Aivo-selkäydinnesteen proteomi hydrokefaluksessa (PROLIPHYC)

CSF-proteomi on reaaliaikainen proteiinipitoisuus, joka voi paljastaa hyödyllisiä biomarkkereita diagnoosia ja terapeuttista päätöksentekoa varten. Mutta alhainen proteiinipitoisuus aivoselkäydinnesteessä ja tyypillisesti lannepunktion jälkeen saadut pienet tilavuudet estävät proteomisen analyysin tavanomaisen käytön. Pienoisimme menetelmän yhteensopivaksi pienitilavuuksisten näytteiden kanssa yhdistämällä nanoLC-MS/MS-analyysin ja kombinatorisen peptidiligandikirjastoteknologian proteiinipitoisuuden dynaamisen alueen vähentämiseksi CSF:ssä ja paljastaaksemme aiemmin havaitsemattomat proteiinit. Osoitimme, että tämä syvä proteominen analyysi mahdollistaa CSF-proteomin profiloinnin kohtuullisella syvyydellä, lyhyissä analyyttisissa aioissa ja hyvällä tarkkuudella. Päätimme kliinisesti yhteensopivan proteomiikan strategian, jonka kohteena on syvä CSF-proteomin löytö.

PROLIPHYC-tutkimus on prospektiivinen tutkimus, jonka tarkoituksena on analysoida CSF-proteomia uudella strategiallamme potilaiden ryhmässä, joilla epäillään normaalipaineista vesipää ja/tai siihen liittyviä hermostoa rappeuttavia sairauksia. PROLIPHYC-projekti yhdistää yksityiskohtaisen kliinisen ja neuropsykologisen arvioinnin, kävelyanalyysin, aivojen MRI-kuvauksen, lannerangan CSF-dynamiikan ja syvän proteomin. Oletamme PROLIPHYC-tutkimuksessa, että tietty polypeptidiklusteri voi liittyä Alzheimerin tautiin, verisuonidementiaan ja normaalipaineisiin vesipääprofiileihin. Tämän hypoteesin vahvistaminen voi olla merkittävä askel kohti ikääntyvien aivojen, neurodegeneratiivisten sairauksien ja dementian proteomista sanakirjaa.

Toulousen yliopistollisen sairaalan neurotieteiden osasto ja Alzheimerin tautikeskus ovat molemmat mukana tässä hankkeessa. Syvän proteomisen tutkimuksen suorittaa Toulousessa Farmakologian ja rakennebiologian instituutti Toulousen matematiikan instituutin akateemisella tuella.