- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT04848090
Séquençage du génome dans la population des unités de soins intensifs (PISCES)
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Il s'agit d'une étude observationnelle visant à comprendre si l'utilisation du séquençage du génome entier (WGS) augmente la vitesse de diagnostic et comment la prise en charge clinique est modifiée dans une population de nouveau-nés en soins intensifs. Ce projet utilise des méthodes approuvées de séquençage du génome dans des installations certifiées CLIA.
- Les sujets nouveau-nés éligibles et dont les parents consentent à l'étude subiront un prélèvement sanguin qui sera envoyé pour analyse WGS et bioinformatique, en filtrant d'abord avec un panel ciblé de 1722 gènes les plus susceptibles de provoquer des troubles génétiques au cours de la première année de vie, puis avec un filtre d'exome entier si aucun diagnostic évident n'est déterminé à l'aide du filtre de panel de gènes 1722. Les tests sont effectués dans un laboratoire certifié CLIA. Les pathogènes, les pathogènes probables et les variants de signification incertaine dans les gènes liés aux caractéristiques cliniques de l'enfant seront renvoyés à l'équipe de soins et aux parents dans le cadre du conseil génétique pour être utilisés dans la prise de décision clinique concernant la prise en charge. Un rapport est ajouté au DME du nouveau-né. Le consentement comprendra l'autorisation d'accéder aux dossiers financiers de l'hospitalisation, de comparer les coûts et la durée du séjour à des contrôles appariés.
- Les parents des nouveau-nés identifiés qui consentent à l'étude aux fins de l'analyse du trio auront des échantillons prélevés qui seront soumis à une analyse simultanée avec l'enfant pour aider à déterminer la pathogénicité des variants dans le séquençage génomique. Les résultats secondaires pathogènes et probablement pathogènes dans les gènes ACMG 59 d'apparition ultérieure médicalement exploitables seront signalés aux parents dans le cadre du conseil génétique UNIQUEMENT si les parents acceptent d'apprendre ces résultats ET qu'ils sont identifiés chez l'enfant.
- Les frères et sœurs des nouveau-nés participants, si nécessaire pour l'interprétation des études génétiques du nouveau-né, auront des échantillons prélevés pour être utilisés dans l'analyse génétique. Les résultats pathogènes et probablement pathogènes dans les troubles apparaissant dans l'enfance seront signalés aux parents dans le cadre d'un conseil génétique.
- Les contrôles historiques seront identifiés et appariés aux participants à l'étude. Les contrôles historiques incluront les nourrissons en soins intensifs ayant une consultation génétique commandée lors de leur admission initiale au cours des 24 mois précédents. L'appariement entre les participants à l'étude et les témoins appariés sera effectué à l'aide des scores de propension. Nous ajusterons un modèle de régression logistique aux groupes de traitement et de contrôle combinés, puis utiliserons l'appariement du voisin le plus proche pour créer des paires appariées. L'appariement aidera à réduire les biais et à augmenter la puissance pour détecter les vrais effets. Ces contrôles ne seront utilisés que pour les analyses fiscales et de durée de séjour ; aucun test génétique ne sera effectué sur cette cohorte.
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Phase
- N'est pas applicable
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
-
-
Pennsylvania
-
Pittsburgh, Pennsylvania, États-Unis, 15224
- UPMC Children's Hospital of Pittsburgh
-
-
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
La description
Critère d'intégration:
Nouveau-nés : Afin d'être approché pour participer, un nouveau-né doit répondre à tous les critères suivants :
- Plus de 24 semaines d'âge gestationnel
- Poids de naissance supérieur à 600 grammes
- Admis à l'unité de soins intensifs de l'hôpital pour enfants de l'UPMC (CHP) et/ou de l'hôpital pour femmes de Magee
- Possibilité d'un trouble génétique basé sur des signes, des symptômes et des valeurs de laboratoire déclenchant une consultation formelle de génétique médicale clinique par l'équipe de soins cliniques.
- Triage par PI ou co-chercheurs présents et priorité à l'introduction de cette étude de recherche en fonction des préoccupations cliniques spécifiques au patient
- Consentement éclairé documenté du parent/tuteur
- Parents : parent d'un nouveau-né qui répond aux critères d'inclusion ci-dessus et qui a été autorisé à participer à l'étude.
- Frères et sœurs : frères et sœurs d'un nouveau-né qui répondent aux critères d'inclusion ci-dessus et qui ont été autorisés à participer à l'étude. Les frères et sœurs ne seront recrutés que si leur participation a été jugée essentielle à l'interprétation précise des études génétiques du nouveau-né.
- Témoins historiques : personnes qui ont été évaluées par Medical Genetics au cours des 24 derniers mois et qui répondent aux critères des témoins appariés tels que définis par l'appariement du score de propension.
Critère d'exclusion:
Nouveau-nés : Une personne qui répond à l'un des critères suivants sera exclue de la participation à cette étude :
- A un diagnostic étiologique connu (par ex. dépistage prénatal)
- A une anomalie congénitale majeure (malformations rénales, cardiaques, hépatiques, neurologiques ou pulmonaires) associée à une anomalie chromosomique détectée lors des tests prénataux (ex. échographie, tests génétiques)
- Séquençage envoyé après la naissance pour toute autre raison que la consultation génétique qui déclenche l'étude
- Présence d'une infection congénitale significative documentée (par ex. cytomégalovirus congénital)
Parents:
- N'est pas le parent biologique du nouveau-né identifié
- Il n'y a aucune exclusion pour la participation des parents. Si le parent a moins de 18 ans, cependant, ces personnes seront invitées à donner leur consentement à l'étude et leur(s) parent(s) sera(ont) invité(s) à fournir l'autorisation/le consentement pour la participation du parent mineur.
- Le fait d'avoir déjà subi des tests génétiques n'empêche pas le parent de participer à cette étude.
Frères et sœurs:
- N'est pas un frère ou une sœur biologique d'un nouveau-né qui répond aux critères d'inclusion
- N'est pas nécessaire pour une interprétation précise des résultats du nouveau-né
- Le fait d'avoir déjà subi des tests génétiques n'exclut pas que le frère ou la sœur participe à cette étude.
- Témoin historique : n'a pas été vu au cours des 24 derniers mois et/ou ne répond pas aux critères de contrôle apparié tels que définis par l'appariement du score de propension. Une partie de cet appariement nécessite que le témoin historique soit apparié à un participant à l'étude en fonction de l'âge, il sera donc sélectionné en fonction de tous les critères d'appariement et sera exclu s'il ne répond pas aux critères, y compris l'âge.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Objectif principal: Diagnostique
- Répartition: N / A
- Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
- Masquage: Aucun (étiquette ouverte)
Armes et Interventions
Groupe de participants / Bras |
Intervention / Traitement |
---|---|
Autre: Test WGS du nouveau-né
Les sujets nouveau-nés éligibles et dont les parents consentent à l'étude subiront un prélèvement sanguin qui sera envoyé pour un séquençage du génome entier et une analyse bioinformatique, filtrant d'abord un panel ciblé de 1722 gènes les plus susceptibles de provoquer des troubles génétiques au cours de la première année de vie, puis avec un filtre d'exome entier si aucun diagnostic évident n'est déterminé à l'aide du filtre de panel de gènes 1722.
|
Les nouveau-nés subiront un séquençage complet du génome et une analyse avec un panel ciblé de gènes susceptibles de provoquer des troubles génétiques au cours de la première année de vie. Si aucun diagnostic n'est identifié, les données séquencées seront analysées à l'aide d'un filtre d'exome entier. Effectué dans un laboratoire certifié CLIA. Les gènes pathogènes, probablement pathogènes et VUS dans les gènes liés au phénotype seront retournés à l'équipe de soins et à la famille. Les parents seront inscrits aux fins d'une analyse en trio avec l'enfant pour aider à déterminer la pathogénicité des variants dans le séquençage génomique. Les résultats pathogènes et probablement pathogènes seront signalés aux parents dans le cadre du conseil génétique. Le frère ou la sœur sera inscrit et aura des échantillons prélevés pour une utilisation dans l'analyse génétique uniquement si cela est jugé essentiel. Les résultats seront communiqués aux parents dans le cadre du conseil génétique. |
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Diagnostic confirmé
Délai: Jusqu'à 4 ans
|
Diagnostic confirmé catégorique O/N chez le participant nouveau-né détecté avec WGS, comparé aux résultats de la norme de soins (SOC) ou comme on le voit dans le contrôle historique (HC)
|
Jusqu'à 4 ans
|
Taux diagnostique
Délai: Jusqu'à 4 ans
|
Taux de diagnostic avec analyse via WGS, le filtre de gène spécifique néonatal 1722, vs filtre d'exome entier
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Jusqu'à 4 ans
|
Délai de diagnostic
Délai: Jusqu'à 4 ans
|
Délai de diagnostic en jours avec WGS par rapport aux tests SOC ou HC
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Jusqu'à 4 ans
|
Utilité clinique du WGS
Délai: Jusqu'à 4 ans
|
Utilité clinique du WGS (par ex.
changements dans la prise en charge) par rapport à SOC ou HC.
L'utilité clinique est évaluée par un médecin impliqué dans le dossier suite au retour des résultats à l'aide d'une échelle de Likert (1 - Pas du tout utile, 2 - Pas très utile, 3 - Neutre, 4 - Utile, 5 - Très utile)
|
Jusqu'à 4 ans
|
Évaluation des coûts de soins
Délai: Jusqu'à 4 ans
|
Coût total des soins en dollars chez ceux qui reçoivent WGS par rapport à HC
|
Jusqu'à 4 ans
|
Durée du séjour
Délai: Jusqu'à 4 ans
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Durée totale du séjour à l'hôpital en jours chez les personnes recevant le WGS par rapport aux HC
|
Jusqu'à 4 ans
|
Besoin d'utilisation médicale
Délai: Jusqu'à 4 ans
|
Nombre de procédures médicales majeures, d'études d'imagerie ou de consultations de services de consultation chez les sujets recevant le WGS par rapport à ceux de HC
|
Jusqu'à 4 ans
|
Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Gerard Vockley, MD, PhD, University of Pittsburgh
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Estimé)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- STUDY19050319
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .
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