Proteom mozkomíšního moku v hydrocefalu (PROLIPHYC)

CSF proteom je obsah proteinu v reálném čase, který může odhalit užitečné biomarkery pro diagnostiku a terapeutické rozhodování. Ale nízká koncentrace proteinu v CSF a nízké objemy typicky získané po lumbální punkci znemožňují konvenční použití proteomické analýzy. Metodu jsme miniaturizovali tak, aby byla kompatibilní s maloobjemovými vzorky, kombinací analýzy nanoLC-MS/MS a technologie kombinatorické knihovny peptidových ligandů, abychom snížili dynamický rozsah koncentrace proteinu v CSF a odkryli dříve nedetekované proteiny. Ukázali jsme, že tato hluboká proteomická analýza umožňuje profilování proteomu CSF s rozumnou hloubkou, v krátkých analytických časech a dobré přesnosti. Stanovili jsme klinicky kompatibilní proteomickou strategii zaměřenou na hluboký objev proteomu CSF.

Studie PROLIPHYC je prospektivní studie, jejímž cílem je analyzovat proteom CSF s naší novou strategií u kohorty pacientů s podezřením na normální tlakový hydrocefalus a/nebo související neurodegenerativní onemocnění. Projekt PROLIPHYC kombinuje podrobné klinické a neuropsychologické hodnocení, analýzu chůze, zobrazení mozku MRI, bederní dynamiku CSF a hluboký proteom. Ve studii PROLIPHYC předpokládáme, že specifický shluk polypeptidů může být spojen s Alzheimerovou chorobou, vaskulární demencí a normálním tlakovým hydrocefalickým profilem. Potvrzení této hypotézy může být významným krokem k proteomickému lexikonu stárnutí mozku, neurodegenerativních chorob a demence.

Do tohoto projektu je zapojeno oddělení neurověd a centrum Alzheimerovy choroby z Fakultní nemocnice v Toulouse. Hlubinnou proteomickou studii provádí v Toulouse Ústav farmakologie a strukturní biologie s akademickou podporou Ústavu matematiky v Toulouse.