Genomisekvensointi tehohoitoyksiköiden väestössä (PISCES)
keskiviikko 7. tammikuuta 2026 päivittänyt: Jerry Vockley, MD, PhD
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on ymmärtää, kuinka koko genomin sekvensoinnin (WGS) käyttö voi nopeuttaa diagnoosin tekemistä tehohoitoyksiköiden potilaille.
Tämä ei ole uuden laitteen, testin tai tekniikan arviointi.
Tämä projekti on tutkimus tämän teknologian hyödyllisyydestä kliinisessä hoidossa verrattuna tavanomaiseen hoitotestaukseen.
Tutkimuksessa tarkastellaan kykyä diagnosoida potilas nopeammin (aika diagnoosiin ja testauksen tehokkuus) verrattuna tavanomaiseen hoitotestaukseen.
Tutkimuksessa tarkastellaan myös WGS:n vaikutusta potilaiden tuloksiin ja kliinisen hoidon kustannuksiin.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ilmoittautuminen kutsusta
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämä on havainnointitutkimus, jonka tarkoituksena on ymmärtää, nopeuttaako koko genomin sekvensoinnin (WGS) käyttö diagnoosia ja kuinka kliininen hoito muuttuu vastasyntyneiden tehohoitopopulaatiossa. Tässä projektissa hyödynnetään hyväksyttyjä genomin sekvensointimenetelmiä CLIA-sertifioiduissa tiloissa.
- Vastasyntyneille, jotka ovat kelvollisia ja joiden vanhemmat suostuvat tutkimukseen, otetaan verinäyte, joka lähetetään WGS- ja bioinformatiikkaanalyyseihin. Ensin suodatetaan kohdistetulla paneelilla, jossa on 1722 geeniä, jotka todennäköisimmin aiheuttavat geneettisiä häiriöitä ensimmäisenä elinvuotena. koko exome-suodattimella, jos ilmeistä diagnoosia ei ole määritetty käyttämällä 1722-geenipaneelisuodatinta. Testaus suoritetaan CLIA-sertifioidussa laboratoriossa. Patogeeniset, todennäköisesti patogeeniset ja lapsen kliinisiin piirteisiin liittyvät geeneissä epävarman merkityksen variantit palautetaan hoitotiimille ja vanhemmille geneettisen neuvonnan yhteydessä käytettäväksi kliinisessä hoitoa koskevassa päätöksenteossa. Vastasyntyneiden EMR:ään lisätään raportti. Suostumus sisältää luvan päästä käsiksi sairaalahoidon taloudellisiin asiakirjoihin, verrata kustannuksia ja oleskelun kestoa vastaaviin kontrolleihin.
- Tunnistettujen vastasyntyneiden vanhemmille, jotka suostuvat tutkimukseen trio-analyysiä varten, otetaan näytteitä, jotka analysoidaan samanaikaisesti lapsen kanssa, jotta voidaan määrittää muunnelmien patogeenisyys genomisessa sekvensoinnissa. Patogeeniset ja todennäköiset patogeeniset toissijaiset löydökset ACMG 59:n myöhemmin ilmenevässä lääketieteellisesti toimivissa geeneissä raportoidaan vanhemmille geneettisen neuvonnan yhteydessä VAIN, jos vanhemmat suostuvat oppimaan nämä tulokset JA ne tunnistetaan lapsessa.
- Osallistuvien vastasyntyneiden sisaruksilta kerätään näytteitä geneettistä analyysiä varten, jos niitä tarvitaan vastasyntyneen geneettisten tutkimusten tulkitsemiseen. Patogeeniset ja todennäköisesti patogeeniset tulokset lapsuudessa alkaneissa häiriöissä raportoidaan vanhemmille geneettisen neuvonnan yhteydessä.
- Historialliset kontrollit tunnistetaan ja sovitetaan tutkimukseen osallistujien kanssa. Historiallisiin tarkastuksiin kuuluvat teho-osastolla olevat imeväiset, joille on tilattu geneettinen konsultaatio heidän ensimmäisen vastaanottonsa aikana edellisten 24 kuukauden aikana. Tutkimuksen osallistujien ja vastaavien kontrollien välinen vastaavuus suoritetaan käyttämällä taipumuspisteitä. Sovitamme logistisen regressiomallin yhdistettyihin hoito- ja kontrolliryhmiin ja käytämme sitten lähin naapurisovitusta yhteensopivien parien luomiseen. Vastaaminen auttaa vähentämään harhaa ja lisäämään tehoa todellisten vaikutusten havaitsemiseen. Näitä valvontatoimia käytetään vain verotuksen ja oleskelun keston analyyseihin; tälle kohortille ei tehdä geneettistä testausta.
Opintotyyppi
Interventio
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
400
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
Pennsylvania
-
Pittsburgh, Pennsylvania, Yhdysvallat, 15224
- UPMC Children's Hospital of Pittsburgh
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Ei vanhempi kuin 2 vuotta (Lapsi)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
Vastasyntyneet: Jotta vastasyntynyt voidaan kutsua osallistumaan, hänen on täytettävä kaikki seuraavat kriteerit:
- Raskausaika on yli 24 viikkoa
- Syntymäpaino yli 600 grammaa
- Päästettiin tehohoitoon UPMC:n lastensairaalaan (CHP) ja/tai Magee Women's Hospitaliin
- Merkkeihin, oireisiin ja laboratorioarvoihin perustuvan geneettisen häiriön mahdollisuus käynnistää kliinisen hoitotiimin virallisen kliinisen lääketieteellisen genetiikan konsultoinnin.
- PI:n tai osallistuvien tutkijoiden testaama ja etusijalle asetettu tämän tutkimustutkimuksen käyttöönotto potilaskohtaisten kliinisten huolenaiheiden perusteella
- Dokumentoitu tietoinen suostumus vanhemmalta/huoltajalta
- Vanhemmat: Vastasyntyneen vanhempi, joka täyttää yllä mainitut osallistumiskriteerit ja jolle on annettu suostumus osallistua tutkimukseen.
- Sisarukset: Vastasyntyneen sisarukset, jotka täyttävät yllä mainitut osallistumiskriteerit ja joille on annettu suostumus osallistua tutkimukseen. Sisaruksia rekrytoidaan vain, jos heidän osallistumisensa on todettu olevan välttämätöntä vastasyntyneen geneettisten tutkimusten tarkan tulkinnan kannalta.
- Historialliset kontrollit: Henkilöt, jotka Medical Genetics on arvioinut viimeisten 24 kuukauden aikana ja jotka täyttävät vastaavien kontrollien kriteerit, jotka on määritelty taipumuspisteiden täsmäämisessä.
Poissulkemiskriteerit:
Vastasyntyneet: Henkilö, joka täyttää jonkin seuraavista kriteereistä, suljetaan pois osallistumisesta tähän tutkimukseen:
- Hänellä on tunnettu etiologinen diagnoosi (esim. synnytystä edeltävä testi)
- Sillä on merkittävä synnynnäinen poikkeavuus (munuaisten, sydämen, maksan, neurologiset tai keuhkojen epämuodostumat), joka liittyy syntymää edeltävässä testissä havaittuun kromosomipoikkeamaan (esim. ultraääni, geenitesti)
- Synnytyksen jälkeen lähetetty sekvensointi jostain muusta syystä kuin tutkimuksen käynnistävästä geneettisestä konsultaatiosta
- Dokumentoidun merkittävän synnynnäisen infektion esiintyminen (esim. synnynnäinen sytomegalovirus)
Vanhemmat:
- Ei ole tunnistetun vastasyntyneen biologinen vanhempi
- Vanhempien osallistumista ei ole suljettu pois. Jos vanhempi on kuitenkin alle 18-vuotias, näitä henkilöitä pyydetään antamaan suostumus tutkimukseen ja heidän vanhempansa pyydetään antamaan lupa/suostumus alaikäisen vanhemman osallistumiseen.
- Aikaisempi geneettinen testaus ei sulje pois vanhempia osallistumasta tähän tutkimukseen.
Sisarukset:
- Ei ole sisällyttämiskriteerit täyttävän vastasyntyneen biologinen sisarus
- Ei vaadi vastasyntyneiden tulosten tarkkaa tulkintaa
- Aikaisempi geneettinen testaus ei sulje pois sisarusta osallistumasta tähän tutkimukseen.
- Historiallinen kontrolli: Ei ole nähty viimeisten 24 kuukauden aikana ja/tai se ei täytä täsmäytyneen kontrollin kriteerejä, jotka on määritelty taipumuspisteiden täsmäämisessä. Osa tästä vastaavuudesta edellyttää, että historiallinen kontrolli yhdistetään tutkimukseen osallistujaan iän perusteella, jolloin hänet valitaan kaikkien vastaavuuskriteerien perusteella ja suljetaan pois, jos he eivät täytä kriteerejä, mukaan lukien ikä.
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Diagnostiikka
- Jako: Ei käytössä
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / Arm |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Muut: Vastasyntyneen WGS-testaus
Vastasyntyneiltä, jotka ovat kelvollisia ja joiden vanhemmat suostuvat tutkimukseen, otetaan verinäyte, joka lähetetään koko genomin sekvensointiin ja bioinformatiikkaan. Ensin suodatetaan kohdennettu paneeli 1722 geenistä, jotka todennäköisimmin aiheuttavat geneettisiä häiriöitä ensimmäisenä elinvuotena, ja sitten. koko exome-suodattimella, jos ilmeistä diagnoosia ei ole määritetty käyttämällä 1722-geenipaneelisuodatinta.
|
Vastasyntyneille tehdään koko genomi sekvensointi ja analyysi kohdistetulla geenipaneelilla, joka todennäköisesti aiheuttaa geneettisiä häiriöitä ensimmäisenä elinvuotena. Jos diagnoosia ei tunnisteta, sekvensoidut tiedot analysoidaan käyttämällä koko exome-suodatinta. Suoritettu CLIA-sertifioidussa laboratoriossa. Patogeeniset, todennäköisesti patogeeniset ja VUS-geenit fenotyyppiin liittyvissä geeneissä palautetaan hoitotiimille ja perheelle. Vanhemmat otetaan mukaan trio-analyysiä varten lapsen kanssa auttamaan muunnelmien patogeenisyyden määrittämisessä genomisessa sekvensoinnissa. Patogeeniset ja todennäköisesti patogeeniset löydökset raportoidaan vanhemmille geneettisen neuvonnan yhteydessä. Sisarukset otetaan mukaan ja heiltä kerätään näytteitä geneettistä analyysiä varten vain, jos se katsotaan välttämättömäksi. Tulokset raportoidaan vanhemmille geneettisen neuvonnan yhteydessä. |
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Vahvistettu diagnoosi
Aikaikkuna: Jopa 4 vuotta
|
Kategoorinen Y/N vahvistettu diagnoosi vastasyntyneellä osallistujalla, joka havaittiin WGS:llä, verrattuna tuloksiin standardin hoidon (SOC) tuloksista tai historiallisesta kontrollista (HC)
|
Jopa 4 vuotta
|
|
Diagnostinen määrä
Aikaikkuna: Jopa 4 vuotta
|
Diagnostinen nopeus analyysillä WGS:n, vastasyntyneen 1722-spesifisen geenisuodattimen, vs. koko exome-suodattimen avulla
|
Jopa 4 vuotta
|
|
Diagnoosin aika
Aikaikkuna: Jopa 4 vuotta
|
Aika diagnoosiin päivinä WGS:llä verrattuna SOC-testaukseen tai HC:hen
|
Jopa 4 vuotta
|
|
WGS:n kliininen hyöty
Aikaikkuna: Jopa 4 vuotta
|
WGS:n kliininen hyöty (esim.
muutokset hoitojohtamisessa) verrattuna SOC:hen tai HC:hen.
Kliinisen hyödyllisyyden arvioi tapaukseen osallistuva lääkäri tulosten palauttamisen jälkeen Likert-asteikolla (1 - ei lainkaan hyödyllinen, 2 - ei kovin hyödyllinen, 3 - neutraali, 4 - hyödyllinen, 5 - erittäin hyödyllinen)
|
Jopa 4 vuotta
|
|
Hoitokustannusten arviointi
Aikaikkuna: Jopa 4 vuotta
|
Hoidon kokonaiskustannukset dollareina WGS:ää saavilla verrattuna HC:hen
|
Jopa 4 vuotta
|
|
Oleskelun kesto
Aikaikkuna: Jopa 4 vuotta
|
Sairaalahoidon kokonaiskesto päivinä WGS-potilailla verrattuna HC:hen
|
Jopa 4 vuotta
|
|
Lääketieteellisen käytön tarve
Aikaikkuna: Jopa 4 vuotta
|
Suurten lääketieteellisten toimenpiteiden, kuvantamistutkimusten tai konsultointipalveluiden kohtaamien määrä WGS-potilailla verrattuna HC-potilaisiin
|
Jopa 4 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Gerard Vockley, MD, PhD, University of Pittsburgh
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Maanantai 13. heinäkuuta 2020
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Maanantai 1. helmikuuta 2027
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Tiistai 1. kesäkuuta 2027
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Tiistai 13. huhtikuuta 2021
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 13. huhtikuuta 2021
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Maanantai 19. huhtikuuta 2021
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Perjantai 9. tammikuuta 2026
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Keskiviikko 7. tammikuuta 2026
Viimeksi vahvistettu
Torstai 1. tammikuuta 2026
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- STUDY19050319
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
EI
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .