AD, Adkins D, Agulnik M, Cooney MM, Livingston MB, Pennock G, Hameed MR, Shah GD, Qin A, Shahir A, Cronier DM, Ilaria R Jr, Conti I, Cosaert J, Schwartz GK. Olaratumab and doxorubicin versus doxorubicin alone for treatment of soft-tissue sarcoma: an open-label phase 1b and randomised phase 2 trial. Lancet. 2016 Jul 30;388(10043):488-97. doi: 10.1016/S0140-6736(16)30587-6. Epub 2016 Jun 9. Erratum In: Lancet. 2016 Jul 30;388(10043):464. doi: 10.1016/S0140-6736(16)31156-4.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Torstai 15. helmikuuta 2018
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Sunnuntai 15. joulukuuta 2024
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Maanantai 15. joulukuuta 2025
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Maanantai 4. joulukuuta 2017
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 12. joulukuuta 2017
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Maanantai 18. joulukuuta 2017
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Maanantai 26. elokuuta 2024
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Perjantai 23. elokuuta 2024
Viimeksi vahvistettu
Torstai 1. elokuuta 2024
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- ET17-080 (RNASARC)
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Pehmytkudossarkooma
-
University GhentOsteology FoundationAktiivinen, ei rekrytointi
Kliiniset tutkimukset Veri- ja kasvainnäytteet
-
Carlos Simon FoundationRekrytointiPreeklampsiaEspanja