Cerebrospinale vloeistof proteoom in hydrocephalus (PROLIPHYC)

CSF-proteoom is het real-time eiwitgehalte dat bruikbare biomarkers kan onthullen voor diagnose en therapeutische besluitvorming. Maar de lage eiwitconcentratie in CSF en de lage volumes die doorgaans worden verkregen na lumbaalpunctie, sluiten het conventionele gebruik van proteomische analyse uit. We hebben de methode geminiaturiseerd om compatibel te zijn met monsters met een laag volume door een combinatie van nanoLC-MS/MS-analyse en combinatorische peptideligandbibliotheektechnologie om het dynamische bereik van eiwitconcentratie in CSF te verminderen en eerder niet-gedetecteerde eiwitten te ontmaskeren. We hebben aangetoond dat deze diepe proteomische analyse het mogelijk maakt om het CSF-proteoom te profileren met een redelijke diepte, in korte analytische tijden en met een goede nauwkeurigheid. We hebben een klinisch compatibele proteomics-strategie vastgesteld die gericht is op de diepe CSF-proteoomontdekking.

De PROLIPHYC-studie is een prospectieve studie die gericht is op het analyseren van CSF-proteoom met onze nieuwe strategie in een cohort van patiënten die verdacht worden van normale druk hydrocephalus en/of gerelateerde neurodegeneratieve ziekten. Het PROLIPHYC-project combineert gedetailleerde klinische en neuropsychologische evaluatie, ganganalyse, MRI-hersenbeeldvorming, lumbale CSF-dynamiek en diep proteoom. We veronderstellen in de PROLIPHYC-studie dat een specifiek cluster van polypeptiden kan worden geassocieerd met de ziekte van Alzheimer, vasculaire dementie en normale druk hydrocephalusprofielen. Het valideren van deze hypothese zou een belangrijke stap kunnen zijn in de richting van een proteomisch lexicon van ouder wordende hersenen, neurodegeneratieve ziekten en dementie.

De afdeling neurowetenschappen en het centrum voor de ziekte van Alzheimer van het Universitair Ziekenhuis van Toulouse zijn beide bij dit project betrokken. De diepe proteomische studie wordt uitgevoerd in Toulouse door het Instituut voor Farmacologie en Structurele Biologie met de academische steun van het Instituut voor Wiskunde van Toulouse.