Bruk av neste generasjons sekvensering i diagnostisering av epilepsi og/eller intellektuell funksjonshemming i en pediatrisk kohorte
Ytelsen til neste generasjons sekvensering i diagnostisering av epilepsi og/eller intellektuell funksjonshemming i den pediatriske kohorten ved Regional University Hospital Center of Nancy
ABSTRAKT
Bakgrunn og mål:
For å bestemme den diagnostiske ytelsen til panelet for epilepsi og intellektuell funksjonshemming som brukes i den pediatriske befolkningen, med start i juni 2019, ved Regional University Hospital Center i Nancy, Frankrike.
Design:
En observasjons- og retrospektiv studie ved Regional University Hospital Center i Nancy, Frankrike.
Materialer og metoder:
Pediatriske pasienter som gjennomgikk genetisk analyse med genpanelet for epilepsi-intellektuell funksjonshemming. Alle disse pasientene var enten epileptiske eller hadde intellektuell funksjonshemming, eller begge deler, av ubestemt etiologi.
Resultater:
Vi inkluderte 69 pasienter i denne studien. Vi identifiserte kausative mutasjoner i 46,4 % (32 av 69 pasienter) av denne kohorten etter genpanelet og 52,2 % (36 pasienter) inkludert positive resultater etter realisering av Clinical Exome Solution.
Studieoversikt
Status
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Epilepsi og intellektuell funksjonshemming er vanlige og svært heterogene nevroutviklingsforstyrrelser hos barn. Deres respektive prevalens er 3,2 til 5,1/1000 (1,2) og 1,3 til 2,2 % (3).
Et epileptisk anfall skyldes unormal overdreven eller synkron neuronal aktivitet. Epilepsi er definert ved: (A) Minst to uprovoserte (eller refleks) anfall som forekommer med >24 timers mellomrom; eller (B) ett uprovosert (eller refleks) anfall og en sannsynlighet for ytterligere anfall på minst 60 %; eller (C) diagnose av epilepsisyndrom (4). Intellektuell funksjonshemming (ID) er definert av Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders, Fifth Edition (DSM-5), som en betydelig begrensning i intellektuell funksjon og adaptiv atferd, som inkluderer konseptuelle, sosiale og praktiske ferdigheter, som oppstår før 18 år. .
Disse to tilstandene kan være forårsaket av en rekke miljømessige og genetiske faktorer, ofte kombinert, noe som gjør diagnosen vanskelig (5,6). Standard diagnostiske tilnærminger inkluderer biokjemisk og enzymanalyse for nevrometabolske lidelser, MR-hjerneavbildning og genomomfattende mikroarray-analyse (7-9).
På grunn av den store variasjonen av genotypisk-fenotypisk uttrykk (et syndrom kan ha flere genetiske årsaker; det samme genet kan uttrykkes på forskjellige måter) og den enorme genetiske heterogeniteten, har identifiseringen av genene involvert i disse patologiene lenge vært vanskelig. De siste tiårene har det blitt gjort betydelige fremskritt innen genetikk, med utvikling av nye teknologier som neste generasjons sekvensering (NGS). Disse nye teknikkene tillater sekvensering av mange gener samtidig, til en stadig lavere kostnad, og tillater bruk av disse testene i klinisk praksis rutine med genpaneler, og til og med hel-eksom eller hel-genom sekvensering (10). Vi identifiserte nå mer enn 1000 gener involvert i mekanismer for epilepsi og ID, med forskjellige veier (11-16).
Studietype
Registrering (Faktiske)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
-
Vandoeuvre les Nancy, Frankrike, 54500
- Calina Todosi
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Av de 69 pasientene som ble inkludert i studien, var majoriteten gutter, 62,3 % (43 pasienter) og 37,7 % var jenter (26 pasienter). Denne forskjellen er mest uttalt i underkategorien pasienter med utviklingshemming, med et kjønnsforhold på omtrent 1:2,3. Median alder av befolkningen ved inkludering var 5 år [2,2-17].
Av de totalt 69 pasientene inkludert i vår studie, fikk flertallet fordel av genpanelet for deres intellektuelle funksjonshemming (37 pasienter, dvs. 53,6 %), 13 for deres epilepsi (18,8 % av pasientene) og 19 pasienter hadde begge (dvs. 27,5 %).
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Vi inkluderte i vår studie alle pediatriske pasienter som gjennomgikk genetisk analyse med genpanelet for epilepsi-intellektuell funksjonshemming mellom juni 2019 og mai 2021. Alle disse pasientene var enten epileptiske eller hadde intellektuell funksjonshemming, eller begge deler, av ubestemt eller genetisk antatt etiologi.
Ekskluderingskriterier:
- Vi ekskluderte i) pasienter eldre enn 18 år, ii) de for hvem indikasjonen for genetisk analyse ikke var epilepsi eller intellektuell funksjonshemming iii) pasienter som ikke ble fulgt opp ved Regional University Hospital Centre of Nancy, Frankrike.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Bare epilepsi
Kun epilepsipasienter som gjennomgikk vårt genpanel og den kliniske eksomløsningen
|
retrospektiv analyse av en eksom klinisk løsning
|
|
Kun intellektuell funksjonshemming
Kun pasienter med intellektuell funksjonshemming som gjennomgikk genpanelet vårt og den kliniske eksomløsningen
|
retrospektiv analyse av en eksom klinisk løsning
|
|
Epilepsi og utviklingshemming
Intellektuell funksjonshemming og epilepsipasienter som gjennomgikk genpanelet vårt og den kliniske eksomløsningen
|
retrospektiv analyse av en eksom klinisk løsning
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
bestemme andelen positive resultater ved å bruke vårt panel for epilepsi og utviklingshemming
Tidsramme: 2 år
|
andelen positive resultater etter panelanalysen
|
2 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
evaluering av supplerende positive resultater av CES
Tidsramme: 2 år
|
andelen positive resultater funnet ved bruk av CES og heks var negative ved bruk av panelet
|
2 år
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 2021PI127.
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .