Következő generációs szekvenálás alkalmazása az epilepszia és/vagy az értelmi fogyatékosság diagnosztizálásában gyermekgyógyászati kohorszban
A következő generációs szekvenálás teljesítménye az epilepszia és/vagy értelmi fogyatékosság diagnosztizálásában a Nancy Regionális Egyetemi Kórház Központ gyermekgyógyászati csoportjában
ABSZTRAKT
Háttér és célok:
A gyermekpopulációban használt epilepsziás és értelmi fogyatékos panel diagnosztikai teljesítményének meghatározása 2019 júniusától kezdődően a franciaországi Nancy-i Regionális Egyetemi Kórház Központjában.
Tervezés:
Megfigyeléses és retrospektív tanulmány a Nancy-i Regionális Egyetemi Kórházközpontban, Franciaországban.
Anyagok és metódusok:
Gyermekgyógyászati betegek, akik genetikai elemzésen estek át az epilepszia-értelmi fogyatékosság génpanellel. Ezek a betegek mindegyike vagy epilepsziás, vagy értelmi fogyatékos volt, vagy mindkettő, és meghatározatlan etiológiájú.
Eredmények:
Ebbe a vizsgálatba 69 beteget vontunk be. Ennek a kohorsznak 46,4%-ában (69 betegből 32) azonosítottunk okozó mutációkat a génpanel után, és 52,2%-ban (36 beteg), beleértve a pozitív eredményeket a Clinical Exome Solution megvalósítása után.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Beavatkozás / kezelés
Részletes leírás
Az epilepszia és az értelmi fogyatékosság gyakori és rendkívül heterogén idegrendszeri fejlődési rendellenességek gyermekeknél. Prevalenciájuk 3,2-5,1/1000 (1,2) és 1,3-2,2% (3).
Az epilepsziás rohamot abnormális túlzott vagy szinkron idegi aktivitás okozza. Az epilepsziát a következők határozzák meg: (A) legalább két provokálatlan (vagy reflexszerű) roham, amelyek 24 óránál hosszabb időközönként jelentkeznek; vagy (B) egy provokálatlan (vagy reflexszerű) roham és a további rohamok valószínűsége legalább 60%; vagy (C) epilepsziás szindróma diagnózisa (4). Az értelmi fogyatékosságot (ID) a Mentális zavarok Diagnosztikai és Statisztikai Kézikönyve, 5. kiadás (DSM-5) határozza meg, mint az intellektuális működés és az adaptív viselkedés jelentős korlátját, amely magában foglalja a fogalmi, szociális és gyakorlati készségeket is, és amely 18 éves kor előtt jelentkezik. .
Ezt a két állapotot számos környezeti és genetikai tényező okozhatja, gyakran kombinálva, ami megnehezíti a diagnózist (5, 6). A standard diagnosztikai módszerek közé tartozik a neurometabolikus rendellenességek biokémiai és enzimanalízise, az agy MRI képalkotása és az egész genomra kiterjedő microarray elemzés (7-9).
A genotípus-fenotipikus expresszió nagy variabilitása (egy szindrómának több genetikai oka is lehet, ugyanaz a gén többféleképpen is expresszálódhat) és a hatalmas genetikai heterogenitás miatt az ezekben a patológiákban szerepet játszó gének azonosítása régóta nehéz. Az elmúlt évtizedekben jelentős előrelépés történt a genetikában, olyan új technológiák kifejlesztésével, mint a következő generációs szekvenálás (NGS). Ezek az új technikák lehetővé teszik számos gén egyidejű szekvenálását, egyre alacsonyabb költségek mellett, lehetővé téve ezeknek a teszteknek a génpanelekkel történő rutinszerű alkalmazását a klinikai gyakorlatban, sőt a teljes exome vagy a teljes genom szekvenálását is (10). Jelenleg több mint 1000 gént azonosítottunk, amelyek szerepet játszanak az epilepszia és az ID-mechanizmusokban, különböző útvonalakkal (11-16).
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Tényleges)
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi helyek
-
-
-
Vandoeuvre les Nancy, Franciaország, 54500
- Calina Todosi
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
Egészséges önkénteseket fogad
Tanulmányozható nemek
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
A vizsgálatba bevont 69 beteg közül a legtöbb fiú volt, 62,3%-a (43 beteg) és 37,7%-a lány (26 beteg). Ez a különbség leginkább az értelmi fogyatékos betegek alkategóriájában mutatkozik meg, ahol a nemek aránya megközelítőleg 1:2,3. A populáció medián életkora felvételkor 5 év volt [2,2-17].
A vizsgálatunkba bevont összesen 69 beteg közül a többség részesült a génpanelben értelmi fogyatékossága miatt (37 beteg, azaz 53,6%), 13 beteg epilepsziája miatt (a betegek 18,8%-a), 19 beteg pedig mindkettőben (pl. 27,5%).
Leírás
Bevételi kritériumok:
- Vizsgálatunkba minden olyan gyermekbeteget bevontunk, akiknél 2019 júniusa és 2021 májusa között genetikai analízist végeztek az epilepsziás-értelmi fogyatékosság génpanellel. Ezek a betegek mindegyike epilepsziás vagy értelmi fogyatékos volt, vagy mindkettő, és ezeknek az etiológiája nem meghatározott vagy genetikailag feltételezett.
Kizárási kritériumok:
- Kizártuk i) 18 évnél idősebb betegeket, ii) azokat, akiknél nem epilepsziás vagy értelmi fogyatékos volt a genetikai elemzés indikációja, iii) azokat a betegeket, akiket nem követtek nyomon a franciaországi Nancy Regionális Egyetemi Kórházközpontjában.
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
Beavatkozás / kezelés |
|---|---|
|
Csak epilepszia
Csak epilepsziás betegek, akik átestek a génpanelünkön és a klinikai exome megoldáson
|
egy exome klinikai megoldás retrospektív elemzése
|
|
Csak értelmi fogyatékosság
Az értelmi fogyatékossággal élő betegek csak a génpanelünkön és a klinikai exome megoldáson átesettek
|
egy exome klinikai megoldás retrospektív elemzése
|
|
Epilepszia és értelmi fogyatékosság
Értelmi fogyatékos és epilepsziás betegek, akik átestek a génpanelünkön és a klinikai exome megoldáson
|
egy exome klinikai megoldás retrospektív elemzése
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
határozza meg a pozitív eredmények öntési százalékát az epilepszia és értelmi fogyatékosság panel segítségével
Időkeret: 2 év
|
a pozitív eredmények öntési százaléka a panelelemzés után
|
2 év
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
a CES kiegészítő pozitív eredményeinek értékelése
Időkeret: 2 év
|
a CES segítségével talált pozitív eredmények öntési százaléka és a panel segítségével negatív volt
|
2 év
|
Együttműködők és nyomozók
Szponzor
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
Elsődleges befejezés (Tényleges)
A tanulmány befejezése (Tényleges)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Tényleges)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- 2021PI127.
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .