Aufbau einer Multi-Omics-Datenbank für gesunde koreanische Freiwillige
Klinische Studie zum Aufbau einer Multi-Omics-Datenbank an einer Kohorte gesunder koreanischer Freiwilliger zur integrativen Mikrobiomanalyse
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
Studienkontakt
- Name: Bo-Hyung Kim, M.D., Ph.D.
- Telefonnummer: +82-2-958-9765
- E-Mail: bhkim98@khu.ac.kr
Studienorte
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Seoul, Korea, Republik von, 02447
- Rekrutierung
- Kyung Hee University Hospital
-
Kontakt:
- Bo-Hyung Kim, MD, PhD
- Telefonnummer: 82-2-958-9326
- E-Mail: bhkim98@khu.ac.kr
-
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Kind
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Probanden, die zum Zeitpunkt der Einwilligung nach Aufklärung mindestens 13 Jahre und nicht älter als 85 Jahre alt sind.
- Probanden, die eine umfassende Erläuterung dieser Studie erhalten haben, diese vollständig verstehen und sich freiwillig zur Teilnahme bereit erklärt haben, indem sie eine unterzeichnete und datierte Einverständniserklärung vorgelegt haben.
- Probanden, die vom Forscher auf der Grundlage von Screening-Verfahren einschließlich körperlicher Untersuchung, klinischen Labortests und Fragebögen als für die Teilnahme an der Studie geeignet erachtet werden.
Ausschlusskriterien:
- Probanden mit einem Body-Mass-Index (BMI) unter 17,0 oder über 30,0.
- Vitalzeichen in Ruhe, die einen systolischen Blutdruck ≥ 160 mmHg oder einen diastolischen Blutdruck ≥ 100 mmHg sowie Symptome im Zusammenhang mit hohem Blutdruck wie Kopfschmerzen zeigen.
- Vorgeschichte des Konsums bestimmter Medikamente innerhalb eines vorgegebenen Zeitraums vor der Mikrobiom-Entnahme, wie im Anhang beschrieben.
- Erhalt einer Impfung innerhalb der letzten 4 Wochen vor der Mikrobiom-Entnahme.
- Anwendung von topischen Antibiotika oder Steroiden auf Gesicht, Kopfhaut, Hals, Armen, Unterarmen oder Händen innerhalb von 24 Stunden vor der Mikrobiom-Entnahme.
- Anwendung von Vaginal- oder Vulvamedikamenten, einschließlich Antimykotika, innerhalb von 24 Stunden nach der Mikrobiomentnahme.
- Vorliegen einer akuten Erkrankung zum Zeitpunkt der Einschreibung. Unter einer akuten Erkrankung versteht man das Vorliegen einer mittelschweren oder schweren Erkrankung mit oder ohne Fieber. Die Probenahme kann verschoben werden, bis sich das Subjekt erholt hat.
- Vorgeschichte chronischer, klinisch bedeutsamer Störungen des Leber-, Verdauungs-, Kreislauf-, Nieren-, neurologischen, respiratorischen, endokrinen, immunologischen oder hämatologischen Systems sowie bösartiger Tumoren, psychiatrischer Erkrankungen oder Drogenmissbrauch.
- Wesentliche Ernährungsumstellungen für eine schnelle Gewichtszunahme oder -abnahme innerhalb von 4 Wochen nach der Mikrobiom-Entnahme.
- Positive serologische Tests (HBs-Antigen-, HCV-Antikörper- und HIV-Antikörpertests) oder Ergebnisse oberhalb des Referenzbereichs.
- Vorgeschichte von Magen-Darm-Operationen, mit Ausnahme einfacher Eingriffe wie Blinddarmentfernung, Cholezystektomie oder Hernienreparatur.
- Vorliegen von Magen-Darm-Erkrankungen, die die Mikrobiomanalyse beeinflussen können und nicht unter ärztlicher Kontrolle stehen, einschließlich entzündlicher Darmerkrankungen (IBD), einschließlich Morbus Crohn und Colitis ulcerosa, Reizdarmsyndrom (IBS), das Medikamente erfordert, Geschwüren, akuter oder chronischer Pankreatitis und chronischer Verstopfung, die Medikamente erfordern Medikamente.
- Diagnose einer Morbus Bechterew.
- Voraussetzung für die regelmäßige Verwendung von Inkontinenzwindeln.
- Positiver Schwangerschaftstest oder Schwangerschaft oder Stillzeit.
- Jeder zum Zeitpunkt der Mikrobiom-Entnahme vermutete medizinische Zustand, der die Integrität der Probe beeinträchtigen könnte.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Relative Häufigkeit von Mikroben
Zeitfenster: 5 Jahre
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Die Analyse der Zusammensetzung der mikrobiellen Gemeinschaft wird mithilfe der 16s-rRNA-Gen-Amplikonsequenzierung durchgeführt.
Die relative Häufigkeit mikrobieller Arten auf Gattungs- oder Familienebene wird bewertet.
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5 Jahre
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Alpha-Diversität des Mikrobioms (Shannon-Diversitätsindex)
Zeitfenster: 5 Jahre
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Die Alpha-Diversität wird mithilfe des Shannon-Diversitätsindex gemessen, um ASV-Reichtum und -Hunde in einem einzigen Gleichmäßigkeitswert zu kombinieren
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5 Jahre
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Alpha-Diversität des Mikrobioms (Fisher-Index)
Zeitfenster: 5 Jahre
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Die Alpha-Diversität wird mithilfe des Fisher-Index gemessen, der die Beziehung zwischen Häufigkeit und Anzahl berechnet
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5 Jahre
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Alpha-Diversität des Mikrobioms (Faiths phylogenetische Diversität im gesamten Baum)
Zeitfenster: 5 Jahre
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Die Alpha-Diversität wird anhand des phylogenetischen Diversitätsgesamtbaums von Faith gemessen, der die Summe aller Zweiglängen als Maß für Phylogenie und Diversität darstellt.
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5 Jahre
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Sekundäre Ergebnismessungen
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Metaboliten-Peakfläche (Metabolomik)
Zeitfenster: 5 Jahre
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Die Analyse der Metaboliten erfolgt durch Abgleich der mittels LC/MS erhaltenen Metaboliten-ID mit der Human Metabolome Database (HMDB) zur Metabolitenidentifizierung.
Die Analyse des Metabolitenunterschieds zwischen den Gruppen wird von PCA oder PLS-DA unter Verwendung von MZmine3, OpenChrome oder Metaboanalyst v5.0 durchgeführt.
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5 Jahre
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Relative Häufigkeit (Virom)
Zeitfenster: 5 Jahre
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Die Analyse der Gesamtvirusprofile erfolgt durch Vergleich der viralen Proteinsequenz mit der NCBI-Refseq-Virusdatenbank und Taxonomieannotation.
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5 Jahre
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Genzählung (Transkriptomik)
Zeitfenster: 5 Jahre
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Die Analyse bakterieller mRNA-Profile erfolgt durch Lesekartierung mithilfe der NCBI-RefSeq-Datenbank, Quantifizierung von Genen und Transkripten sowie bakterieller taxonomischer Profilierung mithilfe der HUMAnN- und MetaPhlAn-Pipeline, Transkriptquantifizierung und Identifizierung differenziell exprimierter Gene mithilfe von SALMON und der Fastq-Datei des menschlichen Referenzgenoms.
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5 Jahre
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Anzahl der unterschiedlich häufig vorkommenden isolierten Bakterienstämme (Culturomics)
Zeitfenster: 5 Jahre
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Bakterienstämme, die bei gesunden Personen und Patienten eine unterschiedliche Häufigkeit aufweisen, werden geimpft, isoliert und identifiziert.
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5 Jahre
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Mitarbeiter
Mitarbeiter
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Geschätzt)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Andere Studien-ID-Nummern
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- MB-HV-01
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Produkt, das in den USA hergestellt und aus den USA exportiert wird
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