Genoomsequencing in de populatie op de Intensive Care (PISCES)
7 januari 2026 bijgewerkt door: Jerry Vockley, MD, PhD
Het doel van deze studie is om te begrijpen hoe het gebruik van whole genome sequencing (WGS) de snelheid kan verhogen waarmee een diagnose wordt gesteld voor patiënten op een intensive care-afdeling.
Dit is geen beoordeling van een nieuw apparaat, test of technologie.
Dit project is een onderzoek naar het nut van deze technologie in de klinische zorg in vergelijking met standaardzorgtesten.
De studie zal kijken naar het vermogen om een patiënt sneller te diagnosticeren (tijd tot diagnose en effectiviteit van testen) in vergelijking met standaardzorgtesten.
De studie zal ook kijken naar de impact van WGS op patiëntresultaten en kosten van klinische zorg.
Studie Overzicht
Toestand
Aanmelden op uitnodiging
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Dit is een observationele studie om te begrijpen of het gebruik van whole genome sequencing (WGS) de snelheid tot diagnose verhoogt en hoe de klinische behandeling verandert in een intensive care-populatie van pasgeborenen. Dit project maakt gebruik van goedgekeurde methoden voor genoomsequencing in CLIA-gecertificeerde faciliteiten.
- Pasgeboren proefpersonen die in aanmerking komen en van wie de ouders instemmen met de studie, ondergaan een bloedmonster dat zal worden verzonden voor WGS- en bio-informatica-analyse, eerst gefilterd met een gericht panel van 1722 genen die hoogstwaarschijnlijk genetische aandoeningen veroorzaken in het eerste levensjaar, en vervolgens met een volledig exome-filter als er geen duidelijke diagnose wordt vastgesteld met behulp van het 1722-genenpanelfilter. Het testen wordt uitgevoerd in een CLIA-gecertificeerd laboratorium. Pathogene, waarschijnlijk-pathogene en varianten van onzekere significantie in genen die verband houden met de klinische kenmerken van het kind zullen worden teruggegeven aan het zorgteam en aan de ouders in de setting van erfelijkheidsadvisering voor gebruik bij klinische besluitvorming over management. Er wordt een melding toegevoegd aan het EPD van de pasgeborene. Toestemming omvat toestemming voor toegang tot financiële gegevens van de ziekenhuisopname, om kosten en verblijfsduur te vergelijken met gematchte controles.
- Ouders van geïdentificeerde pasgeborenen die instemmen met het onderzoek ten behoeve van trio-analyse zullen monsters laten verzamelen die gelijktijdig met het kind zullen worden geanalyseerd om te helpen bij het bepalen van de pathogeniteit van varianten in genomische sequencing. Pathogene en waarschijnlijk-pathogene secundaire bevindingen in de ACMG 59 later optredende medisch bruikbare genen zullen ALLEEN aan de ouders worden gerapporteerd in de setting van erfelijkheidsadvies als de ouders ervoor kiezen om deze resultaten te vernemen EN ze bij het kind worden geïdentificeerd.
- Broers en zussen van deelnemende neonaten zullen, indien nodig voor interpretatie van de genetische studies van de neonaat, monsters laten nemen voor gebruik in de genetische analyse. Pathogene en waarschijnlijke pathogene resultaten bij stoornissen die in de kindertijd zijn ontstaan, zullen aan de ouders worden gerapporteerd in het kader van erfelijkheidsadvisering.
- Historische controles zullen worden geïdentificeerd en afgestemd op studiedeelnemers. Historische controles omvatten baby's op de ICU die tijdens hun eerste opname in de afgelopen 24 maanden een genetisch consult hebben besteld. Matching tussen studiedeelnemers en gematchte controles zal worden uitgevoerd met behulp van Propensity Scores. We passen een logistiek regressiemodel toe op de gecombineerde behandelings- en controlegroepen en gebruiken vervolgens de naaste buur-matching om gematchte paren te creëren. De matching helpt bias te verminderen en het vermogen te vergroten om echte effecten te detecteren. Deze controles worden alleen gebruikt voor de fiscale en verblijfsduuranalyses; op dit cohort zullen geen genetische tests worden uitgevoerd.
Studietype
Ingrijpend
Inschrijving (Geschat)
400
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studie Locaties
-
-
Pennsylvania
-
Pittsburgh, Pennsylvania, Verenigde Staten, 15224
- UPMC Children's Hospital of Pittsburgh
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Niet ouder dan 2 jaar (Kind)
Accepteert gezonde vrijwilligers
Nee
Beschrijving
Inclusiecriteria:
Neonaten: Om te worden benaderd om deel te nemen, moet een neonaat aan alle volgende criteria voldoen:
- Zwangerschapsduur langer dan 24 weken
- Geboortegewicht groter dan 600 gram
- Opgenomen op de intensive care van het UPMC Children's Hospital (CHP) en/of Magee Women's Hospital
- Mogelijkheid van een genetische aandoening op basis van tekenen, symptomen en laboratoriumwaarden die aanleiding geven tot een formeel klinisch medisch genetisch consult door het klinische zorgteam.
- Triage door PI of aanwezige mede-onderzoekers en prioriteit gegeven aan introductie van dit onderzoek op basis van patiëntspecifieke klinische zorgen
- Gedocumenteerde geïnformeerde toestemming van ouder/voogd
- Ouders: ouder van een pasgeborene die voldoet aan de bovenstaande inclusiecriteria en die toestemming heeft gekregen om deel te nemen aan het onderzoek.
- Broers en zussen: Broers en zussen van een pasgeborene die voldoen aan de bovenstaande inclusiecriteria en die toestemming hebben gekregen om deel te nemen aan het onderzoek. Broers en zussen worden alleen geworven als is vastgesteld dat hun deelname essentieel is voor de juiste interpretatie van de genetische studies van de neonaat.
- Historische controles: Personen die in de afgelopen 24 maanden zijn geëvalueerd door Medical Genetics en die voldoen aan de criteria voor gematchte controles zoals gedefinieerd door propensity score matching.
Uitsluitingscriteria:
Pasgeborenen: een persoon die aan een van de volgende criteria voldoet, wordt uitgesloten van deelname aan dit onderzoek:
- Heeft een bekende etiologische diagnose (bijv. prenatale testen)
- Heeft een ernstige aangeboren afwijking (nier-, hart-, lever-, neurologische of pulmonale misvormingen) geassocieerd met een chromosomale afwijking gedetecteerd bij prenatale testen (bijv. echografie, genetische testen)
- Sequentiebepaling die na de geboorte wordt verzonden om een andere reden dan het genetisch consult dat de studie in gang zet
- Aanwezigheid van gedocumenteerde significante congenitale infectie (bijv. aangeboren cytomegalovirus)
Ouders:
- Is niet de biologische ouder van de geïdentificeerde pasgeborene
- Er is geen uitsluiting voor ouderparticipatie. Als de ouder echter jonger is dan 18 jaar, zullen deze personen worden gevraagd om in te stemmen met het onderzoek en zal hun ouder(s) worden gevraagd om toestemming/toestemming te geven voor de deelname van de minderjarige ouder
- Het hebben van eerdere genetische tests sluit de ouder niet uit van deelname aan dit onderzoek.
Broers en zussen:
- Is geen biologische broer of zus van een pasgeborene die voldoet aan de inclusiecriteria
- Is niet vereist voor een nauwkeurige interpretatie van resultaten bij pasgeborenen
- Het hebben van eerdere genetische testen sluit de broer of zus niet uit van deelname aan dit onderzoek.
- Historische controle: Is niet waargenomen in de afgelopen 24 maanden en/of voldoet niet aan de criteria voor gematchte controle zoals gedefinieerd door propensity score matching. Een deel van deze matching vereist dat de historische controle wordt gekoppeld aan een studiedeelnemer op basis van leeftijd, dus ze zullen worden geselecteerd op basis van alle matchingcriteria en worden uitgesloten als ze niet voldoen aan de criteria, inclusief leeftijd.
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Primair doel: Diagnostisch
- Toewijzing: NVT
- Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
- Masker: Geen (open label)
Wapens en interventies
Deelnemersgroep / Arm |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Ander: WGS-testen bij pasgeborenen
Pasgeboren proefpersonen die in aanmerking komen en van wie de ouders toestemming geven voor onderzoek, ondergaan bloedafname die zal worden verzonden voor sequentiebepaling van het hele genoom en bio-informatica-analyse, waarbij eerst een gericht panel van 1722 genen wordt gefilterd die hoogstwaarschijnlijk genetische aandoeningen veroorzaken in het eerste levensjaar, en vervolgens met een volledig exome-filter als er geen duidelijke diagnose wordt vastgesteld met behulp van het 1722-genenpanelfilter.
|
Neonaten ondergaan sequencing van het hele genoom en analyse met een gericht panel van genen die in het eerste levensjaar waarschijnlijk genetische aandoeningen veroorzaken. Als er geen diagnose wordt geïdentificeerd, worden gesequentiseerde gegevens geanalyseerd met behulp van een volledig exome-filter. Uitgevoerd in een CLIA-gecertificeerd laboratorium. Pathogene, waarschijnlijk pathogene en VUS in genen gerelateerd aan het fenotype zullen worden teruggestuurd naar het zorgteam en de familie. Ouders worden ingeschreven voor trio-analyse met het kind om te helpen bij het bepalen van de pathogeniteit van varianten in genomische sequencing. Pathogene en waarschijnlijke pathogene bevindingen zullen aan de ouders worden gerapporteerd in het kader van erfelijkheidsadvisering. Broer/zus wordt ingeschreven en er worden alleen monsters afgenomen voor gebruik in de genetische analyse als dit essentieel wordt geacht. De resultaten worden aan de ouders gerapporteerd in het kader van erfelijkheidsadvisering. |
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Bevestigde diagnose
Tijdsspanne: Tot 4 jaar
|
Categorische J/N bevestigde diagnose bij de pasgeborene deelnemer gedetecteerd met WGS, vergeleken met resultaten van standaardzorg (SOC) of zoals gezien in de historische controle (HC)
|
Tot 4 jaar
|
|
Diagnostisch tarief
Tijdsspanne: Tot 4 jaar
|
Diagnostisch percentage met analyse via WGS, het 1722 neonatale specifieke genfilter, versus het hele exome-filter
|
Tot 4 jaar
|
|
Tijd voor diagnose
Tijdsspanne: Tot 4 jaar
|
Tijd tot diagnose in dagen met WGS in vergelijking met SOC-testen of HC
|
Tot 4 jaar
|
|
Klinische bruikbaarheid van WGS
Tijdsspanne: Tot 4 jaar
|
Klinische bruikbaarheid van WGS (bijv.
veranderingen in zorgmanagement) in vergelijking met SOC of HC.
Klinische bruikbaarheid wordt beoordeeld door een arts die bij de casus betrokken is na de terugkeer van de resultaten met behulp van een Likert-schaal (1 - helemaal niet nuttig, 2 - niet erg nuttig, 3 - neutraal, 4 - nuttig, 5 - zeer nuttig)
|
Tot 4 jaar
|
|
Evaluatie van zorgkosten
Tijdsspanne: Tot 4 jaar
|
Totale zorgkosten in dollars bij degenen die WGS ontvangen in vergelijking met HC
|
Tot 4 jaar
|
|
Duur van het verblijf
Tijdsspanne: Tot 4 jaar
|
Totale duur van het ziekenhuisverblijf in dagen bij degenen die WGS kregen in vergelijking met HC
|
Tot 4 jaar
|
|
Behoefte aan medisch gebruik
Tijdsspanne: Tot 4 jaar
|
Aantal grote medische procedures, beeldvormingsonderzoeken of consultatiediensten bij proefpersonen die WGS ontvingen in vergelijking met die in HC
|
Tot 4 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Gerard Vockley, MD, PhD, University of Pittsburgh
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
13 juli 2020
Primaire voltooiing (Geschat)
1 februari 2027
Studie voltooiing (Geschat)
1 juni 2027
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
13 april 2021
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
13 april 2021
Eerst geplaatst (Werkelijk)
19 april 2021
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
9 januari 2026
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
7 januari 2026
Laatst geverifieerd
1 januari 2026
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- STUDY19050319
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
NEE
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Nee
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Nee
product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.
Nee
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .