Секвенирование генома в отделении интенсивной терапии (PISCES)
7 января 2026 г. обновлено: Jerry Vockley, MD, PhD
Цель этого исследования — понять, как использование полногеномного секвенирования (WGS) может повысить скорость постановки диагноза пациентам в отделениях интенсивной терапии.
Это не оценка нового устройства, теста или технологии.
Этот проект представляет собой исследование полезности этой технологии в клинической помощи по сравнению с тестированием стандартной медицинской помощи.
В исследовании будет рассмотрена возможность более быстрой диагностики пациента (время постановки диагноза и эффективность тестирования) по сравнению со стандартным тестированием.
В исследовании также будет рассмотрено влияние WGS на результаты лечения пациентов и стоимость клинической помощи.
Обзор исследования
Статус
Запись по приглашению
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Это обсервационное исследование, целью которого является понять, увеличивает ли использование полногеномного секвенирования (WGS) скорость постановки диагноза и как меняется клиническое ведение новорожденных в отделении интенсивной терапии. В этом проекте используются утвержденные методы секвенирования генома в центрах, сертифицированных CLIA.
- У новорожденных, которые имеют право на участие и чьи родители согласны на участие в исследовании, возьмут образец крови, который будет отправлен на WGS и биоинформатический анализ, сначала отфильтровав целевую панель из 1722 генов, которые с наибольшей вероятностью вызывают генетические нарушения в первый год жизни, а затем с полным экзомным фильтром, если не установлен явный диагноз с использованием фильтра панели генов 1722. Тестирование проводится в лаборатории, сертифицированной CLIA. Патогенные, вероятно-патогенные и варианты с неопределенной значимостью в генах, связанных с клиническими особенностями ребенка, будут возвращены лечащей группе и родителям в условиях генетического консультирования для использования в клиническом принятии решения о ведении. Отчет добавляется в EMR новорожденных. Согласие будет включать разрешение на доступ к финансовым записям госпитализации, чтобы сравнить затраты и продолжительность пребывания с соответствующими контрольными параметрами.
- У родителей идентифицированных новорожденных, давших согласие на исследование с целью анализа трио, будут собраны образцы, которые будут подвергнуты одновременному анализу с ребенком, чтобы помочь в определении патогенности вариантов в геномном секвенировании. Патогенные и вероятно-патогенные вторичные результаты в поздних генах ACMG 59 с медицинским действием будут сообщены родителям в условиях генетического консультирования, ТОЛЬКО если родители согласятся узнать эти результаты И они будут идентифицированы у ребенка.
- У братьев и сестер участвующих новорожденных, если это необходимо для интерпретации генетических исследований новорожденного, будут взяты образцы для использования в генетическом анализе. О патогенных и вероятно-патогенных результатах детских расстройств сообщат родителям в условиях генетического консультирования.
- Исторические элементы управления будут определены и сопоставлены с участниками исследования. Исторический контроль будет включать младенцев в отделении интенсивной терапии, которым была назначена консультация генетика во время их первоначального поступления в течение предшествующих 24 месяцев. Сопоставление между участниками исследования и совпадающими контролями будет выполняться с использованием показателей склонности. Мы применим модель логистической регрессии к объединенным экспериментальным и контрольным группам, а затем будем использовать сопоставление ближайших соседей для создания совпадающих пар. Сопоставление поможет уменьшить смещение и увеличить мощность для обнаружения истинных эффектов. Эти элементы управления будут использоваться только для финансового анализа и анализа продолжительности пребывания; генетическое тестирование этой когорты проводиться не будет.
Тип исследования
Интервенционный
Регистрация (Оцененный)
400
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
Pennsylvania
-
Pittsburgh, Pennsylvania, Соединенные Штаты, 15224
- UPMC Children's Hospital of Pittsburgh
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Не старше 2 года (Ребенок)
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Описание
Критерии включения:
Новорожденные: чтобы получить приглашение на участие, новорожденный должен соответствовать всем следующим критериям:
- Гестационный возраст более 24 недель
- Вес при рождении более 600 грамм
- Госпитализирован в отделение интенсивной терапии детской больницы UPMC (CHP) и/или женской больницы Magee.
- Возможность генетического расстройства, основанная на признаках, симптомах и лабораторных показателях, инициирующая официальную консультацию клинической медицинской генетики со стороны клинической бригады.
- Проводится сортировкой PI или другими исследователями и приоритетом для внедрения этого исследования на основе конкретных клинических проблем пациента.
- Документально подтвержденное информированное согласие родителей/опекунов
- Родители: родитель новорожденного, отвечающий вышеуказанным критериям включения и давший согласие на участие в исследовании.
- Братья и сестры: братья и сестры новорожденного, которые соответствуют вышеуказанным критериям включения и которые дали согласие на участие в исследовании. Братья и сестры будут набраны только в том случае, если будет определено, что их участие необходимо для точной интерпретации результатов генетических исследований новорожденного.
- Исторические контроли: лица, которые были оценены компанией Medical Genetics в течение последних 24 месяцев и которые соответствуют критериям для сопоставленных контролей, как определено сопоставлением показателей склонности.
Критерий исключения:
Новорожденные: лицо, отвечающее любому из следующих критериев, будет исключено из участия в этом исследовании:
- Имеет известный этиологический диагноз (например, пренатальное тестирование)
- Имеет серьезные врожденные аномалии (почечные, сердечные, печеночные, неврологические или легочные пороки развития), связанные с хромосомными аномалиями, обнаруженными при пренатальном тестировании (например, УЗИ, генетическое тестирование)
- Секвенирование отправлено после рождения по любой другой причине, кроме консультации генетика, которая инициирует исследование.
- Наличие документированной значительной врожденной инфекции (например, врожденный цитомегаловирус)
Родители:
- Не является биологическим родителем выявленного новорожденного
- Не исключено участие родителей. Однако, если родитель моложе 18 лет, этих лиц попросят дать согласие на участие в исследовании, а их родителей попросят предоставить разрешение/согласие на участие несовершеннолетнего родителя.
- Предыдущее генетическое тестирование не исключает участия родителя в этом исследовании.
Братья и сестры:
- Не является биологическим братом или сестрой новорожденного, отвечающего критериям включения
- Не требуется для точной интерпретации неонатальных результатов
- Предыдущее генетическое тестирование не исключает участие брата или сестры в этом исследовании.
- Исторический контроль: не наблюдалось в течение последних 24 месяцев и/или не соответствует критериям соответствующего контроля, как определено сопоставлением показателей склонности. Часть этого сопоставления требует, чтобы исторический контроль был сопоставлен с участником исследования по возрасту, поэтому они будут выбраны на основе всех критериев соответствия и будут исключены, если они не соответствуют критериям, включая возраст.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Основная цель: Диагностика
- Распределение: Н/Д
- Интервенционная модель: Одногрупповое задание
- Маскировка: Нет (открытая этикетка)
Оружие и интервенции
Группа участников / Армия |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Другой: Тестирование неонатального WGS
У новорожденных, которые имеют право на участие и чьи родители согласны на исследование, будет взят образец крови, который будет отправлен на полногеномное секвенирование и биоинформатический анализ, сначала отфильтровав целевую панель из 1722 генов, которые с наибольшей вероятностью вызывают генетические нарушения в первый год жизни, а затем с полным экзомным фильтром, если не установлен явный диагноз с использованием фильтра панели генов 1722.
|
Новорожденным будет проведено секвенирование всего генома и анализ целевой панели генов, которые могут вызывать генетические нарушения в первый год жизни. Если диагноз не установлен, секвенированные данные будут проанализированы с использованием полного экзомного фильтра. Выполняется в лаборатории, сертифицированной CLIA. Патогенный, вероятно патогенный и VUS в генах, связанных с фенотипом, будут возвращены команде по уходу и семье. Родители будут зарегистрированы для анализа трио с ребенком, чтобы помочь в определении патогенности вариантов в геномном секвенировании. Патогенные и вероятно-патогенные результаты будут сообщены родителям в условиях генетического консультирования. Братья и сестры будут зарегистрированы, и у них будут взяты образцы для использования в генетическом анализе только в том случае, если это будет сочтено необходимым. Результаты будут сообщены родителям в условиях генетического консультирования. |
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Подтвержденный диагноз
Временное ограничение: До 4 лет
|
Категориальный Да/Нет подтвержденный диагноз у новорожденного участника, обнаруженного с WGS, по сравнению с результатами стандартного лечения (SOC) или с данными, наблюдаемыми в историческом контроле (HC)
|
До 4 лет
|
|
Скорость диагностики
Временное ограничение: До 4 лет
|
Частота диагностики при анализе с помощью WGS, специфического для новорожденных генного фильтра 1722, по сравнению с полным экзомным фильтром
|
До 4 лет
|
|
Время диагностики
Временное ограничение: До 4 лет
|
Время до диагностики в днях с WGS по сравнению с тестированием SOC или HC
|
До 4 лет
|
|
Клиническая полезность WGS
Временное ограничение: До 4 лет
|
Клиническая полезность WGS (например,
изменения в управлении уходом) по сравнению с SOC или HC.
Клиническая полезность оценивается врачом, занимающимся лечением, после получения результатов по шкале Лайкерта (1 — совсем не полезно, 2 — не очень полезно, 3 — нейтрально, 4 — полезно, 5 — очень полезно).
|
До 4 лет
|
|
Оценка стоимости ухода
Временное ограничение: До 4 лет
|
Общая стоимость ухода в долларах для тех, кто получает WGS, по сравнению с HC
|
До 4 лет
|
|
Продолжительность пребывания
Временное ограничение: До 4 лет
|
Общая продолжительность пребывания в больнице в днях у получающих WGS по сравнению с HC
|
До 4 лет
|
|
Необходимость медицинского использования
Временное ограничение: До 4 лет
|
Количество крупных медицинских процедур, визуализационных исследований или консультационных услуг у субъектов, получающих WGS, по сравнению с пациентами, получающими HC
|
До 4 лет
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Gerard Vockley, MD, PhD, University of Pittsburgh
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
13 июля 2020 г.
Первичное завершение (Оцененный)
1 февраля 2027 г.
Завершение исследования (Оцененный)
1 июня 2027 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
13 апреля 2021 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
13 апреля 2021 г.
Первый опубликованный (Действительный)
19 апреля 2021 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
9 января 2026 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
7 января 2026 г.
Последняя проверка
1 января 2026 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- STUDY19050319
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕТ
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
продукт, произведенный в США и экспортированный из США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .