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Sequenciamento do genoma na população da unidade de terapia intensiva (PISCES)

1 de novembro de 2023 atualizado por: Jerry Vockley, MD, PhD
O objetivo deste estudo é entender como o uso do sequenciamento completo do genoma (WGS) pode aumentar a velocidade com que o diagnóstico é feito para pacientes em uma população de unidade de terapia intensiva. Esta não é uma avaliação de um novo dispositivo, teste ou tecnologia. Este projeto é uma investigação da utilidade desta tecnologia em cuidados clínicos quando comparada com o padrão de testes de cuidados. O estudo analisará a capacidade de diagnosticar mais rapidamente um paciente (tempo para diagnóstico e eficácia do teste) em comparação com o teste padrão de atendimento. O estudo também analisará o impacto do WGS nos resultados dos pacientes e no custo dos cuidados clínicos.

Visão geral do estudo

Status

Inscrevendo-se por convite

Descrição detalhada

Este é um estudo observacional para entender se o uso do sequenciamento completo do genoma (WGS) aumenta a velocidade do diagnóstico e como o manejo clínico é alterado em uma população de neonatos em terapia intensiva. Este projeto utiliza métodos de sequenciamento do genoma aprovados em instalações certificadas pela CLIA.

  1. Indivíduos neonatos elegíveis e cujos pais consentem com o estudo passarão por uma amostra de sangue que será enviada para análise WGS e bioinformática, filtrando primeiro com um painel direcionado de 1.722 genes com maior probabilidade de causar distúrbios genéticos no primeiro ano de vida e, em seguida, com um filtro de exoma completo se nenhum diagnóstico óbvio for determinado usando o filtro de painel de genes 1722. O teste é concluído em um laboratório certificado pela CLIA. Patogênicas, provavelmente patogênicas e variantes de significado incerto em genes relacionados às características clínicas da criança serão devolvidas à equipe de atendimento e aos pais no cenário de aconselhamento genético para uso na tomada de decisão clínica sobre o manejo. Um relatório é adicionado ao EMR do recém-nascido. O consentimento incluirá permissão para acessar os registros financeiros da hospitalização, para comparar custos e tempo de permanência com controles correspondentes.
  2. Os pais de recém-nascidos identificados que consentirem no estudo para fins de análise trio terão amostras coletadas que serão submetidas à análise simultânea com a criança para auxiliar na determinação da patogenicidade das variantes no sequenciamento genômico. Descobertas secundárias patogênicas e provavelmente patogênicas nos genes ACMG 59 de início tardio serão relatadas aos pais no contexto do aconselhamento genético APENAS se os pais optarem por aprender esses resultados E eles forem identificados na criança.
  3. Irmãos de recém-nascidos participantes, se necessário para interpretação dos estudos genéticos do recém-nascido, terão amostras coletadas para uso na análise genética. Resultados patogênicos e provavelmente patogênicos em distúrbios com início na infância serão relatados aos pais no contexto do aconselhamento genético.
  4. Os controles históricos serão identificados e combinados com os participantes do estudo. Os controles históricos incluirão bebês na UTI com uma consulta de genética solicitada durante sua admissão inicial nos 24 meses anteriores. A correspondência entre os participantes do estudo e os controles correspondentes será realizada usando Propensity Scores. Ajustaremos um modelo de regressão logística aos grupos combinados de tratamento e controle e, em seguida, usaremos a correspondência de vizinho mais próximo para criar pares correspondentes. A correspondência ajudará a reduzir o viés e aumentar o poder de detectar efeitos verdadeiros. Esses controles serão utilizados apenas para as análises fiscais e de permanência; nenhum teste genético será feito nesta coorte.

Tipo de estudo

Intervencional

Inscrição (Estimado)

400

Estágio

  • Não aplicável

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Locais de estudo

    • Pennsylvania
      • Pittsburgh, Pennsylvania, Estados Unidos, 15224
        • UPMC Children's Hospital of Pittsburgh

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

Não mais velho que 4 meses (Filho)

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Descrição

Critério de inclusão:

  • Recém-nascidos: Para ser abordado para participar, um recém-nascido deve atender a todos os seguintes critérios:

    1. Maior que 24 semanas de idade gestacional
    2. Peso ao nascer maior que 600 gramas
    3. Admitido na unidade de terapia intensiva do UPMC Children's Hospital (CHP) e/ou Magee Women's Hospital
    4. Possibilidade de um distúrbio genético com base em sinais, sintomas e valores laboratoriais, desencadeando uma consulta formal de genética médica clínica pela equipe de atendimento clínico.
    5. Triagem por PI ou co-investigadores participantes e priorizada para a introdução deste estudo de pesquisa com base em preocupações clínicas específicas do paciente
    6. Consentimento informado documentado dos pais/responsável
  • Pais: Pais de um recém-nascido que atende aos critérios de inclusão acima e que consentiram em participar do estudo.
  • Irmãos: Irmãos de um neonato que atende aos critérios de inclusão acima e que consentiram em participar do estudo. Irmãos só serão recrutados se sua participação for considerada essencial para a interpretação precisa dos estudos genéticos do recém-nascido.
  • Controles Históricos: Indivíduos que foram avaliados pela Genética Médica nos últimos 24 meses e que atendem aos critérios para controles pareados conforme definido pela correspondência de pontuação de propensão.

Critério de exclusão:

  • Recém-nascidos: Um indivíduo que atender a qualquer um dos seguintes critérios será excluído da participação neste estudo:

    1. Tem um diagnóstico etiológico conhecido (p. teste pré-natal)
    2. Tem uma anomalia congênita importante (malformações renais, cardíacas, hepáticas, neurológicas ou pulmonares) associada a uma anomalia cromossômica detectada no teste pré-natal (por exemplo, ultrassom, testes genéticos)
    3. Sequenciamento enviado após o nascimento por qualquer outro motivo que não seja a consulta genética que desencadeia o estudo
    4. Presença de infecção congênita significativa documentada (por exemplo, citomegalovírus congênito)
  • Pais:

    1. Não é o pai biológico do neonato identificado
    2. Não há exclusão da participação dos pais. No entanto, se o pai tiver menos de 18 anos de idade, esses indivíduos serão solicitados a concordar com o estudo e seus pais serão solicitados a fornecer permissão/consentimento para a participação do pai menor
    3. Ter feito testes genéticos anteriores não exclui o pai de participar deste estudo.
  • Irmãos:

    1. Não é irmão biológico de um neonato que atende aos critérios de inclusão
    2. Não é necessário para uma interpretação precisa dos resultados neonatais
    3. Ter feito testes genéticos anteriores não exclui o irmão de participar deste estudo.
  • Controle histórico: não foi visto nos últimos 24 meses e/ou não atende aos critérios para controle combinado conforme definido pela correspondência de escore de propensão. Parte dessa correspondência exige que o controle histórico seja correspondido a um participante do estudo com base na idade, portanto, eles serão selecionados com base em todos os critérios de correspondência e serão excluídos se não atenderem aos critérios, incluindo a idade.

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

  • Finalidade Principal: Diagnóstico
  • Alocação: N / D
  • Modelo Intervencional: Atribuição de grupo único
  • Mascaramento: Nenhum (rótulo aberto)

Armas e Intervenções

Grupo de Participantes / Braço
Intervenção / Tratamento
Outro: Teste WGS Neonatal
Indivíduos neonatos elegíveis e cujos pais consentem em estudar serão submetidos a amostragem de sangue que será enviada para sequenciamento do genoma completo e análise de bioinformática, filtrando primeiro um painel direcionado de 1722 genes com maior probabilidade de causar distúrbios genéticos no primeiro ano de vida e, em seguida, com um filtro de exoma completo se nenhum diagnóstico óbvio for determinado usando o filtro de painel de genes 1722.

Os recém-nascidos passarão por sequenciamento completo do genoma e análise com um painel direcionado de genes com probabilidade de causar distúrbios genéticos no primeiro ano de vida. Se nenhum diagnóstico for identificado, os dados sequenciados serão analisados ​​usando um filtro de exoma completo. Realizado em um laboratório certificado pela CLIA. Patogênicos, provavelmente patogênicos e VUS em genes relacionados ao fenótipo serão devolvidos à equipe assistencial e à família.

Os pais serão inscritos para fins de análise trio com a criança para auxiliar na determinação da patogenicidade das variantes no sequenciamento genômico. Achados patogênicos e provavelmente patogênicos serão relatados aos pais no contexto do aconselhamento genético.

Os irmãos serão inscritos e terão amostras coletadas para uso na análise genética somente se forem consideradas essenciais. Os resultados serão informados aos pais no contexto do aconselhamento genético.

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Diagnóstico confirmado
Prazo: Até 4 anos
S/N categórico diagnóstico confirmado no participante recém-nascido detectado com WGS, em comparação com os resultados do tratamento padrão (SOC) ou conforme observado no controle histórico (HC)
Até 4 anos
Taxa de diagnóstico
Prazo: Até 4 anos
Taxa de diagnóstico com análise via WGS, o filtro de gene específico neonatal 1722, versus filtro de exoma completo
Até 4 anos
Hora do Diagnóstico
Prazo: Até 4 anos
Tempo até o diagnóstico em dias com WGS em comparação com teste SOC ou HC
Até 4 anos
Utilidade Clínica do WGS
Prazo: Até 4 anos
Utilidade clínica de WGS (por exemplo, mudanças na gestão do cuidado) em comparação com SOC ou HC. A utilidade clínica é avaliada por um médico envolvido com o caso após o retorno dos resultados usando uma escala Likert (1 - Nada útil, 2 - Pouco útil, 3 - Neutro, 4 - Útil, 5 - Muito útil)
Até 4 anos
Avaliação de Custo de Cuidados
Prazo: Até 4 anos
Custo total do atendimento em dólares naqueles que receberam WGS em comparação com HC
Até 4 anos
Duração da estadia
Prazo: Até 4 anos
Tempo total de internação em dias naqueles que receberam WGS em comparação com HC
Até 4 anos
Necessidade de Utilização Médica
Prazo: Até 4 anos
Número de procedimentos médicos importantes, estudos de imagem ou encontros de serviços de consultoria em indivíduos que receberam WGS em comparação com aqueles em HC
Até 4 anos

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Patrocinador

Investigadores

  • Investigador principal: Gerard Vockley, MD, PhD, University of Pittsburgh

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Real)

13 de julho de 2020

Conclusão Primária (Estimado)

1 de julho de 2024

Conclusão do estudo (Estimado)

1 de novembro de 2024

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

13 de abril de 2021

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

13 de abril de 2021

Primeira postagem (Real)

19 de abril de 2021

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Estimado)

3 de novembro de 2023

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

1 de novembro de 2023

Última verificação

1 de novembro de 2023

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Outros números de identificação do estudo

  • STUDY19050319

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

NÃO

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

Ensaios clínicos em Teste WGS Neonatal

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