Diese Seite wurde automatisch übersetzt und die Genauigkeit der Übersetzung wird nicht garantiert. Bitte wende dich an die englische Version für einen Quelltext.

Genomsequenzierung in der Population der Intensivstation (PISCES)

1. November 2023 aktualisiert von: Jerry Vockley, MD, PhD
Der Zweck dieser Studie ist es zu verstehen, wie die Verwendung der Gesamtgenomsequenzierung (WGS) die Geschwindigkeit erhöhen kann, mit der eine Diagnose für Patienten auf einer Intensivstation gestellt wird. Dies ist keine Bewertung eines neuen Geräts, Tests oder einer neuen Technologie. Dieses Projekt ist eine Untersuchung des Nutzens dieser Technologie in der klinischen Versorgung im Vergleich zu Standard-Versorgungstests. Die Studie wird die Fähigkeit untersuchen, einen Patienten schneller zu diagnostizieren (Zeit bis zur Diagnose und Wirksamkeit der Tests) im Vergleich zu Standard-Versorgungstests. Die Studie wird auch die Auswirkungen von WGS auf die Patientenergebnisse und die Kosten der klinischen Versorgung untersuchen.

Studienübersicht

Status

Anmeldung auf Einladung

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Detaillierte Beschreibung

Dies ist eine Beobachtungsstudie, um zu verstehen, ob die Verwendung der Gesamtgenomsequenzierung (WGS) die Diagnose beschleunigt und wie sich das klinische Management in einer Intensivpopulation von Neugeborenen verändert. Dieses Projekt verwendet anerkannte Genomsequenzierungsmethoden in CLIA-zertifizierten Einrichtungen.

  1. Neugeborene Probanden, die geeignet sind und deren Eltern der Studie zustimmen, werden einer Blutprobe unterzogen, die zur WGS- und Bioinformatikanalyse geschickt wird, wobei zuerst mit einem gezielten Panel von 1722 Genen gefiltert wird, die am wahrscheinlichsten im ersten Lebensjahr genetische Störungen verursachen, und dann mit einem vollständigen Exomfilter, wenn keine offensichtliche Diagnose unter Verwendung des 1722-Gen-Panel-Filters festgestellt wird. Die Tests werden in einem CLIA-zertifizierten Labor durchgeführt. Pathogene, wahrscheinlich pathogene und Varianten von ungewisser Bedeutung in Genen, die mit den klinischen Merkmalen des Kindes zusammenhängen, werden an das Betreuungsteam und die Eltern im Rahmen einer genetischen Beratung zur Verwendung bei der klinischen Entscheidungsfindung über das Management zurückgegeben. Der Neugeborenen-EMR wird ein Bericht hinzugefügt. Die Einwilligung umfasst die Erlaubnis, auf Finanzunterlagen des Krankenhausaufenthalts zuzugreifen, um Kosten und Aufenthaltsdauer mit entsprechenden Kontrollen zu vergleichen.
  2. Eltern von identifizierten Neugeborenen, die der Studie zum Zweck der Trioanalyse zustimmen, werden Proben entnommen, die gleichzeitig mit dem Kind analysiert werden, um die Bestimmung der Pathogenität von Varianten in der Genomsequenzierung zu unterstützen. Pathogene und wahrscheinlich pathogene Sekundärbefunde in den später auftretenden medizinisch verwertbaren Genen der ACMG 59 werden den Eltern im Rahmen der genetischen Beratung NUR dann gemeldet, wenn die Eltern sich dafür entscheiden, diese Ergebnisse zu erfahren UND sie beim Kind identifiziert werden.
  3. Von Geschwistern der teilnehmenden Neugeborenen werden, falls dies für die Interpretation der genetischen Studien des Neugeborenen erforderlich ist, Proben zur Verwendung in der genetischen Analyse entnommen. Pathogene und wahrscheinlich pathogene Folgen bei frühkindlichen Erkrankungen werden den Eltern im Rahmen einer genetischen Beratung mitgeteilt.
  4. Historische Kontrollen werden identifiziert und den Studienteilnehmern zugeordnet. Zu den historischen Kontrollen gehören Säuglinge auf der Intensivstation, bei denen während ihrer Erstaufnahme in den letzten 24 Monaten eine genetische Beratung angeordnet wurde. Das Matching zwischen Studienteilnehmern und gematchten Kontrollen wird unter Verwendung von Propensity Scores durchgeführt. Wir passen ein logistisches Regressionsmodell an die kombinierten Behandlungs- und Kontrollgruppen an und verwenden dann den nächsten Nachbarn, um übereinstimmende Paare zu erstellen. Der Abgleich trägt dazu bei, Verzerrungen zu reduzieren und die Aussagekraft zu erhöhen, um wahre Effekte zu erkennen. Diese Kontrollen werden nur für die Steuer- und Aufenthaltsdaueranalysen verwendet; An dieser Kohorte werden keine Gentests durchgeführt.

Studientyp

Interventionell

Einschreibung (Geschätzt)

400

Phase

  • Unzutreffend

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

  • Vereinigte Staaten
    • Pennsylvania
      • Pittsburgh, Pennsylvania, Vereinigte Staaten, 15224
        • UPMC Children's Hospital of Pittsburgh

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

Nicht älter als 4 Monate (Kind)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Neugeborene: Um zur Teilnahme angesprochen zu werden, muss ein Neugeborenes alle folgenden Kriterien erfüllen:

    1. Gestationsalter von mehr als 24 Wochen
    2. Geburtsgewicht über 600 Gramm
    3. Aufnahme in die Intensivstation des UPMC Children's Hospital (CHP) und/oder des Magee Women's Hospital
    4. Möglichkeit einer genetischen Störung basierend auf Anzeichen, Symptomen und Laborwerten, die eine formelle klinisch-medizinische Genetik-Beratung durch das klinische Behandlungsteam auslösen.
    5. Von PI oder begleitenden Mitprüfern triagiert und der Einführung dieser Forschungsstudie auf der Grundlage patientenspezifischer klinischer Bedenken Vorrang eingeräumt
    6. Dokumentierte Einverständniserklärung der Eltern/Erziehungsberechtigten
  • Eltern: Elternteil eines Neugeborenen, das die oben genannten Einschlusskriterien erfüllt und dem die Teilnahme an der Studie zugestimmt wurde.
  • Geschwister: Geschwister eines Neugeborenen, das die oben genannten Einschlusskriterien erfüllt und dessen Teilnahme an der Studie zugestimmt wurde. Geschwister werden nur rekrutiert, wenn festgestellt wurde, dass ihre Teilnahme für die genaue Interpretation der genetischen Studien des Neugeborenen unerlässlich ist.
  • Historische Kontrollen: Personen, die innerhalb der letzten 24 Monate von Medical Genetics bewertet wurden und die Kriterien für übereinstimmende Kontrollen erfüllen, wie sie durch den Propensity-Score-Matching definiert sind.

Ausschlusskriterien:

  • Neugeborene: Eine Person, die eines der folgenden Kriterien erfüllt, wird von der Teilnahme an dieser Studie ausgeschlossen:

    1. Hat eine bekannte ätiologische Diagnose (z. vorgeburtliche Untersuchung)
    2. Hat eine schwere angeborene Anomalie (Nieren-, Herz-, Leber-, neurologische oder pulmonale Missbildungen), die mit einer Chromosomenanomalie verbunden ist, die bei pränatalen Tests festgestellt wurde (z. Ultraschall, Gentest)
    3. Sequenzierung nach der Geburt aus einem anderen Grund als der genetischen Beratung, die die Studie auslöst
    4. Vorhandensein einer dokumentierten signifikanten angeborenen Infektion (z. angeborenes Zytomegalievirus)

  • Eltern:

    1. Ist nicht der biologische Elternteil des identifizierten Neugeborenen
    2. Es gibt keinen Ausschluss für die Teilnahme der Eltern. Wenn der Elternteil jedoch jünger als 18 Jahre ist, werden diese Personen gebeten, der Studie zuzustimmen, und ihre Eltern werden gebeten, die Erlaubnis/Zustimmung für die Teilnahme des minderjährigen Elternteils zu erteilen
    3. Eine vorherige genetische Untersuchung schließt den Elternteil nicht von der Teilnahme an dieser Studie aus.

  • Geschwister:

    1. Ist kein biologisches Geschwister eines Neugeborenen, das die Einschlusskriterien erfüllt
    2. Ist für eine genaue Interpretation der Neugeborenen-Ergebnisse nicht erforderlich
    3. Eine vorherige genetische Untersuchung schließt das Geschwisterkind nicht von der Teilnahme an dieser Studie aus.
  • Historische Kontrolle: Wurde in den letzten 24 Monaten nicht beobachtet und/oder erfüllt nicht die Kriterien für eine übereinstimmende Kontrolle, wie durch den Neigungs-Score-Matching definiert. Ein Teil dieses Abgleichs erfordert, dass die historische Kontrollgruppe anhand des Alters einem Studienteilnehmer zugeordnet wird, daher werden sie auf der Grundlage aller Abgleichskriterien ausgewählt und ausgeschlossen, wenn sie die Kriterien, einschließlich des Alters, nicht erfüllen.

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Hauptzweck: Diagnose
  • Zuteilung: N / A
  • Interventionsmodell: Einzelgruppenzuweisung
  • Maskierung: Keine (Offenes Etikett)

Waffen und Interventionen

Teilnehmergruppe / Arm
Intervention / Behandlung
Sonstiges: WGS-Test für Neugeborene
Neugeborenen Probanden, die geeignet sind und deren Eltern dem Studium zustimmen, wird eine Blutentnahme unterzogen, die zur Gesamtgenomsequenzierung und bioinformatischen Analyse geschickt wird, wobei zuerst eine gezielte Gruppe von 1722 Genen gefiltert wird, die am wahrscheinlichsten im ersten Lebensjahr genetische Störungen verursachen, und dann mit einem vollständigen Exomfilter, wenn keine offensichtliche Diagnose unter Verwendung des 1722-Gen-Panel-Filters festgestellt wird.
Diagnosetest: WGS-Test für Neugeborene

Neugeborene werden einer vollständigen Genomsequenzierung und einer Analyse mit einem gezielten Panel von Genen unterzogen, die wahrscheinlich im ersten Lebensjahr genetische Störungen verursachen. Wenn keine Diagnose identifiziert wird, werden sequenzierte Daten unter Verwendung eines vollständigen Exomfilters analysiert. Durchgeführt in einem CLIA-zertifizierten Labor. Pathogene, wahrscheinlich pathogene und VUS in Genen, die mit dem Phänotyp zusammenhängen, werden an das Pflegeteam und die Familie zurückgegeben.

Die Eltern werden zum Zwecke der Trio-Analyse mit dem Kind eingeschrieben, um bei der Bestimmung der Pathogenität von Varianten bei der Genomsequenzierung zu helfen. Pathogene und wahrscheinlich pathogene Befunde werden den Eltern im Rahmen einer genetischen Beratung mitgeteilt.

Geschwister werden nur registriert und erhalten Proben zur Verwendung in der genetischen Analyse, wenn dies als wesentlich erachtet wird. Die Ergebnisse werden den Eltern im Rahmen der genetischen Beratung mitgeteilt.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Bestätigte Diagnose
Zeitfenster: Bis zu 4 Jahre
Kategoriales J/N bestätigte Diagnose bei dem neugeborenen Teilnehmer, die mit WGS erkannt wurde, im Vergleich zu den Ergebnissen der Standardbehandlung (SOC) oder wie in der historischen Kontrolle (HC) gesehen
Bis zu 4 Jahre
Diagnoserate
Zeitfenster: Bis zu 4 Jahre
Diagnoserate mit Analyse über WGS, den 1722 neonatalspezifischen Genfilter, im Vergleich zum gesamten Exomfilter
Bis zu 4 Jahre
Zeit bis zur Diagnose
Zeitfenster: Bis zu 4 Jahre
Zeit bis zur Diagnose in Tagen mit WGS im Vergleich zu SOC-Tests oder HC
Bis zu 4 Jahre
Klinischer Nutzen von WGS
Zeitfenster: Bis zu 4 Jahre
Klinischer Nutzen von WGS (z.B. Änderungen im Pflegemanagement) im Vergleich zu SOC oder HC. Der klinische Nutzen wird von einem am Fall beteiligten Arzt nach der Rückgabe der Ergebnisse anhand einer Likert-Skala bewertet (1 – überhaupt nicht nützlich, 2 – nicht sehr nützlich, 3 – neutral, 4 – nützlich, 5 – sehr nützlich).
Bis zu 4 Jahre
Bewertung der Pflegekosten
Zeitfenster: Bis zu 4 Jahre
Gesamtpflegekosten in Dollar bei WGS-Empfängern im Vergleich zu HC
Bis zu 4 Jahre
Dauer des Aufenthalts
Zeitfenster: Bis zu 4 Jahre
Gesamtdauer des Krankenhausaufenthalts in Tagen bei WGS-Empfängern im Vergleich zu HC
Bis zu 4 Jahre
Bedarf für medizinische Nutzung
Zeitfenster: Bis zu 4 Jahre
Anzahl größerer medizinischer Eingriffe, bildgebender Studien oder Beratungsdienste bei Probanden, die WGS erhalten, im Vergleich zu denen in HC
Bis zu 4 Jahre

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Jerry Vockley, MD, PhD

Ermittler

  • Hauptermittler: Gerard Vockley, MD, PhD, University of Pittsburgh

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

13. Juli 2020

Primärer Abschluss (Geschätzt)

1. Juli 2024

Studienabschluss (Geschätzt)

1. November 2024

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

13. April 2021

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

13. April 2021

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

19. April 2021

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Geschätzt)

3. November 2023

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

1. November 2023

Zuletzt verifiziert

1. November 2023

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Schlüsselwörter

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • STUDY19050319

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

NEIN

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

Klinische Studien zur WGS-Test für Neugeborene

Suchen Sie nach ähnlichen Studien

Sponsoren und Mitarbeiter

Krankheiten

Drogeninterventionen

CROs by country

CROs in Taiwan

Bedingungen

Seltene Krankheiten

Drogeninterventionen

Nahrungsergänzungsmittel

Sponsor / Mitarbeiter

Standorte

3
Abonnieren