Распространенность неэкспрессирующей мутации 11B у народов ака в Центральноафриканской Республике

Тандемные белки цинковых пальцев CCCH являются членами небольшого семейства белков, которые регулируют стабильность определенных типов мРНК, содержащих так называемые AU-богатые элементы класса II в своих 3'-нетранслируемых областях. Наиболее изученный член этого семейства белков, тристетрапролин (ТТР), оказывает такое дестабилизирующее действие по меньшей мере на две мРНК, кодирующие физиологически и медицинские важные цитокины, фактор некроза опухоли альфа и колониестимулирующий фактор макрофагов гранулоцитов. Физиологические функции двух других членов этого семейства белков у млекопитающих, 11B и 11D, неизвестны, но в экспериментальных исследованиях трансфекции они также могут дестабилизировать мРНК, содержащие этот тип элемента, богатого AU.

В рамках проекта «Экологический геном» мы повторно секвенировали части генов человека, кодирующие эти три белка, и обнаружили мутацию сайта сплайсинга динуклеотидов в гене 11B в одном из 144 секвенированных аллелей. Мы показали, что эта мутация создает новый полиморфизм длины рестрикционных фрагментов и что эта мутация приводит к нарушению сплайсинга и экспрессии мРНК, кодируемой мутантным аллелем. Основываясь на наших предыдущих данных о мышах с полным дефицитом ТТР, мы ожидаем, что полный дефицит этого белка и, возможно, его частичный дефицит приведет к заболеванию человека.

Мутантный аллель был получен от анонимной взрослой женщины-пигмея из Центральноафриканской Республики. Мы предлагаем генотипировать до 1000 представителей этой этнической группы после получения от них буккальной клеточной ДНК. Это даст нам приблизительное представление о распространенности этой мутации в данной популяции. Если мутация будет обнаружена у значительного числа живых особей в этом начальном скрининге, то мы предложим более позднее исследование особей с этим генотипом и их семей. В этом втором исследовании, которое будет рассмотрено отдельно, будет предпринята попытка сопоставить этот генотип с человеческим признаком или фенотипом и возможным излечимым заболеванием человека.