Cerebrospinalvæskeproteom i hydrocephalus (PROLIPHYC)

CSF-proteom er proteinindholdet i realtid, der kan afsløre nyttige biomarkører til diagnose og terapeutisk beslutningstagning. Men den lave proteinkoncentration i CSF og de lave volumener, der typisk opnås efter lumbalpunktur, udelukker den konventionelle brug af proteomisk analyse. Vi miniaturiserede metoden til at være kompatibel med lavvolumenprøver ved kombination af nanoLC-MS/MS-analyse og kombinatorisk peptidligandbiblioteksteknologi for at reducere det dynamiske område af proteinkoncentration i CSF og afsløre tidligere uopdagede proteiner. Vi demonstrerede, at denne dybe proteomiske analyse tillader profilering af CSF-proteomet med en rimelig dybde, i korte analytiske tider og god nøjagtighed. Vi afgjorde en klinisk kompatibel proteomikstrategi rettet mod den dybe CSF-proteomopdagelse.

PROLIPHYC-studiet er et prospektivt studie, der har til formål at analysere CSF-proteomer med vores nye strategi i en kohorte af patienter, der mistænkes for normalt tryk hydrocephalus og/eller relaterede neurodegenerative sygdomme. PROLIPHYC-projektet kombinerer detaljeret klinisk og neuropsykologisk evaluering, ganganalyse, MR-hjernebilleddannelse, lumbal CSF-dynamik og dybt proteom. Vi antager i PROLIPHYC-studiet, at en specifik klynge af polypeptider kan associeres med Alzheimers sygdom, vaskulær demens og normal tryk hydrocephalus profiler. Validering af denne hypotese kan være et væsentligt skridt hen imod et proteomisk leksikon for aldrende hjerne, neurodegenerative sygdomme og demens.

Neurovidenskabsafdelingen og Alzheimers sygdomscenter fra Toulouse Universitetshospital er begge involveret i dette projekt. Den dybe proteomiske undersøgelse udføres i Toulouse af Institute of Pharmacology and Structural Biology med akademisk støtte fra Institute of Mathematics of Toulouse.