Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Genomsekvensering i intensivavdelingens befolkning (PISCES)

7. januar 2026 oppdatert av: Jerry Vockley, MD, PhD
Hensikten med denne studien er å forstå hvordan bruk av helgenomsekvensering (WGS) kan være i stand til å øke hastigheten som en diagnose stilles for pasienter i en intensivavdeling. Dette er ikke en vurdering av en ny enhet, test eller teknologi. Dette prosjektet er en undersøkelse av nytten av denne teknologien i klinisk omsorg sammenlignet med standardbehandlingstesting. Studien vil se på evnen til raskere å diagnostisere en pasient (tid til diagnose og effektivitet av testing) sammenlignet med standardbehandlingstesting. Studien vil også se på virkningen av WGS på pasientutfall og kostnader ved klinisk behandling.

Studieoversikt

Status

Påmelding etter invitasjon

Forhold

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

Dette er en observasjonsstudie for å forstå om bruken av helgenomsekvensering (WGS) øker hastigheten til diagnose og hvordan klinisk behandling endres i en intensivgruppe av nyfødte. Dette prosjektet bruker godkjente genomsekvenseringsmetoder ved CLIA-sertifiserte anlegg.

  1. Nyfødte forsøkspersoner som er kvalifisert og hvis foreldre samtykker til studien vil gjennomgå en blodprøve som vil bli sendt for WGS og bioinformatikkanalyse, filtrering først med et målrettet panel av 1722 gener som mest sannsynlig vil forårsake genetiske lidelser i det første leveåret, og deretter med et helt eksomfilter hvis ingen åpenbar diagnose er bestemt ved å bruke 1722-genpanelfilteret. Testingen gjennomføres i et CLIA-sertifisert laboratorium. Patogene, sannsynlig-patogene og varianter av usikker betydning i gener relatert til barnets kliniske trekk vil bli returnert til omsorgsteamet og til foreldrene i sammenheng med genetisk rådgivning for bruk i klinisk beslutningstaking om ledelse. En rapport er lagt til nyfødte EMR. Samtykke vil inkludere tillatelse til å få tilgang til økonomiske journaler over sykehusinnleggelsen, for å sammenligne kostnader og oppholdstid med samsvarende kontroller.
  2. Foreldre til identifiserte nyfødte som samtykker til studien med henblikk på trioanalyse vil få innsamlet prøver som vil gjennomgå samtidig analyse med barnet for å hjelpe til med å bestemme patogenisiteten til varianter i genomisk sekvensering. Patogene og sannsynlig patogene sekundære funn i ACMG 59 senere medisinsk virkningsfulle gener vil bli rapportert til foreldrene i forbindelse med genetisk rådgivning KUN hvis foreldrene velger å lære disse resultatene OG de blir identifisert hos barnet.
  3. Søsken til deltakende nyfødte, hvis det er nødvendig for tolkning av den nyfødtes genetiske studier, vil få innsamlet prøver for bruk i den genetiske analysen. Patogene og sannsynlige patogene resultater ved lidelser som oppstår i barndommen vil bli rapportert til foreldrene i forbindelse med genetisk veiledning.
  4. Historiske kontroller vil bli identifisert og tilpasset studiedeltakerne. Historiske kontroller vil inkludere spedbarn på intensivavdelingen som har bestilt en genetisk konsultasjon under deres første innleggelse de siste 24 månedene. Matching mellom studiedeltakere og matchede kontroller vil bli utført ved å bruke Propensity Scores. Vi vil tilpasse en logistisk regresjonsmodell til de kombinerte behandlings- og kontrollgruppene, og vil deretter bruke nærmeste nabomatching for å lage matchede par. Matchingen vil bidra til å redusere skjevhet og øke kraften til å oppdage sanne effekter. Disse kontrollene vil kun bli brukt til analyser av finans- og oppholdstid; ingen genetisk testing vil bli utført på denne kohorten.

Studietype

Intervensjonell

Registrering (Antatt)

400

Fase

  • Ikke aktuelt

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

  • Forente stater
    • Pennsylvania
      • Pittsburgh, Pennsylvania, Forente stater, 15224
        • UPMC Children's Hospital of Pittsburgh

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

Ikke eldre enn 2 år (Barn)

Tar imot friske frivillige

Nei

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Nyfødte: For å bli kontaktet for å delta, må en nyfødt oppfylle alle følgende kriterier:

    1. Svangerskapsalder over 24 uker
    2. Fødselsvekt større enn 600 gram
    3. Innlagt på intensivavdelingen ved UPMC Children's Hospital (CHP) og/eller Magee Women's Hospital
    4. Mulighet for en genetisk lidelse basert på tegn, symptomer og laboratorieverdier som utløser en formell klinisk medisinsk genetikkkonsultasjon av det kliniske omsorgsteamet.
    5. Triagert av PI eller deltakende medetterforskere og prioritert til introduksjon av denne forskningsstudien basert på pasientspesifikke kliniske bekymringer
    6. Dokumentert informert samtykke fra foresatte
  • Foreldre: Foreldre til en nyfødt som oppfyller inklusjonskriteriene ovenfor og som har fått samtykke til å delta i studien.
  • Søsken: Søsken av en nyfødt som oppfyller inklusjonskriteriene ovenfor og som har fått samtykke til å delta i studien. Søsken vil kun bli rekruttert dersom det er fastslått at deres deltakelse er avgjørende for nøyaktig tolkning av den nyfødtes genetiske studier.
  • Historiske kontroller: Individer som har blitt evaluert av Medical Genetics i løpet av de siste 24 månedene og som oppfyller kriteriene for matchede kontroller som definert av tilbøyelighetsscore-matching.

Ekskluderingskriterier:

  • Nyfødte: En person som oppfyller noen av følgende kriterier vil bli ekskludert fra å delta i denne studien:

    1. Har en kjent etiologisk diagnose (f. prenatal testing)
    2. Har en alvorlig medfødt anomali (nyre-, hjerte-, lever-, nevrologiske eller pulmonale misdannelser) assosiert med en kromosomavvik påvist ved prenatal testing (f. ultralyd, genetisk testing)
    3. Sekvensering sendt etter fødselen av andre grunner enn den genetiske konsultasjonen som utløser studien
    4. Tilstedeværelse av dokumentert betydelig medfødt infeksjon (f.eks. medfødt cytomegalovirus)

  • Foreldre:

    1. Er ikke den biologiske forelderen til den identifiserte nyfødte
    2. Det er ingen unntak for foreldredeltakelse. Hvis forelderen er under 18 år, vil imidlertid disse personene bli bedt om å samtykke til studien og deres forelder(e) vil bli bedt om å gi tillatelse/samtykke for den mindreårige forelderens deltakelse
    3. Tidligere genetisk testing utelukker ikke forelderen fra å delta i denne studien.

  • Søsken:

    1. Er ikke et biologisk søsken til en nyfødt som oppfyller inklusjonskriteriene
    2. Er ikke nødvendig for nøyaktig tolkning av nyfødte resultater
    3. Å ha gjennomgått genetisk testing utelukker ikke søsken fra å delta i denne studien.
  • Historisk kontroll: Har ikke blitt sett i løpet av de siste 24 månedene og/eller oppfyller ikke kriteriene for matchet kontroll som definert av matching av tilbøyelighetspoeng. En del av denne matchingen krever at den historiske kontrollen matches med en studiedeltaker basert på alder, og dermed vil de bli valgt basert på alle samsvarskriterier og vil bli ekskludert hvis de ikke oppfyller kriteriene, inkludert alder.

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Primært formål: Diagnostisk
  • Tildeling: N/A
  • Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
  • Masking: Ingen (Open Label)

Våpen og intervensjoner

Deltakergruppe / Arm
Intervensjon / Behandling
Annen: Nyfødt WGS-testing
Nyfødte forsøkspersoner som er kvalifisert og hvis foreldre samtykker til å studere, vil gjennomgå blodprøvetaking som vil bli sendt for helgenomsekvensering og bioinformatikkanalyse, filtrering først et målrettet panel av 1722 gener som mest sannsynlig vil forårsake genetiske lidelser i det første leveåret, og deretter med et helt eksomfilter hvis ingen åpenbar diagnose er bestemt ved å bruke 1722-genpanelfilteret.
Diagnostisk test: Nyfødt WGS-testing

Nyfødte vil gjennomgå sekvensering av hele genomet og analyser med et målrettet panel av gener som sannsynligvis vil forårsake genetiske lidelser i det første leveåret. Hvis ingen diagnose blir identifisert, vil sekvenserte data bli analysert ved hjelp av et helt eksomfilter. Utført i et CLIA-sertifisert laboratorium. Patogen, sannsynlig patogen og VUS i gener relatert til fenotypen vil bli returnert til omsorgsteamet og familien.

Foreldre vil bli registrert for trioanalyse med barnet for å hjelpe til med å bestemme patogenisiteten til varianter i genomisk sekvensering. Patogene og sannsynlig patogene funn vil bli rapportert til foreldrene i forbindelse med genetisk veiledning.

Søsken vil bli registrert og få innsamlet prøver for bruk i den genetiske analysen bare hvis det anses som nødvendig. Resultatene vil bli rapportert til foreldrene i forbindelse med genetisk veiledning.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Bekreftet diagnose
Tidsramme: Inntil 4 år
Kategorisk J/N bekreftet diagnose hos den nyfødte deltakeren påvist med WGS, sammenlignet med resultater fra standardbehandling (SOC) eller som sett i den historiske kontrollen (HC)
Inntil 4 år
Diagnostisk rate
Tidsramme: Inntil 4 år
Diagnostisk rate med analyse via WGS, det 1722 neonatale spesifikke genfilteret, vs hele eksomfilteret
Inntil 4 år
Tid for diagnose
Tidsramme: Inntil 4 år
Tid til diagnose i dager med WGS sammenlignet med SOC-testing eller HC
Inntil 4 år
Klinisk nytte av WGS
Tidsramme: Inntil 4 år
Klinisk nytte av WGS (f.eks. endringer i omsorgsledelse) sammenlignet med SOC eller HC. Klinisk nytte er vurdert av en lege som er involvert i tilfelle etter returnering av resultater ved hjelp av en Likert-skala (1 - Ikke nyttig i det hele tatt, 2 - Ikke veldig nyttig, 3 - Nøytral, 4 - Nyttig, 5 - Veldig nyttig)
Inntil 4 år
Omsorgskostnadsevaluering
Tidsramme: Inntil 4 år
Totale omsorgskostnader i dollar hos de som mottar WGS sammenlignet med HC
Inntil 4 år
Lengden på oppholdet
Tidsramme: Inntil 4 år
Total lengde på sykehusopphold i dager hos de som mottar WGS sammenlignet med HC
Inntil 4 år
Behov for medisinsk bruk
Tidsramme: Inntil 4 år
Antall store medisinske prosedyrer, bildebehandlingsstudier eller konsulenttjenester møter hos forsøkspersoner som mottar WGS sammenlignet med de i HC
Inntil 4 år

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Jerry Vockley, MD, PhD

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Gerard Vockley, MD, PhD, University of Pittsburgh

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

13. juli 2020

Primær fullføring (Antatt)

1. februar 2027

Studiet fullført (Antatt)

1. juni 2027

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

13. april 2021

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

13. april 2021

Først lagt ut (Faktiske)

19. april 2021

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

9. januar 2026

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

7. januar 2026

Sist bekreftet

1. januar 2026

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Nøkkelord

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • STUDY19050319

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

NEI

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

produkt produsert i og eksportert fra USA

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere