Cerebrospinalvätskeproteom vid hydrocefalus (PROLIPHYC)

CSF-proteom är proteininnehållet i realtid som kan avslöja användbara biomarkörer för diagnos och terapeutiskt beslutsfattande. Men den låga proteinkoncentrationen i CSF och de låga volymerna som vanligtvis erhålls efter lumbalpunktion utesluter den konventionella användningen av proteomisk analys. Vi miniatyriserade metoden för att vara kompatibel med lågvolymprover genom kombination av nanoLC-MS/MS-analys och kombinatorisk peptidligandbiblioteksteknologi för att minska det dynamiska området för proteinkoncentration i CSF och avslöja tidigare oupptäckta proteiner. Vi visade att denna djupa proteomiska analys tillåter profilering av CSF-proteomet med ett rimligt djup, på korta analytiska tider och god noggrannhet. Vi gjorde upp en kliniskt kompatibel proteomikstrategi inriktad på upptäckten av djupa CSF-proteomer.

PROLIPHYC-studien är en prospektiv studie som syftar till att analysera CSF-proteom med vår nya strategi i en kohort av patienter som misstänks för normaltryckshydrocefalus och/eller relaterade neurodegenerativa sjukdomar. PROLIPHYC-projektet kombinerar detaljerad klinisk och neuropsykologisk utvärdering, gånganalys, MRT-hjärnavbildning, lumbal CSF-dynamik och djupt proteom. Vi antar i PROLIPHYC-studien att ett specifikt kluster av polypeptider kan associeras med Alzheimers sjukdom, vaskulär demens och hydrocefalusprofiler med normalt tryck. Att validera denna hypotes kan vara ett viktigt steg mot ett proteomiskt lexikon för åldrande hjärna, neurodegenerativa sjukdomar och demens.

Neurovetenskapsavdelningen och Alzheimers sjukdomscentrum från Toulouse University Hospital är båda involverade i detta projekt. Den djupa proteomiska studien utförs i Toulouse av Institute of Pharmacology and Structural Biology med akademiskt stöd från Institute of Mathematics of Toulouse.