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在儿科队列中使用下一代测序诊断癫痫和/或智力障碍

2022年1月3日 更新者:calina TODOSI、Central Hospital, Nancy, France

下一代测序在南锡地区大学医院中心儿科队列诊断癫痫和/或智力障碍中的表现

抽象的

背景和目标:

从 2019 年 6 月开始,在法国南锡地区大学医院中心确定用于儿科人群的癫痫和智力残疾小组的诊断性能。

设计:

一项观察性和回顾性研究,在法国南锡地区大学医院中心进行。

材料和方法:

使用癫痫-智力障碍基因组进行基因分析的儿科患者。 所有这些患者要么患有癫痫症,要么患有智力障碍,或者两者兼而有之,病因不明。

结果:

我们在这项研究中纳入了 69 名患者。 我们在基因面板后确定了该队列中 46.4%(69 名患者中的 32 名)的致病突变,并在实现临床外显子组解决方案后确定了 52.2%(36 名患者)的阳性结果。

研究概览

详细说明

癫痫和智力障碍是儿童常见且高度异质的神经发育障碍。 它们各自的患病率为 3.2 至 5.1/1000 (1,2) 和 1.3 至 2.2% (3)。

癫痫发作是由于异常过度或同步的神经元活动。 癫痫定义为: (A) 至少两次无端(或反射)发作间隔 >24 小时; (B) 一次无缘无故(或反射性)癫痫发作和至少 60% 的进一步癫痫发作的可能性;或(C) 癫痫综合征的诊断 (4)。 智力障碍 (ID) 根据《精神疾病诊断和统计手册》第五版 (DSM-5) 的定义,是 18 岁之前出现的智力功能和适应性行为(包括概念、社交和实践技能)的重大限制.

这两种情况可能由多种环境和遗传因素引起,通常结合在一起,使诊断变得困难 (5,6)。 标准诊断方法包括神经代谢紊乱的生化和酶分析、MRI 脑成像和全基因组微阵列分析 (7-9)。

由于基因型-表型表达的巨大变异性(一种综合征可能有多种遗传原因;同一基因可以以不同方式表达)和巨大的遗传异质性,长期以来很难识别与这些病理有关的基因。 近几十年来,随着新一代测序 (NGS) 等新技术的发展,遗传学取得了长足的进步。 这些新技术允许以更低的成本同时对许多基因进行测序,从而允许在临床实践常规中使用这些测试与基因组,甚至是全外显子组或全基因组测序 (10)。 我们现在确定了 1000 多个与癫痫和 ID 机制有关的基因,具有各种途径 (11-16)。

研究类型

观察性的

注册 (实际的)

69

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

      • Vandoeuvre les Nancy、法国、54500
        • Calina Todosi

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

1天 至 17年 (孩子)

接受健康志愿者

不适用

有资格学习的性别

全部

取样方法

非概率样本

研究人群

在纳入研究的 69 名患者中,大多数为男孩,62.3%(43 名患者)和 37.7% 为女孩(26 名患者)。 这种差异在智障患者亚类中最为明显,男女比例约为 1:2,3。 纳入人群的中位年龄为 5 岁 [2.2-17]。

在我们研究的 69 名患者中,大多数受益于智力障碍的基因组(37 名患者,即 53.6%)、13 名癫痫患者(18.8% 的患者)和 19 名患者同时患有这两种疾病(即 27.5%)。

描述

纳入标准:

  • 我们的研究纳入了在 2019 年 6 月至 2021 年 5 月期间使用癫痫-智力障碍基因组进行基因分析的所有儿科患者。 所有这些患者要么患有癫痫,要么患有智力障碍,或者两者兼而有之,病因不明或推测为遗传性。

排除标准:

  • 我们排除了 i) 18 岁以上的患者,ii) 遗传分析指征不是癫痫或智力障碍的患者 iii) 未在法国南锡地区大学医院中心接受随访的患者。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

队列和干预

团体/队列
干预/治疗
仅限癫痫
仅接受我们的基因组和临床外显子组解决方案的癫痫患者
外显子组临床解决方案的回顾性分析
仅限智力障碍
仅接受我们的基因组和临床外显子组解决方案的智力障碍患者
外显子组临床解决方案的回顾性分析
癫痫和智力障碍
接受我们的基因组和临床外显子组解决方案的智力障碍和癫痫患者
外显子组临床解决方案的回顾性分析

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
使用我们的癫痫和智力障碍小组确定阳性结果的百分比
大体时间:2年
面板分析后阳性结果的百分比
2年

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
CES补充阳性结果评价
大体时间:2年
使用 CES 发现的阳性结果的百分比和女巫使用面板的阴性结果
2年

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2019年6月1日

初级完成 (实际的)

2021年5月31日

研究完成 (实际的)

2021年5月31日

研究注册日期

首次提交

2021年9月14日

首先提交符合 QC 标准的

2022年1月3日

首次发布 (实际的)

2022年1月18日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2022年1月18日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2022年1月3日

最后验证

2022年1月1日

更多信息

与本研究相关的术语

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

不

研究美国 FDA 监管的设备产品

不

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