Wykorzystanie sekwencjonowania nowej generacji w diagnostyce padaczki i/lub niepełnosprawności intelektualnej w kohorcie pediatrycznej
Skuteczność sekwencjonowania nowej generacji w diagnostyce padaczki i/lub niepełnosprawności intelektualnej w kohorcie pediatrycznej Regionalnego Szpitala Uniwersyteckiego w Nancy
ABSTRAKCYJNY
Tło i cele:
Aby określić skuteczność diagnostyczną panelu padaczki i niepełnosprawności intelektualnej stosowanego w populacji pediatrycznej, począwszy od czerwca 2019 r., w Regionalnym Centrum Szpitala Uniwersyteckiego w Nancy we Francji.
Projekt:
Badanie obserwacyjne i retrospektywne w Regionalnym Centrum Szpitala Uniwersyteckiego w Nancy we Francji.
Materiały i metody:
Pacjenci pediatryczni, którzy przeszli analizę genetyczną z panelem genów padaczki-niepełnosprawności intelektualnej. Wszyscy ci pacjenci byli albo padaczkowi, albo niepełnosprawni intelektualnie, albo jedno i drugie, o nieokreślonej etiologii.
Wyniki:
Do badania włączono 69 pacjentów. Zidentyfikowaliśmy mutacje sprawcze u 46,4% (32 z 69 pacjentów) tej kohorty po panelu genów i 52,2% (36 pacjentów), w tym pozytywne wyniki po realizacji rozwiązania klinicznego eksomu.
Przegląd badań
Status
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Padaczka i niepełnosprawność intelektualna to powszechne i wysoce heterogenne zaburzenia neurorozwojowe u dzieci. Ich rozpowszechnienie wynosi od 3,2 do 5,1/1000 (1,2) i od 1,3 do 2,2% (3).
Napad padaczkowy jest spowodowany nieprawidłową nadmierną lub synchroniczną aktywnością neuronów. Padaczkę definiuje się jako: (A) Co najmniej dwa nieprowokowane (lub odruchowe) napady padaczkowe występujące w odstępie >24 godzin; lub (B) jeden niesprowokowany (lub odruchowy) napad padaczkowy i prawdopodobieństwo kolejnych napadów co najmniej 60%; lub (C) rozpoznanie zespołu padaczkowego (4). Niepełnosprawność intelektualna (ID) jest zdefiniowana w Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders, wydanie piąte (DSM-5), jako znaczące ograniczenie funkcjonowania intelektualnego i zachowań adaptacyjnych, które obejmują umiejętności koncepcyjne, społeczne i praktyczne, pojawiające się przed 18 rokiem życia .
Te dwa stany mogą być spowodowane różnymi czynnikami środowiskowymi i genetycznymi, często połączonymi, co utrudnia postawienie diagnozy (5,6). Standardowe metody diagnostyczne obejmują analizę biochemiczną i enzymatyczną zaburzeń neurometabolicznych, obrazowanie MRI mózgu i analizę mikromacierzy całego genomu (7-9).
Ze względu na dużą zmienność ekspresji genotypowo-fenotypowej (zespół może mieć kilka przyczyn genetycznych; ten sam gen może ulegać ekspresji na różne sposoby) oraz ogromną niejednorodność genetyczną, identyfikacja genów zaangażowanych w te patologie od dawna jest trudna. W ostatnich dziesięcioleciach dokonał się znaczny postęp w genetyce wraz z rozwojem nowych technologii, takich jak sekwencjonowanie nowej generacji (NGS). Te nowe techniki pozwalają na sekwencjonowanie wielu genów jednocześnie, przy coraz niższych kosztach, umożliwiając stosowanie tych testów w rutynowej praktyce klinicznej z panelami genów, a nawet sekwencjonowanie całego egzomu lub całego genomu (10). Obecnie zidentyfikowaliśmy ponad 1000 genów zaangażowanych w mechanizmy padaczki i ID, z różnymi szlakami (11-16).
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
-
Vandoeuvre les Nancy, Francja, 54500
- Calina Todosi
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Spośród 69 pacjentów włączonych do badania większość stanowili chłopcy, 62,3% (43 pacjentów) i 37,7% stanowiły dziewczynki (26 pacjentów). Ta różnica jest najbardziej wyraźna w podkategorii pacjentów z niepełnosprawnością intelektualną, gdzie stosunek płci wynosi około 1:2,3. Mediana wieku populacji w chwili włączenia wynosiła 5 lat [2,2-17].
Spośród łącznie 69 pacjentów włączonych do naszego badania, większość skorzystała z panelu genów z powodu ich niepełnosprawności intelektualnej (37 pacjentów, tj. 27,5%).
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Do naszego badania włączyliśmy wszystkich pacjentów pediatrycznych, którzy przeszli analizę genetyczną z panelem genów padaczki i niepełnosprawności intelektualnej między czerwcem 2019 r. a majem 2021 r. Wszyscy ci pacjenci byli albo padaczkowi, albo niepełnosprawni intelektualnie, albo jedno i drugie, o nieokreślonej lub przypuszczalnej genetycznie etiologii.
Kryteria wyłączenia:
- Wykluczyliśmy i) pacjentów w wieku powyżej 18 lat, ii) tych, dla których wskazaniem do analizy genetycznej nie była padaczka lub niepełnosprawność intelektualna, iii) pacjentów nieobserwowanych w Regionalnym Centrum Szpitala Uniwersyteckiego w Nancy we Francji.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Tylko epilepsja
Tylko pacjenci z padaczką, którzy przeszli nasz panel genów i kliniczne rozwiązanie exome
|
retrospektywna analiza rozwiązania klinicznego exome
|
|
Tylko niepełnosprawność intelektualna
Tylko pacjenci z niepełnosprawnością intelektualną, którzy przeszli nasz panel genów i kliniczne rozwiązanie exome
|
retrospektywna analiza rozwiązania klinicznego exome
|
|
Padaczka i niepełnosprawność intelektualna
Pacjenci z niepełnosprawnością intelektualną i padaczką, którzy przeszli nasz panel genetyczny i kliniczne rozwiązanie exome
|
retrospektywna analiza rozwiązania klinicznego exome
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
określ liczbę pozytywnych wyników za pomocą naszego panelu padaczki i niepełnosprawności intelektualnej
Ramy czasowe: 2 lata
|
procentowość pozytywnych wyników po analizie panelowej
|
2 lata
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
ocena uzupełniających pozytywnych wyników CES
Ramy czasowe: 2 lata
|
liczba pozytywnych wyników znalezionych przy użyciu CES i negatywnych przy użyciu panelu
|
2 lata
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 2021PI127.
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .