Gebruik van sequentiëring van de volgende generatie bij de diagnose van epilepsie en/of verstandelijke beperking in een pediatrisch cohort
De prestaties van next-generation sequencing bij de diagnose van epilepsie en/of verstandelijke beperking in het pediatrische cohort van het Regionaal Universitair Ziekenhuiscentrum van Nancy
ABSTRACT
Achtergrond en doelstellingen:
Om de diagnostische prestaties te bepalen van het panel voor epilepsie en verstandelijke beperking dat wordt gebruikt bij de pediatrische populatie, vanaf juni 2019, in het Regionaal Universitair Ziekenhuiscentrum van Nancy, Frankrijk.
Ontwerp:
Een observationele en retrospectieve studie, in het Regionaal Universitair Ziekenhuiscentrum van Nancy, Frankrijk.
Materialen en methodes:
Pediatrische patiënten die genetische analyse ondergingen met het genenpanel epilepsie-intellectuele handicap. Al deze patiënten waren epileptisch of hadden een verstandelijke beperking, of beide, van onbepaalde etiologie.
Resultaten:
We includeerden 69 patiënten in deze studie. We identificeerden oorzakelijke mutaties in 46,4% (32 van 69 patiënten) van dit cohort na het genenpanel en 52,2% (36 patiënten) inclusief positieve resultaten na realisatie van de Clinical Exome Solution.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Epilepsie en verstandelijke beperking zijn veelvoorkomende en zeer heterogene neurologische ontwikkelingsstoornissen bij kinderen. Hun respectievelijke prevalentie is 3,2 tot 5,1/1000 (1,2) en 1,3 tot 2,2% (3).
Een epileptische aanval is het gevolg van abnormale overmatige of synchrone neuronale activiteit. Epilepsie wordt gedefinieerd door: (A) ten minste twee niet-uitgelokte (of reflex) aanvallen die >24 uur na elkaar optreden; of (B) één niet-uitgelokte (of reflex) aanval en een kans op verdere aanvallen van ten minste 60%; of (C) diagnose van een epilepsiesyndroom (4). Intellectuele handicap (ID) wordt gedefinieerd door de Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders, Fifth Edition (DSM-5), als een significante beperking in intellectueel functioneren en adaptief gedrag, waaronder conceptuele, sociale en praktische vaardigheden, ontstaan vóór de leeftijd van 18 .
Deze twee aandoeningen kunnen worden veroorzaakt door een verscheidenheid aan omgevings- en genetische factoren, vaak gecombineerd, waardoor de diagnose moeilijk wordt (5,6). Standaard diagnostische benaderingen omvatten biochemische en enzymanalyse voor neurometabolische aandoeningen, MRI-beeldvorming van de hersenen en genoombrede microarray-analyse (7-9).
Vanwege de grote variabiliteit van genotypisch-fenotypische expressie (een syndroom kan verschillende genetische oorzaken hebben; hetzelfde gen kan op verschillende manieren tot expressie worden gebracht) en de enorme genetische heterogeniteit, is de identificatie van de genen die betrokken zijn bij deze pathologieën lange tijd moeilijk geweest. In de genetica is de afgelopen decennia aanzienlijke vooruitgang geboekt met de ontwikkeling van nieuwe technologieën zoals next-generation sequencing (NGS). Deze nieuwe technieken maken de sequentiebepaling van vele genen tegelijkertijd mogelijk, tegen steeds lagere kosten, waardoor het gebruik van deze tests in de klinische praktijkroutine met genenpanels en zelfs sequentiebepaling van het hele exoom of het hele genoom mogelijk wordt (10). We hebben nu meer dan 1000 genen geïdentificeerd die betrokken zijn bij mechanismen van epilepsie en ID, met verschillende routes (11-16).
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
-
Vandoeuvre les Nancy, Frankrijk, 54500
- Calina Todosi
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Van de 69 patiënten die deelnamen aan het onderzoek waren de meeste jongens, 62,3% (43 patiënten) en 37,7% meisjes (26 patiënten). Dit verschil is het meest uitgesproken in de subcategorie patiënten met een verstandelijke beperking, met een geslachtsverhouding van ongeveer 1:2,3. De mediane leeftijd van de bevolking bij opname was 5 jaar [2.2-17].
Van de in totaal 69 patiënten die deelnamen aan onze studie, profiteerde de meerderheid van het genenpanel voor hun verstandelijke beperking (37 patiënten, d.w.z. 53,6%), 13 voor hun epilepsie (18,8% van de patiënten) en 19 patiënten hadden beide (d.w.z. 27,5%).
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- We namen in onze studie alle pediatrische patiënten op die tussen juni 2019 en mei 2021 een genetische analyse ondergingen met het epilepsie-intellectuele handicap-genenpanel. Al deze patiënten waren of epileptisch of hadden een verstandelijke beperking, of beide, van onbepaalde of genetisch veronderstelde etiologie.
Uitsluitingscriteria:
- We hebben i) patiënten ouder dan 18 jaar uitgesloten, ii) degenen voor wie de indicatie voor genetische analyse geen epilepsie of verstandelijke beperking was, iii) patiënten die niet werden opgevolgd in het Regionaal Universitair Ziekenhuiscentrum van Nancy, Frankrijk.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Alleen epilepsie
Alleen epilepsiepatiënten die ons genenpanel en de Clinical exome Solution hebben ondergaan
|
retrospectieve analyse van een exome klinische oplossing
|
|
Alleen verstandelijke beperking
Alleen patiënten met een verstandelijke beperking die ons genenpanel en de Clinical Exome Solution hebben ondergaan
|
retrospectieve analyse van een exome klinische oplossing
|
|
Epilepsie en verstandelijke beperking
Patiënten met een verstandelijke beperking en epilepsie die ons genenpanel en de Clinical Exome Solution hebben ondergaan
|
retrospectieve analyse van een exome klinische oplossing
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
bepaal het percentage positieve resultaten met behulp van ons panel voor epilepsie en verstandelijke beperking
Tijdsspanne: 2 jaar
|
het percentage positieve resultaten na de panelanalyse
|
2 jaar
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
evaluatie van aanvullende positieve resultaten van de CES
Tijdsspanne: 2 jaar
|
het percentage positieve resultaten gevonden met behulp van de CES en die negatief waren met behulp van het panel
|
2 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 2021PI127.
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .