Utilisation du séquençage de nouvelle génération dans le diagnostic de l'épilepsie et/ou de la déficience intellectuelle dans une cohorte pédiatrique
Les performances du séquençage de nouvelle génération dans le diagnostic de l'épilepsie et/ou de la déficience intellectuelle dans la cohorte pédiatrique du Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy
ABSTRAIT
Contexte et objectifs :
Déterminer la performance diagnostique du panel épilepsie et déficience intellectuelle utilisé dans la population pédiatrique, à partir de juin 2019, au Centre Hospitalier Universitaire Régional de Nancy, France.
Conception:
Une étude observationnelle et rétrospective, au Centre Hospitalier Universitaire Régional de Nancy, France.
Matériels et méthodes:
Patients pédiatriques ayant subi une analyse génétique avec le panel de gènes épilepsie-déficience intellectuelle. Tous ces patients étaient soit épileptiques, soit avaient une déficience intellectuelle, ou les deux, d'étiologie indéterminée.
Résultats:
Nous avons inclus 69 patients dans cette étude. Nous avons identifié des mutations causales chez 46,4 % (32 patients sur 69) de cette cohorte après le panel de gènes et 52,2 % (36 patients) incluant des résultats positifs après la réalisation de la solution d'exome clinique.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
L'épilepsie et la déficience intellectuelle sont des troubles neurodéveloppementaux fréquents et très hétérogènes chez les enfants. Leurs prévalences respectives sont de 3,2 à 5,1/1000 (1,2) et de 1,3 à 2,2% (3).
Une crise d'épilepsie est due à une activité neuronale excessive ou synchrone anormale. L'épilepsie est définie par : (A) Au moins deux crises non provoquées (ou réflexes) survenant à plus de 24 h d'intervalle ; ou (B) une crise non provoquée (ou réflexe) et une probabilité de nouvelles crises d'au moins 60 % ; ou (C) diagnostic d'un syndrome épileptique (4). La déficience intellectuelle (DI) est définie par le Manuel diagnostique et statistique des troubles mentaux, cinquième édition (DSM-5), comme une limitation significative du fonctionnement intellectuel et du comportement adaptatif, qui comprend les compétences conceptuelles, sociales et pratiques, apparaissant avant l'âge de 18 ans. .
Ces deux conditions peuvent être causées par une variété de facteurs environnementaux et génétiques, souvent combinés, rendant le diagnostic difficile (5,6). Les approches diagnostiques standard comprennent l'analyse biochimique et enzymatique des troubles neurométaboliques, l'imagerie cérébrale par IRM et l'analyse des puces à ADN à l'échelle du génome (7-9).
En raison de la grande variabilité de l'expression génotypique-phénotypique (un syndrome peut avoir plusieurs causes génétiques ; un même gène peut s'exprimer de différentes manières) et de l'énorme hétérogénéité génétique, l'identification des gènes impliqués dans ces pathologies a longtemps été difficile. Au cours des dernières décennies, des progrès considérables ont été réalisés en génétique, avec le développement de nouvelles technologies telles que le séquençage de nouvelle génération (NGS). Ces nouvelles techniques permettent le séquençage de plusieurs gènes en même temps, à un coût toujours plus faible, permettant l'utilisation de ces tests en pratique clinique de routine avec des panels de gènes, voire le séquençage de l'exome entier ou du génome entier (10). Nous avons maintenant identifié plus de 1000 gènes impliqués dans les mécanismes de l'épilepsie et de la DI, avec différentes voies (11-16).
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Vandoeuvre les Nancy, France, 54500
- Calina Todosi
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
Sur les 69 patients inclus dans l'étude, la majorité étaient des garçons, 62,3% (43 patients) et 37,7% étaient des filles (26 patients). Cette différence est plus prononcée dans la sous-catégorie des patients présentant une déficience intellectuelle, avec un sex-ratio d'environ 1:2,3. L'âge médian de la population à l'inclusion était de 5 ans [2,2-17].
Sur un total de 69 patients inclus dans notre étude, la majorité bénéficiait du panel génétique pour leur déficience intellectuelle (37 patients soit 53,6%), 13 pour leur épilepsie (18,8% des patients) et 19 patients avaient les deux (soit 27,5 %).
La description
Critère d'intégration:
- Nous avons inclus dans notre étude tous les patients pédiatriques ayant subi une analyse génétique avec le panel de gènes épilepsie-déficience intellectuelle entre juin 2019 et mai 2021. Tous ces patients étaient épileptiques ou avaient une déficience intellectuelle, ou les deux, d'étiologie indéterminée ou génétique présumée.
Critère d'exclusion:
- Nous avons exclu i) les patients âgés de plus de 18 ans, ii) ceux pour lesquels l'indication de l'analyse génétique n'était pas l'épilepsie ou la déficience intellectuelle iii) les patients non suivis au Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy, France.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Épilepsie seulement
Seuls les patients épileptiques qui ont subi notre panel de gènes et la solution d'exome clinique
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analyse rétrospective d'une solution clinique d'exome
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Handicap intellectuel uniquement
Seuls les patients ayant une déficience intellectuelle qui ont subi notre panel de gènes et la solution d'exome clinique
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analyse rétrospective d'une solution clinique d'exome
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Épilepsie et déficience intellectuelle
Patients atteints de déficience intellectuelle et d'épilepsie qui ont subi notre panel de gènes et la solution d'exome clinique
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analyse rétrospective d'une solution clinique d'exome
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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déterminer le pourcentage de résultats positifs grâce à notre panel épilepsie et déficience intellectuelle
Délai: 2 années
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le pourcentage de résultats positifs après l'analyse du panel
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2 années
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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évaluation des résultats positifs complémentaires du CES
Délai: 2 années
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le pourcentage de résultats positifs trouvés avec le CES et négatifs avec le panel
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2 années
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 2021PI127.
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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