Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Konstrukce multi-omics databáze zdravých korejských dobrovolníků

26. prosince 2023 aktualizováno: BoHyung Kim, Kyunghee University Medical Center

Klinická studie pro multi-omickou databázi Konstrukce kohorty zdravých korejských dobrovolníků pro integrativní mikrobiomovou analýzu

Cílem této prospektivní observační studie je shromáždit údaje související se zdravím, včetně mikrobiomu, vzorků krve a stravovacích návyků z ústního a gastrointestinálního traktu u zdravých subjektů. Kromě toho je cílem studie provést mikrobiomickou a multi-omickou analýzu na shromážděných vzorcích a vybudovat integrovanou databázi dat.

Přehled studie

Postavení

Zatím nenabíráme

Podmínky

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Odhadovaný)

3000

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

  • Jméno: Bo-Hyung Kim, M.D., Ph.D.
  • Telefonní číslo: +82-2-958-9765
  • E-mail: bhkim98@khu.ac.kr

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

  • Dítě
  • Dospělý
  • Starší dospělý

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ano

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Zdraví dobrovolníci

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Subjekty, kterým je v době udělení informovaného souhlasu alespoň 13 let a není starší 85 let.
  • Subjekty, které obdržely vyčerpávající vysvětlení této studie, plně jí rozumí a dobrovolně souhlasily s účastí a poskytly podepsaný a datovaný informovaný souhlas.
  • Subjekty, které výzkumník považoval za způsobilé k účasti ve studii, na základě screeningových postupů včetně fyzikálního vyšetření, klinických laboratorních testů a dotazníků.

Kritéria vyloučení:

  • Subjekty s indexem tělesné hmotnosti (BMI) nižším než 17,0 nebo vyšším než 30,0.
  • Vitální funkce v klidu vykazující systolický krevní tlak ≥ 160 mmHg nebo diastolický krevní tlak ≥ 100 mmHg, spolu s příznaky souvisejícími s vysokým krevním tlakem, jako jsou bolesti hlavy.
  • Historie užívání specifikovaných léků během předem stanoveného období před odběrem mikrobiomu, jak je podrobně uvedeno v příloze.
  • Přijetí jakékoli vakcinace během posledních 4 týdnů před odběrem mikrobiomu.
  • Použití topických antibiotik nebo steroidů na obličej, pokožku hlavy, krk, paže, předloktí nebo ruce do 24 hodin před odběrem mikrobiomu.
  • Aplikace vaginálních nebo vulválních léků, včetně antimykotik, do 24 hodin od odběru mikrobiomu.
  • Přítomnost akutního onemocnění v době zápisu. Akutní onemocnění je definováno jako přítomnost středně těžkého nebo těžkého onemocnění s horečkou nebo bez ní. Odběr vzorků lze odložit, dokud se subjekt nezotaví.
  • Anamnéza chronických, klinicky významných poruch postihujících jaterní, trávicí, oběhový, renální, neurologický, respirační, endokrinní, imunitní nebo hematologický systém, stejně jako zhoubné nádory, psychiatrické stavy nebo zneužívání návykových látek.
  • Podstatné změny stravy pro rychlý nárůst nebo úbytek hmotnosti během 4 týdnů od odběru mikrobiomu.
  • Pozitivní sérologické testy (testy na HBs antigen, HCV protilátky a HIV protilátky) nebo výsledky nad referenčním rozmezím.
  • Historie gastrointestinální chirurgie, s výjimkou jednoduchých postupů, jako je apendektomie, cholecystektomie nebo oprava kýly.
  • Přítomnost gastrointestinálních stavů, které mohou ovlivnit analýzu mikrobiomu a nejsou pod lékařskou kontrolou, včetně zánětlivého onemocnění střev (IBD) včetně Crohnovy choroby a ulcerózní kolitidy, syndromu dráždivého tračníku (IBS) vyžadujícího léky, vředy, akutní nebo chronická pankreatitida a chronická zácpa vyžadující léčbu léky.
  • Diagnóza ankylozující spondylitidy.
  • Požadavek na pravidelné používání inkontinenčních plen.
  • Pozitivní těhotenský test nebo těhotenství nebo kojení.
  • Jakýkoli zdravotní stav podezřelý v době odběru mikrobiomu, který může ovlivnit integritu vzorku.

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Relativní hojnost mikrobomu
Časové okno: 5 let
Analýza složení mikrobiální komunity bude provedena pomocí sekvenování 16s rRNA genového amplikonu. Bude hodnocena relativní četnost mikrobiálních druhů na úrovni rodu nebo čeledi.
5 let
Alfa diverzita mikrobiomu (Shannonův index diverzity)
Časové okno: 5 let
Alfa diverzita bude měřena pomocí Shannonova indexu diverzity, aby se spojila bohatost a hojnost ASV do jediné hodnoty rovnoměrnosti
5 let
Alfa diverzita mikrobiomu (Fisherův index)
Časové okno: 5 let
Alfa diverzita bude měřena pomocí Fisherova indexu, který vypočítává vztah mezi abundancí a počtem
5 let
Alfa diverzita mikrobiomu (celý strom fylogenetické diverzity Faith)
Časové okno: 5 let
Alfa diverzita bude měřena pomocí Faithova celého stromu fylogenetické diverzity, který představuje součet délek všech větví jako míru fylogeneze a diverzity.
5 let

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Plocha vrcholu metabolitu (metabolomika)
Časové okno: 5 let
Analýza metabolitů bude provedena porovnáním ID metabolitu získaného z LC/MS s databází lidských metabolomů (HMDB) pro identifikaci metabolitů. Analýza rozdílu metabolitů mezi skupinami bude provedena pomocí PCA nebo PLS-DA pomocí MZmine3, OpenChrome nebo Metaboanalyst v5.0.
5 let
Relativní hojnost (virome)
Časové okno: 5 let
Analýza celkových virových profilů bude provedena porovnáním sekvence virového proteinu s virovou databází NCBI refseq a anotací taxonomie.
5 let
Počet genů (transkriptomika)
Časové okno: 5 let
Analýza profilů bakteriální mRNA bude provedena pomocí mapování čtení pomocí databáze NCBI RefSeq, kvantifikace genu a transkriptu & bakteriálního taxonomického profilování pomocí potrubí HUMAnN a MetaPhlAn, kvantifikace transkriptů a identifikace odlišně exprimovaného genu pomocí souboru SALMON a lidského referenčního genomu fastq.
5 let
Počet izolovaně odlišně hojných bakteriálních kmenů (kulturomika)
Časové okno: 5 let
Bakteriální kmeny, které vykazují rozdílnou hojnost mezi zdravými jedinci a pacienty, budou naočkovány, izolovány a identifikovány.
5 let

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Odhadovaný)

1. prosince 2023

Primární dokončení (Odhadovaný)

1. prosince 2025

Dokončení studie (Odhadovaný)

1. prosince 2025

Termíny zápisu do studia

První předloženo

23. listopadu 2023

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

14. prosince 2023

První zveřejněno (Aktuální)

27. prosince 2023

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Odhadovaný)

1. ledna 2024

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

26. prosince 2023

Naposledy ověřeno

1. prosince 2023

Více informací

Termíny související s touto studií

Další identifikační čísla studie

  • MB-HV-01

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NE

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Zdravý

3
Předplatit