Använda nästa generations sekvensering vid diagnos av epilepsi och/eller intellektuell funktionsnedsättning i en pediatrisk kohort
Prestanda för nästa generations sekvensering vid diagnos av epilepsi och/eller intellektuell funktionsnedsättning i den pediatriska kohorten vid Regional University Hospital Center i Nancy
ABSTRAKT
Bakgrund och mål:
För att fastställa den diagnostiska prestandan för panelen för epilepsi och intellektuella funktionshinder som används i den pediatriska befolkningen, med start i juni 2019, vid Regional University Hospital Centre i Nancy, Frankrike.
Design:
En observations- och retrospektiv studie vid Regional University Hospital Centre i Nancy, Frankrike.
Material och metoder:
Pediatriska patienter som genomgick genetisk analys med genpanelen för epilepsi-intellektuell funktionsnedsättning. Alla dessa patienter var antingen epileptiska eller hade intellektuell funktionsnedsättning, eller båda, av obestämd etiologi.
Resultat:
Vi inkluderade 69 patienter i denna studie. Vi identifierade orsakande mutationer i 46,4% (32 av 69 patienter) av denna kohort efter genpanelen och 52,2% (36 patienter) inklusive positiva resultat efter realisering av den kliniska exomlösningen.
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Epilepsi och intellektuell funktionsnedsättning är vanliga och mycket heterogena neuroutvecklingsstörningar hos barn. Deras respektive prevalens är 3,2 till 5,1/1000 (1,2) och 1,3 till 2,2 % (3).
Ett epileptiskt anfall beror på onormal överdriven eller synkron neuronaktivitet. Epilepsi definieras av: (A) Minst två oprovocerade (eller reflex-) anfall som inträffar med mer än 24 timmars mellanrum; eller (B) ett oprovocerat (eller reflex) anfall och en sannolikhet för ytterligare anfall på minst 60 %; eller (C) diagnos av ett epilepsisyndrom (4). Intellektuell funktionsnedsättning (ID) definieras av Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders, Fifth Edition (DSM-5), som en betydande begränsning i intellektuell funktion och adaptivt beteende, som inkluderar konceptuella, sociala och praktiska färdigheter, som uppstår före 18 års ålder .
Dessa två tillstånd kan orsakas av en mängd olika miljömässiga och genetiska faktorer, ofta kombinerade, vilket gör diagnosen svår (5,6). Standarddiagnostiska metoder inkluderar biokemisk analys och enzymanalys för neurometabola störningar, MRT-hjärnavbildning och genomomfattande mikroarrayanalys (7-9).
På grund av den stora variationen i genotypiskt-fenotypiskt uttryck (ett syndrom kan ha flera genetiska orsaker; samma gen kan uttryckas på olika sätt) och den enorma genetiska heterogeniteten, har identifieringen av generna som är involverade i dessa patologier länge varit svår. Under de senaste decennierna har avsevärda framsteg gjorts inom genetik, med utvecklingen av ny teknik som nästa generations sekvensering (NGS). Dessa nya tekniker tillåter sekvensering av många gener samtidigt, till en allt lägre kostnad, vilket möjliggör användning av dessa tester i klinisk praxis med genpaneler, och till och med hel-exom eller hel-genom-sekvensering (10). Vi har nu identifierat mer än 1000 gener som är inblandade i mekanismer för epilepsi och ID, med olika vägar (11-16).
Studietyp
Inskrivning (Faktisk)
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
-
Vandoeuvre les Nancy, Frankrike, 54500
- Calina Todosi
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
Tar emot friska volontärer
Kön som är behöriga för studier
Testmetod
Studera befolkning
Av de 69 patienter som ingick i studien var majoriteten pojkar, 62,3 % (43 patienter) och 37,7 % flickor (26 patienter). Denna skillnad är mest uttalad i underkategorin patienter med intellektuella funktionsnedsättningar, med ett könsförhållande på cirka 1:2,3. Medianåldern för befolkningen vid inklusionen var 5 år [2,2-17].
Av de totalt 69 patienter som ingick i vår studie hade majoriteten av genpanelen för sin intellektuella funktionsnedsättning (37 patienter, dvs. 53,6%), 13 för sin epilepsi (18,8% av patienterna) och 19 patienter hade båda (dvs. 27,5 %).
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Vi inkluderade i vår studie alla pediatriska patienter som genomgick genetisk analys med genpanelen för epilepsi-intellektuell funktionsnedsättning mellan juni 2019 och maj 2021. Alla dessa patienter var antingen epileptiska eller hade intellektuell funktionsnedsättning, eller båda, av obestämd eller genetiskt antagen etiologi.
Exklusions kriterier:
- Vi uteslöt i) patienter äldre än 18 år, ii) de för vilka indikationen för genetisk analys inte var epilepsi eller intellektuell funktionsnedsättning iii) patienter som inte följts upp vid Regional University Hospital Centre i Nancy, Frankrike.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Endast epilepsi
Endast epilepsipatienter som genomgick vår genpanel och Clinical exome Solution
|
retrospektiv analys av en exom klinisk lösning
|
|
Endast intellektuella funktionshinder
Intellektuell funktionsnedsättning endast patienter som genomgick vår genpanel och Clinical exome Solution
|
retrospektiv analys av en exom klinisk lösning
|
|
Epilepsi och intellektuell funktionsnedsättning
Patienter med intellektuell funktionsnedsättning och epilepsi som genomgick vår genpanel och Clinical exome Solution
|
retrospektiv analys av en exom klinisk lösning
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
fastställa andelen positiva resultat med hjälp av vår panel för epilepsi och intellektuella funktionshinder
Tidsram: 2 år
|
andelen positiva resultat efter panelanalysen
|
2 år
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
utvärdering av kompletterande positiva resultat av CES
Tidsram: 2 år
|
andelen positiva resultat som hittades med CES och häxan var negativa med panelen
|
2 år
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Faktisk)
Avslutad studie (Faktisk)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- 2021PI127.
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .