Seuraavan sukupolven sekvensoinnin käyttö epilepsian ja/tai kehitysvammaisuuden diagnosoinnissa lasten kohortissa
Seuraavan sukupolven sekvensoinnin tehokkuus epilepsian ja/tai kehitysvammaisuuden diagnosoinnissa Nancyn alueellisen yliopistosairaalan keskuksen pediatrisessa kohortissa
ABSTRAKTI
Tausta ja tavoitteet:
Lapsiväestössä käytettävän epilepsia- ja kehitysvammapaneelin diagnostisen suorituskyvyn määrittäminen kesäkuusta 2019 alkaen Nancyn alueellisessa yliopistosairaalan keskustassa, Ranskassa.
Design:
Havainnollinen ja retrospektiivinen tutkimus Nancyn alueellisessa yliopistosairaalakeskuksessa Ranskassa.
Materiaalit ja menetelmät:
Pediatriset potilaat, joille tehtiin geneettinen analyysi epilepsia-älyvammaisten geenipaneelilla. Kaikki nämä potilaat olivat joko epilepsia tai älyllinen vamma, tai molemmat, joiden etiologia oli määrittelemätön.
Tulokset:
Tähän tutkimukseen osallistui 69 potilasta. Tunnistamme aiheuttavia mutaatioita 46,4 %:lla (32 potilaasta 69 potilaasta) tästä kohortista geenipaneelin jälkeen ja 52,2 %:lla (36 potilasta), mukaan lukien positiiviset tulokset kliinisen eksomin ratkaisun toteuttamisen jälkeen.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Epilepsia ja kehitysvamma ovat yleisiä ja hyvin heterogeenisiä lasten hermoston kehityshäiriöitä. Niiden esiintyvyys on 3,2-5,1/1000 (1,2) ja 1,3-2,2 % (3).
Epileptinen kohtaus johtuu epänormaalista liiallisesta tai synkronisesta hermosolujen aktiivisuudesta. Epilepsia määritellään seuraavasti: (A) vähintään kaksi provosoimatonta (tai refleksikohtausta), jotka esiintyvät yli 24 tunnin välein; tai (B) yksi provosoimaton (tai refleksi)kohtaus ja uusien kohtausten todennäköisyys on vähintään 60 %; tai (C) epilepsiaoireyhtymän diagnoosi (4). Intellektuaalinen vamma (ID) on määritelty mielenterveyshäiriöiden diagnostisessa ja tilastollisessa käsikirjassa, 5. painos (DSM-5), merkittäväksi rajoitukseksi henkisessä toiminnassa ja mukautuvassa käyttäytymisessä, mukaan lukien käsitteelliset, sosiaaliset ja käytännön taidot, jotka syntyvät ennen 18 vuoden ikää. .
Nämä kaksi tilaa voivat johtua useista ympäristö- ja geneettisistä tekijöistä, usein yhdistettyinä, mikä tekee diagnoosista vaikean (5, 6). Vakiodiagnostisiin lähestymistapoihin kuuluvat neurometabolisten häiriöiden biokemiallinen ja entsyymianalyysi, aivojen MRI-kuvaus ja genominlaajuinen mikrosiruanalyysi (7-9).
Genotyyppi-fenotyyppisen ilmentymisen suuren vaihtelevuuden (oireyhtymällä voi olla useita geneettisiä syitä; sama geeni voi ilmentyä eri tavoilla) ja valtavan geneettisen heterogeenisyyden vuoksi näihin patologioihin liittyvien geenien tunnistaminen on ollut pitkään vaikeaa. Viime vuosikymmeninä genetiikassa on edistytty huomattavasti uusien teknologioiden, kuten seuraavan sukupolven sekvensoinnin (NGS) kehityksen myötä. Nämä uudet tekniikat mahdollistavat useiden geenien sekvensoinnin yhtä aikaa yhä halvemmalla, mikä mahdollistaa näiden testien käytön kliinisen käytännön rutiinissa geenipaneeleilla ja jopa koko eksomin tai koko genomin sekvensoinnin (10). Olemme nyt tunnistaneet yli 1000 geeniä, jotka liittyvät epilepsian ja ID:n mekanismeihin eri reiteillä (11-16).
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Vandoeuvre les Nancy, Ranska, 54500
- Calina Todosi
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Tutkimukseen osallistuneista 69 potilaasta suurin osa oli poikia, 62,3 % (43 potilasta) ja 37,7 % tyttöjä (26 potilasta). Tämä ero on selkein kehitysvammaisten potilaiden alaryhmässä, jossa sukupuolten suhde on noin 1:2,3. Väestön mediaani-ikä sisällyttämishetkellä oli 5 vuotta [2,2-17].
Tutkimuksessamme mukana olleista 69 potilaasta suurin osa sai geenipaneelista kehitysvammansa (37 potilasta eli 53,6 %), 13 epilepsiaa (18,8 % potilaista) ja 19 potilasta molemmat (ts. 27,5 %).
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Otimme tutkimukseemme mukaan kaikki lapsipotilaat, joille tehtiin geneettinen analyysi epilepsia-älyvammaisten geenipaneelilla kesäkuun 2019 ja toukokuun 2021 välisenä aikana. Kaikki nämä potilaat olivat joko epilepsia tai älyllinen vamma tai molemmat, joiden etiologia oli määrittelemätön tai geneettisesti oletettu.
Poissulkemiskriteerit:
- Jätimme pois i) yli 18-vuotiaat potilaat, ii) ne, joille geneettisen analyysin indikaatio ei ollut epilepsia tai kehitysvamma iii) potilaat, joita ei seurattu Nancyn alueellisessa yliopistosairaalakeskuksessa Ranskassa.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Vain epilepsia
Vain epilepsiapotilaat, joille tehtiin geenipaneelimme ja kliininen eksomeratkaisu
|
exome-kliinisen ratkaisun retrospektiivinen analyysi
|
|
Vain kehitysvamma
Ainoastaan kehitysvammaiset potilaat, joille on tehty geenipaneelimme ja kliininen eksomeratkaisu
|
exome-kliinisen ratkaisun retrospektiivinen analyysi
|
|
Epilepsia ja kehitysvamma
Kehitysvamma- ja epilepsiapotilaat, joille tehtiin geenipaneelimme ja kliininen eksomeratkaisu
|
exome-kliinisen ratkaisun retrospektiivinen analyysi
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
määritä positiivisten tulosten kaatoprosentti käyttämällä epilepsia- ja kehitysvammapaneeliamme
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
positiivisten tulosten kaatoprosentti paneelianalyysin jälkeen
|
2 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
CES:n lisäpositiivisten tulosten arviointi
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
CES:n avulla löydettyjen positiivisten tulosten kaatoprosentti ja noita olivat negatiivisia paneelia käyttämällä
|
2 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2021PI127.
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .