集中治療室集団におけるゲノム配列決定 (PISCES)
調査の概要
詳細な説明
これは、全ゲノム配列決定 (WGS) の使用が診断の速度を向上させるかどうか、および新生児の集中治療集団で臨床管理がどのように変化するかを理解するための観察研究です。 このプロジェクトは、CLIA 認定施設で承認されたゲノム配列決定法を利用しています。
- 適格であり、両親が研究に同意した新生児被験者は、WGSおよびバイオインフォマティクス分析のために送られる血液サンプルを受け、最初に生後1年で遺伝性疾患を引き起こす可能性が最も高い1722遺伝子のターゲットパネルでフィルタリングし、次に1722 遺伝子パネル フィルターを使用しても明らかな診断結果が得られない場合は、全エクソーム フィルターを使用します。 テストは CLIA 認定のラボで行われます。 子供の臨床的特徴に関連する遺伝子における病原性、病原性の可能性、および重要性が不明なバリアントは、管理に関する臨床的意思決定に使用するために、遺伝カウンセリングの設定でケアチームと両親に戻されます。 新生児 EMR にレポートが追加されます。 同意には、入院の財務記録にアクセスし、費用と滞在期間を対応する対照と比較する許可が含まれます。
- トリオ分析の目的で研究に同意した特定された新生児の親は、ゲノム配列決定における変異体の病原性を決定するのを助けるために、子供と同時分析を受けるサンプルを収集します。 ACMG 59の遅発性の医学的に実用的な遺伝子における病原性および病原性が疑われる二次的所見は、両親がこれらの結果を学ぶことを選択し、それらが子供で特定された場合にのみ、遺伝カウンセリングの設定で両親に報告されます.
- 参加している新生児の兄弟は、新生児の遺伝子研究の解釈に必要な場合、遺伝子分析に使用するためにサンプルを収集します。 小児期発症疾患における病原性および病原性の可能性のある結果は、遺伝カウンセリングの場で両親に報告されます。
- 過去の対照が特定され、研究参加者と照合されます。 過去の対照群には、ICU 内の乳児が含まれ、過去 24 か月間の最初の入院中に遺伝学のコンサルトが指示されました。 傾向スコアを使用して、研究参加者と対応する対照とのマッチングが行われます。 ロジスティック回帰モデルを組み合わせた治療グループと対照グループに適合させ、次に最近傍マッチングを使用して一致したペアを作成します。 マッチングは、バイアスを減らし、検出力を高めて真の効果を検出するのに役立ちます。 これらのコントロールは、会計および滞在期間の分析にのみ使用されます。このコホートでは遺伝子検査は行われません。
研究の種類
入学 (推定)
段階
- 適用できない
連絡先と場所
研究場所
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-
Pennsylvania
-
Pittsburgh、Pennsylvania、アメリカ、15224
- UPMC Children's Hospital of Pittsburgh
-
-
参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
説明
包含基準:
新生児: 参加のアプローチを受けるには、新生児は次の基準をすべて満たしている必要があります。
- 妊娠24週以上
- 出生時体重が600グラム以上
- -UPMC Children's Hospital(CHP)および/またはMagee Women's Hospitalの集中治療室に入院
- 徴候、症状、検査値に基づく遺伝性疾患の可能性により、臨床ケアチームによる正式な臨床医学遺伝学相談がトリガーされます。
- -PIまたは参加する共同研究者によってトリアージされ、患者固有の臨床的懸念に基づいてこの調査研究の導入が優先されます
- 親/保護者からの文書化されたインフォームド コンセント
- 親:上記の選択基準を満たし、研究への参加に同意した新生児の親。
- 兄弟姉妹:上記の選択基準を満たし、研究への参加に同意した新生児の兄弟姉妹。 同胞の参加は、新生児の遺伝子研究の正確な解釈に不可欠であると判断された場合にのみ採用されます。
- 過去のコントロール: 過去 24 か月以内に Medical Genetics によって評価され、傾向スコアの一致によって定義された一致したコントロールの基準を満たす個人。
除外基準:
新生児:次の基準のいずれかを満たす個人は、この研究への参加から除外されます。
- 既知の病因診断がある(例: 出生前検査)
- 出生前検査で検出された染色体異常に関連する主要な先天異常(腎臓、心臓、肝臓、神経、または肺の奇形)がある 超音波、遺伝子検査)
- 研究の引き金となった遺伝学相談以外の理由で出生後に送信された配列決定
- 文書化された重大な先天性感染症の存在(例: 先天性サイトメガロウイルス)
両親:
- 特定された新生児の生物学的親ではない
- 保護者参加の除外はありません。 ただし、親が 18 歳未満の場合、これらの個人は研究に同意するよう求められ、その親は未成年の親の参加に対する許可/同意を提供するよう求められます。
- 以前に遺伝子検査を受けたことがあるからといって、親がこの研究に参加することを排除するものではありません。
兄弟:
- -包含基準を満たす新生児の生物学的兄弟ではありません
- 新生児の結果を正確に解釈する必要はありません
- 以前に遺伝子検査を受けたことがあるからといって、同胞がこの研究に参加することを排除するものではありません。
- 過去のコントロール: 過去 24 か月以内に見られなかった、および/または傾向スコアの一致によって定義された一致したコントロールの基準を満たしていない。 このマッチングの一部は、ヒストリカルコントロールが年齢に基づいて調査参加者に一致する必要があるため、すべての一致基準に基づいて選択され、年齢を含む基準を満たさない場合は除外されます。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 主な目的:診断
- 割り当て:なし
- 介入モデル:単一グループの割り当て
- マスキング:なし(オープンラベル)
武器と介入
参加者グループ / アーム |
介入・治療 |
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他の:新生児 WGS 検査
資格があり、両親が研究に同意した新生児被験者は、全ゲノムシーケンシングとバイオインフォマティクス分析のために送られる血液サンプリングを受け、最初に生後1年で遺伝性疾患を引き起こす可能性が最も高い1722遺伝子のターゲットパネルをフィルタリングし、次に1722 遺伝子パネル フィルターを使用しても明らかな診断結果が得られない場合は、全エクソーム フィルターを使用します。
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新生児は、生後1年以内に遺伝性疾患を引き起こす可能性が高い遺伝子の標的パネルを用いた全ゲノム配列決定および分析を受ける。 診断が特定されない場合、シーケンスされたデータは全エクソーム フィルターを使用して分析されます。 CLIA認定ラボで実施。 表現型に関連する遺伝子の病原性、病原性の可能性が高い、および VUS は、ケアチームと家族に返されます。 親は、ゲノム配列決定におけるバリアントの病原性を決定するのを支援するために、子供とのトリオ分析の目的で登録されます。 病原性および病原性の可能性のある所見は、遺伝カウンセリングの場で両親に報告されます。 兄弟は登録され、遺伝子分析で使用するためにサンプルが収集されます 必須と見なされる場合にのみ。 結果は、遺伝カウンセリングの場で両親に報告されます。 |
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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確定診断
時間枠:4年まで
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WGSで検出された新生児参加者のカテゴリーY / N確定診断は、標準治療(SOC)の結果と比較して、または歴史的対照(HC)で見られるように
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4年まで
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診断率
時間枠:4年まで
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1722 新生児特異的遺伝子フィルターである WGS と全エクソーム フィルターによる分析による診断率
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4年まで
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診断までの時間
時間枠:4年まで
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SOC テストまたは HC と比較して、WGS では診断までの日数が短い
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4年まで
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WGS の臨床的有用性
時間枠:4年まで
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WGS の臨床的有用性 (例:
SOC または HC と比較したケア管理の変更)。
臨床的有用性は、リッカート尺度 (1 - まったく役に立たない、2 - あまり役に立たない、3 - どちらでもない、4 - 役に立った、5 - 非常に役に立った) を使用して結果を返した後、症例に関与した医師によって評価されます。
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4年まで
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介護費用評価
時間枠:4年まで
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HC と比較した WGS を受けている患者の総治療費 (ドル単位)
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4年まで
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滞在日数
時間枠:4年まで
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HC と比較した WGS を受けた患者の合計入院期間 (日数)
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4年まで
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医療利用の必要性
時間枠:4年まで
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HC と比較した WGS を受けた被験者の主要な医療処置、画像検査、またはコンサルティングサービスの遭遇数
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4年まで
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協力者と研究者
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捜査官
- 主任研究者:Gerard Vockley, MD, PhD、University of Pittsburgh
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (推定)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
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