Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Genomsekvensering i intensivvårdsavdelningens population (PISCES)

7 januari 2026 uppdaterad av: Jerry Vockley, MD, PhD
Syftet med denna studie är att förstå hur användningen av helgenomsekvensering (WGS) kan kunna öka hastigheten med vilken en diagnos ställs för patienter i en intensivvårdsavdelning. Detta är inte en bedömning av en ny enhet, test eller teknik. Detta projekt är en undersökning av användbarheten av denna teknik i klinisk vård jämfört med standardvårdstestning. Studien kommer att titta på förmågan att snabbare diagnostisera en patient (tid till diagnos och effektivitet av testning) jämfört med standardvårdstestning. Studien kommer också att titta på effekten av WGS på patientresultat och kostnader för klinisk vård.

Studieöversikt

Status

Anmälan via inbjudan

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljerad beskrivning

Detta är en observationsstudie för att förstå om användningen av helgenomsekvensering (WGS) ökar hastigheten till diagnos och hur den kliniska behandlingen förändras i en intensivvårdspopulation av nyfödda. Detta projekt använder godkända genomsekvenseringsmetoder vid CLIA-certifierade anläggningar.

  1. Nyfödda försökspersoner som är berättigade och vars föräldrar samtycker till studien kommer att genomgå ett blodprov som kommer att skickas för WGS och bioinformatikanalys, filtrering först med en riktad panel av 1722 gener som mest sannolikt orsakar genetiska störningar under det första levnadsåret, och sedan med ett helt exomfilter om ingen uppenbar diagnos fastställs med hjälp av 1722-genpanelfiltret. Testning genomförs i ett CLIA-certifierat laboratorium. Patogena, sannolikt patogena och varianter av osäker betydelse i gener relaterade till barnets kliniska egenskaper kommer att återlämnas till vårdteamet och till föräldrarna i samband med genetisk rådgivning för användning i kliniskt beslutsfattande om hantering. En rapport läggs till EMR för nyfödda. Samtycke kommer att innefatta tillstånd att få tillgång till finansiella register över sjukhusvistelsen, att jämföra kostnader och vistelsetid med matchade kontroller.
  2. Föräldrar till identifierade nyfödda som samtycker till studien för trioanalys kommer att få prover insamlade som kommer att genomgå samtidig analys med barnet för att hjälpa till att bestämma patogeniciteten hos varianter i genomisk sekvensering. Patogena och sannolikt patogena sekundära fynd i ACMG 59 senare medicinskt verksamma gener kommer att rapporteras till föräldrarna i samband med genetisk rådgivning ENDAST om föräldrarna väljer att lära sig dessa resultat OCH de identifieras i barnet.
  3. Syskon till deltagande nyfödda, om det behövs för tolkning av den nyföddas genetiska studier, kommer att få prover samlade för användning i den genetiska analysen. Patogena och sannolikt patogena resultat vid sjukdomar som debuterar i barndomen kommer att rapporteras till föräldrarna i samband med genetisk rådgivning.
  4. Historiska kontroller kommer att identifieras och matchas till studiedeltagare. Historiska kontroller kommer att inkludera spädbarn på intensivvårdsavdelningen som har beställt en genetisk konsultation under deras första inläggning under de föregående 24 månaderna. Matchning mellan studiedeltagare och matchade kontroller kommer att utföras med hjälp av Propensity Scores. Vi kommer att anpassa en logistisk regressionsmodell till de kombinerade behandlings- och kontrollgrupperna och kommer sedan att använda närmaste grannmatchning för att skapa matchade par. Matchningen hjälper till att minska bias och öka kraften för att upptäcka verkliga effekter. Dessa kontroller kommer endast att användas för analyser av skatte- och vistelselängd; inga genetiska tester kommer att göras på denna kohort.

Studietyp

Interventionell

Inskrivning (Beräknad)

400

Fas

  • Inte tillämpbar

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

  • Förenta staterna
    • Pennsylvania
      • Pittsburgh, Pennsylvania, Förenta staterna, 15224
        • UPMC Children's Hospital of Pittsburgh

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

Inte äldre än 2 år (Barn)

Tar emot friska volontärer

Nej

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Nyfödda: För att bli kontaktad för att delta måste en nyfödd uppfylla alla följande kriterier:

    1. Mer än 24 veckors graviditetsålder
    2. Födelsevikt större än 600 gram
    3. Inlagd på intensivvårdsavdelningen på UPMC Children's Hospital (CHP) och/eller Magee Women's Hospital
    4. Möjlighet till en genetisk störning baserad på tecken, symtom och laboratorievärden som utlöser en formell klinisk medicinsk genetikkonsultation av det kliniska vårdteamet.
    5. Triagerad av PI eller deltagande medutredare och prioriterad till introduktion av denna forskningsstudie baserad på patientspecifika kliniska problem
    6. Dokumenterat informerat samtycke från förälder/vårdnadshavare
  • Föräldrar: Förälder till en nyfödd som uppfyller ovanstående inklusionskriterier och som har gett sitt samtycke att delta i studien.
  • Syskon: Syskon till en nyfödd som uppfyller ovanstående inklusionskriterier och som har getts samtycke att delta i studien. Syskon kommer endast att rekryteras om deras deltagande har bedömts vara avgörande för en korrekt tolkning av det nyfödda barnets genetiska studier.
  • Historiska kontroller: Individer som har utvärderats av Medical Genetics under de senaste 24 månaderna och som uppfyller kriterierna för matchade kontroller enligt definitionen av matchning av benägenhetspoäng.

Exklusions kriterier:

  • Nyfödda: En individ som uppfyller något av följande kriterier kommer att uteslutas från att delta i denna studie:

    1. Har en känd etiologisk diagnos (t. prenatal testning)
    2. Har en allvarlig medfödd anomali (njur-, hjärt-, lever-, neurologiska eller pulmonella missbildningar) associerad med en kromosomavvikelse som upptäckts vid prenatal testning (t. ultraljud, genetisk testning)
    3. Sekvensering skickas efter födseln av någon annan anledning än den genetiska konsultationen som utlöser studien
    4. Förekomst av dokumenterad betydande medfödd infektion (t.ex. medfödda cytomegalovirus)

  • Föräldrar:

    1. Är inte den biologiska föräldern till den identifierade nyfödda
    2. Det finns inget undantag för föräldrarnas medverkan. Om föräldern är yngre än 18 år kommer dessa individer att bli ombedda att ge sitt samtycke till studien och deras förälder/föräldrar kommer att uppmanas att ge tillstånd/samtycke för den minderåriga förälderns deltagande
    3. Att ha genomgått genetiska tester utesluter inte föräldern från att delta i denna studie.

  • Syskon:

    1. Är inte ett biologiskt syskon till en nyfödd som uppfyller inklusionskriterierna
    2. Krävs inte för korrekt tolkning av nyfödda resultat
    3. Att ha genomgått genetiska tester utesluter inte syskonen från att delta i denna studie.
  • Historisk kontroll: Har inte setts under de senaste 24 månaderna och/eller uppfyller inte kriterierna för matchad kontroll enligt definitionen av matchning av benägenhetspoäng. En del av denna matchning kräver att den historiska kontrollen matchas med en studiedeltagare baserat på ålder, så de kommer att väljas utifrån alla matchningskriterier och kommer att uteslutas om de inte uppfyller kriterierna, inklusive ålder.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Primärt syfte: Diagnostisk
  • Tilldelning: N/A
  • Interventionsmodell: Enskild gruppuppgift
  • Maskning: Ingen (Open Label)

Vapen och interventioner

Deltagargrupp / Arm
Intervention / Behandling
Övrig: WGS-testning för nyfödda
Nyfödda försökspersoner som är berättigade och vars föräldrar samtycker till studier kommer att genomgå blodprover som kommer att skickas för helgenomsekvensering och bioinformatikanalys, filtrering först en riktad panel av 1722 gener som mest sannolikt orsakar genetiska störningar under det första levnadsåret, och sedan med ett helt exomfilter om ingen uppenbar diagnos bestäms med hjälp av 1722-genpanelfiltret.
Diagnostiskt test: WGS-testning för nyfödda

Nyfödda kommer att genomgå sekvensering av hela genomet och analys med en riktad panel av gener som sannolikt kan orsaka genetiska störningar under det första levnadsåret. Om ingen diagnos identifieras kommer sekvenserade data att analyseras med ett helt exomfilter. Utförs i ett CLIA-certifierat labb. Patogena, sannolikt patogena och VUS i gener relaterade till fenotypen kommer att returneras till vårdteamet och familjen.

Föräldrar kommer att registreras för trioanalys med barnet för att hjälpa till att bestämma patogeniciteten hos varianter i genomisk sekvensering. Patogena och sannolikt patogena fynd kommer att rapporteras till föräldrarna i samband med genetisk rådgivning.

Syskon kommer att registreras och få prover samlade för användning i den genetiska analysen endast om det anses nödvändigt. Resultaten kommer att rapporteras till föräldrarna i samband med genetisk rådgivning.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Bekräftad diagnos
Tidsram: Upp till 4 år
Kategorisk Y/N bekräftad diagnos hos den nyfödda deltagaren upptäckt med WGS, jämfört med resultat från standardvård (SOC) eller som sett i den historiska kontrollen (HC)
Upp till 4 år
Diagnostisk frekvens
Tidsram: Upp till 4 år
Diagnostisk frekvens med analys via WGS, det 1722 neonatalspecifika genfiltret, vs hela exomfiltret
Upp till 4 år
Dags för diagnos
Tidsram: Upp till 4 år
Tid till diagnos i dagar med WGS jämfört med SOC-testning eller HC
Upp till 4 år
Clinical Utility av WGS
Tidsram: Upp till 4 år
Klinisk användbarhet av WGS (t.ex. förändringar i vårdledning) jämfört med SOC eller HC. Klinisk användbarhet bedöms av en läkare som är involverad i fall efter att resultaten har återkommit med hjälp av en Likert-skala (1 - Inte användbart alls, 2 - Inte mycket användbart, 3 - Neutralt, 4 - Användbart, 5 - Mycket användbart)
Upp till 4 år
Vårdkostnadsvärdering
Tidsram: Upp till 4 år
Total vårdkostnad i dollar för dem som får WGS jämfört med HC
Upp till 4 år
Vistelsetid
Tidsram: Upp till 4 år
Total längd på sjukhusvistelse i dagar hos de som fick WGS jämfört med HC
Upp till 4 år
Behov av medicinsk användning
Tidsram: Upp till 4 år
Antalet större medicinska ingrepp, avbildningsstudier eller möten med konsulttjänster hos patienter som får WGS jämfört med de i HC
Upp till 4 år

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

Jerry Vockley, MD, PhD

Utredare

  • Huvudutredare: Gerard Vockley, MD, PhD, University of Pittsburgh

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

13 juli 2020

Primärt slutförande (Beräknad)

1 februari 2027

Avslutad studie (Beräknad)

1 juni 2027

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

13 april 2021

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

13 april 2021

Första postat (Faktisk)

19 april 2021

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

9 januari 2026

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

7 januari 2026

Senast verifierad

1 januari 2026

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Nyckelord

Ytterligare relevanta MeSH-villkor

Andra studie-ID-nummer

  • STUDY19050319

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

NEJ

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

produkt tillverkad i och exporterad från U.S.A.

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera