Konstrukce multi-omics databáze zdravých korejských dobrovolníků
Klinická studie pro multi-omickou databázi Konstrukce kohorty zdravých korejských dobrovolníků pro integrativní mikrobiomovou analýzu
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Typ studie
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Bo-Hyung Kim, M.D., Ph.D.
- Telefonní číslo: +82-2-958-9765
- E-mail: bhkim98@khu.ac.kr
Studijní místa
-
-
-
Seoul, Korejská republika, 02447
- Nábor
- Kyung Hee University Hospital
-
Kontakt:
- Bo-Hyung Kim, MD, PhD
- Telefonní číslo: 82-2-958-9326
- E-mail: bhkim98@khu.ac.kr
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Subjekty, kterým je v době udělení informovaného souhlasu alespoň 13 let a není starší 85 let.
- Subjekty, které obdržely vyčerpávající vysvětlení této studie, plně jí rozumí a dobrovolně souhlasily s účastí a poskytly podepsaný a datovaný informovaný souhlas.
- Subjekty, které výzkumník považoval za způsobilé k účasti ve studii, na základě screeningových postupů včetně fyzikálního vyšetření, klinických laboratorních testů a dotazníků.
Kritéria vyloučení:
- Subjekty s indexem tělesné hmotnosti (BMI) nižším než 17,0 nebo vyšším než 30,0.
- Vitální funkce v klidu vykazující systolický krevní tlak ≥ 160 mmHg nebo diastolický krevní tlak ≥ 100 mmHg, spolu s příznaky souvisejícími s vysokým krevním tlakem, jako jsou bolesti hlavy.
- Historie užívání specifikovaných léků během předem stanoveného období před odběrem mikrobiomu, jak je podrobně uvedeno v příloze.
- Přijetí jakékoli vakcinace během posledních 4 týdnů před odběrem mikrobiomu.
- Použití topických antibiotik nebo steroidů na obličej, pokožku hlavy, krk, paže, předloktí nebo ruce do 24 hodin před odběrem mikrobiomu.
- Aplikace vaginálních nebo vulválních léků, včetně antimykotik, do 24 hodin od odběru mikrobiomu.
- Přítomnost akutního onemocnění v době zápisu. Akutní onemocnění je definováno jako přítomnost středně těžkého nebo těžkého onemocnění s horečkou nebo bez ní. Odběr vzorků lze odložit, dokud se subjekt nezotaví.
- Anamnéza chronických, klinicky významných poruch postihujících jaterní, trávicí, oběhový, renální, neurologický, respirační, endokrinní, imunitní nebo hematologický systém, stejně jako zhoubné nádory, psychiatrické stavy nebo zneužívání návykových látek.
- Podstatné změny stravy pro rychlý nárůst nebo úbytek hmotnosti během 4 týdnů od odběru mikrobiomu.
- Pozitivní sérologické testy (testy na HBs antigen, HCV protilátky a HIV protilátky) nebo výsledky nad referenčním rozmezím.
- Historie gastrointestinální chirurgie, s výjimkou jednoduchých postupů, jako je apendektomie, cholecystektomie nebo oprava kýly.
- Přítomnost gastrointestinálních stavů, které mohou ovlivnit analýzu mikrobiomu a nejsou pod lékařskou kontrolou, včetně zánětlivého onemocnění střev (IBD) včetně Crohnovy choroby a ulcerózní kolitidy, syndromu dráždivého tračníku (IBS) vyžadujícího léky, vředy, akutní nebo chronická pankreatitida a chronická zácpa vyžadující léčbu léky.
- Diagnóza ankylozující spondylitidy.
- Požadavek na pravidelné používání inkontinenčních plen.
- Pozitivní těhotenský test nebo těhotenství nebo kojení.
- Jakýkoli zdravotní stav podezřelý v době odběru mikrobiomu, který může ovlivnit integritu vzorku.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Relativní hojnost mikrobomu
Časové okno: 5 let
|
Analýza složení mikrobiální komunity bude provedena pomocí sekvenování 16s rRNA genového amplikonu.
Bude hodnocena relativní četnost mikrobiálních druhů na úrovni rodu nebo čeledi.
|
5 let
|
|
Alfa diverzita mikrobiomu (Shannonův index diverzity)
Časové okno: 5 let
|
Alfa diverzita bude měřena pomocí Shannonova indexu diverzity, aby se spojila bohatost a hojnost ASV do jediné hodnoty rovnoměrnosti
|
5 let
|
|
Alfa diverzita mikrobiomu (Fisherův index)
Časové okno: 5 let
|
Alfa diverzita bude měřena pomocí Fisherova indexu, který vypočítává vztah mezi abundancí a počtem
|
5 let
|
|
Alfa diverzita mikrobiomu (celý strom fylogenetické diverzity Faith)
Časové okno: 5 let
|
Alfa diverzita bude měřena pomocí Faithova celého stromu fylogenetické diverzity, který představuje součet délek všech větví jako míru fylogeneze a diverzity.
|
5 let
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Plocha vrcholu metabolitu (metabolomika)
Časové okno: 5 let
|
Analýza metabolitů bude provedena porovnáním ID metabolitu získaného z LC/MS s databází lidských metabolomů (HMDB) pro identifikaci metabolitů.
Analýza rozdílu metabolitů mezi skupinami bude provedena pomocí PCA nebo PLS-DA pomocí MZmine3, OpenChrome nebo Metaboanalyst v5.0.
|
5 let
|
|
Relativní hojnost (virome)
Časové okno: 5 let
|
Analýza celkových virových profilů bude provedena porovnáním sekvence virového proteinu s virovou databází NCBI refseq a anotací taxonomie.
|
5 let
|
|
Počet genů (transkriptomika)
Časové okno: 5 let
|
Analýza profilů bakteriální mRNA bude provedena pomocí mapování čtení pomocí databáze NCBI RefSeq, kvantifikace genu a transkriptu & bakteriálního taxonomického profilování pomocí potrubí HUMAnN a MetaPhlAn, kvantifikace transkriptů a identifikace odlišně exprimovaného genu pomocí souboru SALMON a lidského referenčního genomu fastq.
|
5 let
|
|
Počet izolovaně odlišně hojných bakteriálních kmenů (kulturomika)
Časové okno: 5 let
|
Bakteriální kmeny, které vykazují rozdílnou hojnost mezi zdravými jedinci a pacienty, budou naočkovány, izolovány a identifikovány.
|
5 let
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Spolupracovníci
Spolupracovníci
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Odhadovaný)
Primární dokončení
Dokončení studie (Odhadovaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- MB-HV-01
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .