Использование секвенирования нового поколения в диагностике эпилепсии и/или умственной отсталости в педиатрической когорте
Эффективность секвенирования нового поколения в диагностике эпилепсии и/или умственной отсталости в педиатрической когорте регионального университетского больничного центра Нанси
АБСТРАКТНЫЙ
Предыстория и цели:
Для определения диагностической эффективности панели эпилепсии и умственной отсталости, используемой в педиатрической популяции, начиная с июня 2019 года, в Региональном университетском больничном центре Нанси, Франция.
Дизайн:
Обсервационное и ретроспективное исследование в Региональном университетском больничном центре Нанси, Франция.
Материалы и методы:
Педиатрические пациенты, которым был проведен генетический анализ с панелью генов эпилепсии-умственной отсталости. Все эти пациенты были либо эпилептиками, либо имели умственную отсталость, либо и то, и другое, неустановленной этиологии.
Полученные результаты:
Мы включили 69 пациентов в это исследование. Мы выявили причинные мутации у 46,4% (32 из 69 пациентов) этой когорты после генной панели и у 52,2% (36 пациентов) с учетом положительных результатов после реализации Clinical Exome Solution.
Обзор исследования
Статус
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Эпилепсия и умственная отсталость являются распространенными и весьма гетерогенными нарушениями развития нервной системы у детей. Их соответствующая распространенность составляет от 3,2 до 5,1/1000 (1,2) и от 1,3 до 2,2% (3).
Эпилептический припадок возникает из-за аномальной чрезмерной или синхронной активности нейронов. Эпилепсия определяется: (A) по крайней мере двумя неспровоцированными (или рефлекторными) припадками, происходящими с интервалом более 24 часов; или (B) один неспровоцированный (или рефлекторный) припадок и вероятность дальнейших припадков не менее 60%; или (C) диагноз синдрома эпилепсии (4). Умственная отсталость (ID) определяется Диагностическим и статистическим руководством по психическим расстройствам, пятое издание (DSM-5), как значительное ограничение интеллектуального функционирования и адаптивного поведения, которое включает концептуальные, социальные и практические навыки, возникающие в возрасте до 18 лет. .
Эти два состояния могут быть вызваны различными экологическими и генетическими факторами, которые часто сочетаются друг с другом, что затрудняет диагностику (5,6). Стандартные диагностические подходы включают биохимический и ферментный анализ нейрометаболических нарушений, МРТ головного мозга и полногеномный микрочиповый анализ (7-9).
Из-за большой вариабельности генотипически-фенотипической экспрессии (синдром может иметь несколько генетических причин, один и тот же ген может экспрессироваться по-разному) и огромной генетической гетерогенности идентификация генов, участвующих в этих патологиях, долгое время была затруднена. За последние десятилетия в генетике был достигнут значительный прогресс благодаря развитию новых технологий, таких как секвенирование следующего поколения (NGS). Эти новые методы позволяют секвенировать многие гены одновременно с еще более низкими затратами, что позволяет использовать эти тесты в рутинной клинической практике с генными панелями и даже секвенирование всего экзома или всего генома (10). В настоящее время мы идентифицировали более 1000 генов, участвующих в механизмах эпилепсии и ID, с различными путями (11-16).
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
-
Vandoeuvre les Nancy, Франция, 54500
- Calina Todosi
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Полы, имеющие право на обучение
Метод выборки
Исследуемая популяция
Из 69 пациентов, включенных в исследование, большинство составили мальчики, 62,3% (43 пациента) и 37,7% девочки (26 пациентов). Эта разница наиболее выражена в подкатегории больных с умственной отсталостью, при соотношении полов примерно 1:2,3. Средний возраст населения при включении составлял 5 лет [2.2-17].
Из общего числа 69 пациентов, включенных в наше исследование, большинство из них получили генную панель для умственной отсталости (37 пациентов, т. 27,5%).
Описание
Критерии включения:
- Мы включили в наше исследование всех педиатрических пациентов, которым был проведен генетический анализ с использованием панели генов эпилепсии и умственной отсталости в период с июня 2019 года по май 2021 года. Все эти пациенты были либо эпилептиками, либо имели умственную отсталость, либо и то, и другое, неопределенной или предполагаемой генетической этиологии.
Критерий исключения:
- Мы исключили i) пациентов старше 18 лет, ii) тех, для кого показанием к генетическому анализу не была эпилепсия или умственная отсталость, iii) пациентов, не наблюдавшихся в Региональном университетском больничном центре Нанси, Франция.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Только эпилепсия
Только пациенты с эпилепсией, прошедшие нашу генную панель и клиническое экзомное решение
|
ретроспективный анализ клинического раствора экзома
|
|
Только умственная отсталость
Только пациенты с умственной отсталостью, прошедшие нашу генную панель и решение для клинического экзома
|
ретроспективный анализ клинического раствора экзома
|
|
Эпилепсия и умственная отсталость
Пациенты с умственной отсталостью и эпилепсией, прошедшие нашу генную панель и клиническое экзомное решение
|
ретроспективный анализ клинического раствора экзома
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
определить процент положительных результатов, используя нашу панель эпилепсии и умственной отсталости
Временное ограничение: 2 года
|
процент положительных результатов после панельного анализа
|
2 года
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
оценка дополнительных положительных результатов КЭС
Временное ограничение: 2 года
|
процент положительных результатов, полученных с помощью CES, и отрицательных результатов, полученных с помощью панели
|
2 года
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Действительный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- 2021PI127.
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .