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重症监护病房人群的基因组测序 (PISCES)

2026年1月7日 更新者:Jerry Vockley, MD, PhD
本研究的目的是了解全基因组测序 (WGS) 的使用如何能够提高重症监护病房患者的诊断速度。 这不是对新设备、测试或技术的评估。 该项目是与护理测试标准相比,对该技术在临床护理中的效用进行的调查。 与护理测试标准相比,该研究将着眼于更快地诊断患者的能力(诊断时间和测试效率)。 该研究还将研究 WGS 对患者结果和临床护理成本的影响。

研究概览

详细说明

这是一项观察性研究,旨在了解使用全基因组测序 (WGS) 是否可以提高诊断速度,以及如何改变重症监护新生儿的临床管理。 该项目在 CLIA 认证的设施中使用经批准的基因组测序方法。

  1. 符合条件且父母同意该研究的新生儿受试者将接受血液样本,这些样本将被送去进行 WGS 和生物信息学分析,首先用 1722 个目标基因组进行过滤,这些基因最有可能在生命的第一年引起遗传疾病,然后如果使用 1722 基因面板过滤器没有确定明显的诊断,则使用整个外显子组过滤器。 测试在 CLIA 认证的实验室完成。 与儿童临床特征相关的基因中的致病性、可能致病性和不确定意义的变异将返回给护理团队和遗传咨询环境中的父母,以用于有关管理的临床决策。 将报告添加到新生儿 EMR。 同意将包括允许访问住院的财务记录,以将费用和住院时间与匹配的控制进行比较。
  2. 同意为三重分析目的进行研究的已识别新生儿的父母将收集样本,这些样本将与孩子同时进行分析,以帮助确定基因组测序中变异的致病性。 ACMG 59 中的致病性和可能致病性的次要发现只有在父母选择了解这些结果并且在孩子身上被识别出来的情况下,才会在遗传咨询的情况下向父母报告。
  3. 参与新生儿的兄弟姐妹,如果需要解释新生儿的基因研究,将收集样本用于基因分析。 在遗传咨询的背景下,将向父母报告儿童期发病疾病的致病性和可能致病性结果。
  4. 将确定历史对照并将其与研究参与者相匹配。 历史对照将包括 ICU 中的婴儿在过去 24 个月内首次入院期间接受遗传学咨询。 研究参与者和匹配对照之间的匹配将使用倾向得分进行。 我们将逻辑回归模型拟合到组合的治疗组和对照组,然后将使用最近邻匹配来创建匹配对。 匹配将有助于减少偏差并增加检测真实效果的能力。 这些控件将仅用于财务和逗留时间分析;不会对该队列进行基因检测。

研究类型

介入性

注册 (估计的)

400

阶段

  • 不适用

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

    • Pennsylvania
      • Pittsburgh、Pennsylvania、美国、15224
        • UPMC Children's Hospital of Pittsburgh

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

不超过 2年 (孩子)

接受健康志愿者

不

描述

纳入标准:

  • 新生儿:为了接近参与,新生儿必须满足以下所有标准:

    1. 大于 24 周胎龄
    2. 出生体重大于600克
    3. 入住 UPMC 儿童医院 (CHP) 和/或 Magee 妇女医院的重症监护室
    4. 基于体征、症状和实验室值的遗传疾病的可能性触发临床护理团队进行正式的临床医学遗传学咨询。
    5. 由 PI 或参加的共同研究者分类,并根据患者特定的临床问题优先考虑引入这项研究
    6. 父母/监护人的书面知情同意书
  • 父母:符合上述纳入标准并同意参加研究的新生儿的父母。
  • 兄弟姐妹:符合上述纳入标准并同意参加研究的新生儿的兄弟姐妹。 只有当他们的参与被确定为对准确解释新生儿的基因研究至关重要时,才会招募兄弟姐妹。
  • 历史对照:在过去 24 个月内接受过医学遗传学评估并且符合倾向得分匹配定义的匹配对照标准的个体。

排除标准:

  • 新生儿:符合以下任何标准的个体将被排除在参与本研究之外:

    1. 具有已知的病因学诊断(例如 产前检查)
    2. 存在与产前检测(例如,胎儿畸形)中检测到的染色体异常相关的主要先天性异常(肾脏、心脏、肝脏、神经或肺部畸形) 超声、基因检测)
    3. 出生后出于任何其他原因而不是触发研究的遗传学咨询发送的测序
    4. 存在有记录的显着先天性感染(例如 先天性巨细胞病毒)
  • 父母:

    1. 不是已识别新生儿的亲生父母
    2. 不排除家长参与。 但是,如果父母未满 18 岁,则将要求这些人同意该研究,并且将要求他们的父母为未成年父母的参与提供许可/同意
    3. 之前进行过基因检测并不排除父母参与本研究。
  • 兄弟姐妹:

    1. 不是符合纳入标准的新生儿的亲生兄弟姐妹
    2. 不需要准确解释新生儿结果
    3. 之前进行过基因检测并不排除兄弟姐妹参与本研究。
  • 历史对照:在过去 24 个月内未出现和/或不符合倾向得分匹配定义的匹配对照标准。 这种匹配的一部分要求历史对照根据年龄与研究参与者匹配,因此他们将根据所有匹配标准进行选择,如果他们不符合标准,包括年龄,将被排除在外。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

  • 主要用途:诊断
  • 分配:不适用
  • 介入模型:单组作业
  • 屏蔽:无(打开标签)

武器和干预

参与者组/臂
干预/治疗
其他:新生儿全基因组检测
符合条件且父母同意研究的新生儿受试者将接受血液采样,将被送去进行全基因组测序和生物信息学分析,首先筛选出 1722 个最有可能在生命的第一年引起遗传疾病的基因组,然后如果使用 1722 基因面板过滤器没有确定明显的诊断,则使用整个外显子组过滤器。

新生儿将接受全基因组测序,并用一组有针对性的基因进行分析,这些基因可能在出生后的第一年引起遗传疾病。 如果未确定诊断,将使用全外显子组过滤器分析测序数据。 在 CLIA 认证的实验室中进行。 与表型相关的基因中的致病性、可能致病性和 VUS 将返回给护理团队和家庭。

为了与孩子进行三重分析,父母将被登记,以协助确定基因组测序中变异的致病性。 致病性和可能致病性的发现将在遗传咨询的情况下报告给父母。

只有在认为必要时,兄弟姐妹才会被登记并收集样本用于基因分析。 结果将在遗传咨询的情况下报告给父母。

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
确诊
大体时间:长达 4 年
与护理标准 (SOC) 或历史对照 (HC) 的结果相比,使用 WGS 检测到的新生儿参与者的分类 Y/N 确诊
长达 4 年
诊断率
大体时间:长达 4 年
通过 WGS 分析的诊断率、1722 新生儿特异性基因过滤器与全外显子组过滤器
长达 4 年
诊断时间
大体时间:长达 4 年
与 SOC 测试或 HC 相比,WGS 的诊断时间(以天为单位)
长达 4 年
WGS 的临床应用
大体时间:长达 4 年
WGS 的临床效用(例如 护理管理的变化)与 SOC 或 HC 相比。 临床效用由参与病例的医生根据李克特量表返回结果进行评分(1 - 根本没有用,2 - 不是很有用,3 - 中性,4 - 有用,5 - 非常有用)
长达 4 年
护理成本评估
大体时间:长达 4 年
与 HC 相比,接受 WGS 的患者的总护理费用(美元)
长达 4 年
停留时间
大体时间:长达 4 年
与 HC 相比,接受 WGS 的患者总住院天数
长达 4 年
需要医疗利用
大体时间:长达 4 年
与接受 HC 的受试者相比,接受 WGS 的受试者进行的主要医疗程序、影像学研究或咨询服务的数量
长达 4 年

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Gerard Vockley, MD, PhD、University of Pittsburgh

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2020年7月13日

初级完成 (估计的)

2027年2月1日

研究完成 (估计的)

2027年6月1日

研究注册日期

首次提交

2021年4月13日

首先提交符合 QC 标准的

2021年4月13日

首次发布 (实际的)

2021年4月19日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2026年1月9日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2026年1月7日

最后验证

2026年1月1日

更多信息

与本研究相关的术语

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

不

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

不

研究美国 FDA 监管的设备产品

不

在美国制造并从美国出口的产品

不

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