Použití sekvenování nové generace v diagnostice epilepsie a/nebo mentálního postižení u dětské kohorty
Výkon sekvenování nové generace v diagnostice epilepsie a/nebo mentálního postižení v dětské kohortě Centra regionální fakultní nemocnice v Nancy
ABSTRAKTNÍ
Pozadí a cíle:
Stanovit diagnostický výkon panelu epilepsie a mentálního postižení používaného u pediatrické populace, počínaje červnem 2019, v centru regionální univerzitní nemocnice v Nancy ve Francii.
Design:
Observační a retrospektivní studie v Centru regionální univerzitní nemocnice v Nancy ve Francii.
Materiály a metody:
Pediatričtí pacienti, kteří podstoupili genetickou analýzu s panelem genů pro epilepsii a intelektové postižení. Všichni tito pacienti byli buď epileptici, nebo měli mentální postižení, případně obojí, nejasné etiologie.
Výsledek:
Do této studie jsme zařadili 69 pacientů. Kauzativní mutace jsme identifikovali u 46,4 % (32 z 69 pacientů) této kohorty po genovém panelu a 52,2 % (36 pacientů) včetně pozitivních výsledků po realizaci klinického Exome řešení.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
Epilepsie a mentální postižení jsou běžné a vysoce heterogenní neurovývojové poruchy u dětí. Jejich prevalence je 3,2 až 5,1/1000 (1,2) a 1,3 až 2,2 % (3).
Epileptický záchvat je způsoben abnormální nadměrnou nebo synchronní neuronální aktivitou. Epilepsie je definována: (A) Nejméně dva nevyprovokované (nebo reflexní) záchvaty vyskytující se > 24 hodin od sebe; nebo (B) jeden nevyprovokovaný (nebo reflexní) záchvat a pravděpodobnost dalších záchvatů alespoň 60 %; nebo (C) diagnóza epileptického syndromu (4). Intelektuální postižení (ID) je definováno v Diagnostickém a statistickém manuálu duševních poruch, páté vydání (DSM-5), jako významné omezení v intelektuálním fungování a adaptivním chování, které zahrnuje koncepční, sociální a praktické dovednosti, vznikající před dosažením věku 18 let. .
Tyto dva stavy mohou být způsobeny řadou environmentálních a genetických faktorů, často kombinovaných, což ztěžuje diagnostiku [5,6]. Standardní diagnostické přístupy zahrnují biochemickou a enzymovou analýzu neurometabolických poruch, zobrazení mozku MRI a analýzu mikročipů v celém genomu (7-9).
Kvůli velké variabilitě genotypově-fenotypové exprese (syndrom může mít několik genetických příčin; stejný gen může být vyjádřen různými způsoby) a obrovské genetické heterogenitě byla identifikace genů podílejících se na těchto patologiích dlouho obtížná. V posledních desetiletích bylo dosaženo značného pokroku v genetice s vývojem nových technologií, jako je sekvenování nové generace (NGS). Tyto nové techniky umožňují sekvenování mnoha genů současně se stále nižšími náklady, což umožňuje použití těchto testů v běžné klinické praxi s genovými panely a dokonce sekvenování celého exomu nebo celého genomu (10). Nyní jsme identifikovali více než 1000 genů zapojených do mechanismů epilepsie a ID s různými cestami (11-16).
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
Vandoeuvre les Nancy, Francie, 54500
- Calina Todosi
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Ze 69 pacientů zařazených do studie byla většina chlapců, 62,3 % (43 pacientů) a 37,7 % dívek (26 pacientů). Tento rozdíl je nejvýraznější v podkategorii pacientů s mentálním postižením, kde je poměr pohlaví přibližně 1:2,3. Medián věku populace při zařazení byl 5 let [2,2–17].
Z celkového počtu 69 pacientů zařazených do naší studie měla většina prospěch z genového panelu pro své mentální postižení (37 pacientů, tj. 53,6 %), 13 pro svou epilepsii (18,8 % pacientů) a 19 pacientů mělo obojí (tj. 27,5 %).
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Do naší studie jsme zahrnuli všechny dětské pacienty, kteří v období od června 2019 do května 2021 podstoupili genetickou analýzu s panelem genů pro epilepsii a intelektové postižení. Všichni tito pacienti byli buď epileptici, nebo měli mentální postižení, nebo obojí, neurčité nebo geneticky předpokládané etiologie.
Kritéria vyloučení:
- Vyloučili jsme i) pacienty starší 18 let, ii) ty, u nichž indikací ke genetické analýze nebyla epilepsie nebo mentální postižení, iii) pacienty, kteří nebyli sledováni v Centru regionální fakultní nemocnice v Nancy ve Francii.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Pouze epilepsie
Pouze pacienti s epilepsií, kteří podstoupili náš genový panel a řešení klinického exomu
|
retrospektivní analýza klinického řešení exomu
|
|
Pouze mentální postižení
Pouze pacienti s mentálním postižením, kteří podstoupili náš genový panel a řešení klinického exomu
|
retrospektivní analýza klinického řešení exomu
|
|
Epilepsie a mentální postižení
Pacienti s mentálním postižením a epilepsií, kteří podstoupili náš genový panel a řešení klinického exomu
|
retrospektivní analýza klinického řešení exomu
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
určete procento pozitivních výsledků pomocí našeho panelu epilepsie a mentálního postižení
Časové okno: 2 roky
|
procentuální podíl pozitivních výsledků po panelové analýze
|
2 roky
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
vyhodnocení doplňkových pozitivních výsledků CES
Časové okno: 2 roky
|
procento pozitivních výsledků nalezených pomocí CES a které bylo negativní pomocí panelu
|
2 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Aktuální)
Dokončení studie (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 2021PI127.
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .