Sekvenování celého genomu pro genotypizaci a definici krevní skupiny, jak je doloženo na U- a St(a)+. (Blood Genome)
Použitelnost sekvenování celého genomu pro genotypizaci lidských krevních skupin a genetickou definici nových alel, jak je doloženo na referencích a dvou variantách MNS: U- a kameny(a)+
Nejsou studovány žádné zdravotní stavy. Studuje se genetické pozadí krevních skupin. U- a Stones(a)+ ("kavkazský typ") se používají jako vzorky pro důkaz principu. Chorobné asociace všech zkoumaných genů krevních skupin jsou velmi vzácné, např. < 1 mezi 1 000 švýcarskými jedinci (viz tabulka 1) a v průběhu této studie se neočekávají.
Genomová DNA 2 vzorků U- byly oba poskytnuty jako slepý referenční materiál z krevních center v New Yorku a Vídni, v daném pořadí. Oba dárci jsou ztraceni pro další sledování, a přestože neexistují žádné zdokumentované důkazy pro odmítnutí příslušných dárců použít jejich materiál ve výzkumných projektech, vzorky stále postrádají informovaný souhlas.
Přehled studie
Postavení
Intervence / Léčba
Detailní popis
Všech 34 systémů lidských krevních skupin má alespoň dva antitetické antigeny a jsou potenciálně relevantní během těhotenství a transfuze. Naštěstí pro každodenní rutinní praxi jsou imunizace cizími antigeny vzácné. Přesto se mohou inkompatibility vyskytnout ve všech systémech krevních skupin a budou pak vyžadovat typizaci příslušných antigenů krevních skupin.
Genotypizace krve se vyvinula jako metoda volby v případech, kdy jsou typizační činidla komerčně nedostupná nebo krev nedostupná (plod). V databázích většina záznamů genů krevních skupin postrádá reprezentativní polymorfismus (např. počet alel). Navíc mnoho antigenů krevních skupin je nedostatečně popsáno v jejich intronových a intergenetických sekvencích. To platí pro výsledky nestejných křížení, genových konverzí a velkých inzercí/delecí mezi vysoce homologními geny, zejména v systémech krevních skupin Rhesus, např. RhD/RhCE a MN/Ss. Pouze Whole Genome Sequencing (WGS) umožňuje řešení obou problémů: dodává celý genom krevní skupiny jedince a současně rozpoznává nové alely krevních skupin neboli haplotypy. Tato žádost o etické schválení chce tento předpoklad otestovat.
Antigenní determinanty U- a Stones(a)+ systému krevních skupin MNS stále postrádají úplný genetický popis a budou sloužit jako náročné příklady pro popis nových alel (haplotypů) způsobených velkými mutacemi ins/del dvou vysoce homologních genů. GYPA a B. Genomová DNA 2 vzorků U- byly oba poskytnuty jako slepý referenční materiál z krevních center v New Yorku a Vídni, v daném pořadí. Oba dárci jsou ztraceni pro další sledování, a přestože neexistují žádné zdokumentované důkazy pro odmítnutí příslušných dárců použít jejich materiál ve výzkumných projektech, vzorky stále postrádají informovaný souhlas. Další referenční vzorky (n max=4) a vzorky s podezřením na kameny(a)+ (n max=4) budou získány od dárců krve z Curychu pouze s informovaným souhlasem.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
Zürich
-
Schlieren, Zürich, Švýcarsko, 8952
- Nábor
- Blutpende Zürich, Dienstleistungszentrum
-
Kontakt:
- Christoph Gassner, PhD
- Telefonní číslo: +41 58 272 5195
- E-mail: c.gassner@zhbsd.ch
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Stávající biomateriál (gDNA), popř
- Stávající údaje týkající se zdraví pro krevní skupinu U- (n max=2) a způsobilé pro (venózní) odběr 20 ml krve nebo
- Stávající údaje o feno- a genotypizaci krevních skupin indikující St(a)+ a způsobilé pro (venózní) odběr krve 20 ml (n max=2), nebo
- Adekvátní profil krevních skupin sloužící jako referenční (n max = 4 & n max = 4'000) a vhodný pro odběr (venózní) krve o objemu 20 ml.
Kritéria vyloučení:
- Nevhodné pro odběr žilní krve cca. 20 ml.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Case-Control
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
lidé negativní na bg MNSs antigen U
Systém krevních skupin (bg) MNS.
Jedinci s fenotypem "U-".
Mohou být zvažováni homo- a heterozygotní jedinci.
|
V průběhu rutinního darování krve (450 ml krve) u 8 z 10 jedinců, kteří mají být zahrnuti jako vzorky nebo referenční vzorky do studie, nebudou zapotřebí žádné jiné zásahy než odběr krve (20 ml krve).
|
|
lidé pozitivní na bg MNSs antigen St(a)
Systém krevních skupin (bg) MNS.
Jedinci s fenotypem "St(a)+".
Mohou být zvažováni homo- a heterozygotní jedinci.
|
V průběhu rutinního darování krve (450 ml krve) u 8 z 10 jedinců, kteří mají být zahrnuti jako vzorky nebo referenční vzorky do studie, nebudou zapotřebí žádné jiné zásahy než odběr krve (20 ml krve).
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Sekvenování celého genomu pro definici genetického pozadí pro antigeny krevních skupin U-, St(a)+
Časové okno: 2 roky
|
Během 2 letého období bude generování a analýza celogenomových sekvenačních dat využito pro analýzu a popis genetického pozadí pro negativitu krevních skupin antigenů U a pro St(a).
|
2 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Christoph Gassner, PhD, Blutspende Zürich, Dienstleistungszentrum
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia
Primární dokončení (Očekávaný)
Dokončení studie (Očekávaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhad)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Odhad)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další identifikační čísla studie
- KEK-ZH-Nr. 2014-0408
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .