Ei-ilmentävän 11B-mutaation esiintyvyys Keski-Afrikan tasavallan aka-kansoissa

CCCH:n tandem-sinkkisormiproteiinit ovat pienen proteiiniperheen jäseniä, jotka säätelevät tiettyjen mRNA-tyyppien stabiilisuutta, jotka sisältävät niin kutsuttuja luokan II AU-rikkaita elementtejä niiden 3'-transloitumattomilla alueilla. Tämän proteiiniperheen parhaiten tutkitulla jäsenellä, tristetraproliinilla (TTP), on tämä epävakauttava vaikutus ainakin kahteen mRNA:han, jotka koodaavat fysiologisesti ja lääketieteellisesti tärkeitä sytokiinejä, tuumorinekroositekijä alfaa ja granulosyyttimakrofagipesäkkeitä stimuloivaa tekijää. Tämän proteiiniperheen kahden muun jäsenen fysiologisia toimintoja nisäkkäillä, 11B ja 11D, ei tunneta, mutta kokeellisissa transfektiotutkimuksissa ne voivat myös destabiloida tämän tyyppistä AU-rikasta elementtiä sisältävät mRNA:t.

Osana Environmental Genome Projectia sekvensoimme uudelleen näitä kolmea proteiinia koodaavien ihmisen geenien proteiineja koodaavat osat ja paljastimme dinukleotidin silmukointikohdan mutaation 11B-geenissä yhdessä 144 sekvensoidusta alleelista. Osoitimme, että tämä mutaatio loi uuden restriktiofragmentin pituuden polymorfismin ja että tämä mutaatio johti mutanttialleelin koodaaman mRNA:n silmukoinnin ja ilmentymisen epäonnistumiseen. Aiempien tietojemme perusteella hiirillä, joilla oli täysin TTP-puutos, odotamme, että tämän proteiinin täydellinen puutos ja mahdollisesti sen osittainen puute johtaisi ihmisten sairauteen.

Mutanttialleeli oli anonyymiltä aikuisilta Aka Pygmy -naisista Keski-Afrikan tasavallasta. Ehdotamme genotyyppiä jopa 1000 tämän etnisen ryhmän jäsentä saatuaan heiltä bukkaalisolu-DNA:ta. Tämä antaa meille likimääräisen käsityksen tämän mutaation esiintyvyydestä tässä populaatiossa. Jos mutaatio löytyy merkittävästä määrästä eläviä yksilöitä tässä alkuperäisessä seulonnassa, ehdotamme myöhempää tutkimusta yksilöistä, joilla on tämä genotyyppi, ja heidän perheitään. Tämä toinen tutkimus, jota tarkastellaan erikseen, yrittää korreloida tämän genotyypin ihmisen ominaisuuden tai fenotyypin ja mahdollisen hoidettavan ihmisen sairauden kanssa.