Prevalence neexprimující mutace 11B u národů Aka ve Středoafrické republice

Proteiny CCCH tandemových zinkových prstů jsou členy malé rodiny proteinů, které regulují stabilitu určitých typů mRNA obsahujících takzvané prvky bohaté na AU třídy II ve svých 3'-nepřeložených oblastech. Nejlépe prozkoumaný člen této proteinové rodiny, tristetraprolin (TTP), vykazuje tento destabilizační účinek na nejméně dvě mRNA kódující fyziologicky a lékařsky důležité cytokiny, tumor nekrotizující faktor alfa a faktor stimulující kolonie makrofágů granulocytů. Fyziologické funkce dalších dvou členů této proteinové rodiny u savců, 11B a 11D, nejsou známy, ale v experimentálních transfekčních studiích také mohou destabilizovat mRNA obsahující tento typ prvku bohatého na AU.

V rámci projektu Environmental Genome Project jsme resekvenovali proteinové kódující části lidských genů kódujících tyto tři proteiny a odhalili mutaci dinukleotidového místa sestřihu v genu 11B v jedné ze 144 sekvenovaných alel. Ukázali jsme, že tato mutace vytvořila nový polymorfismus délky restrikčních fragmentů a že tato mutace vedla k selhání sestřihu a exprese mRNA kódované mutantní alelou. Na základě našich předchozích údajů o myších zcela deficientních na TTP předpokládáme, že úplný nedostatek tohoto proteinu a možná i jeho částečný nedostatek by vedl k onemocnění člověka.

Mutovaná alela byla od anonymních dospělých žen Aka Pygmy ze Středoafrické republiky. Navrhujeme genotypovat až 1000 členů této etnické skupiny po získání DNA bukálních buněk z nich. To nám dá přibližnou představu o prevalenci této mutace v této populaci. Pokud je mutace nalezena u významného počtu žijících jedinců v tomto počátečním screeningu, pak navrhneme pozdější studii jedinců, kteří mají tento genotyp, a jejich rodin. Tato druhá studie, která bude přezkoumána samostatně, se pokusí dát do souvislosti tento genotyp s lidským znakem nebo fenotypem a možným léčitelným lidským onemocněním.