用于血型基因分型和定义的全基因组测序,以 U- 和 St(a)+ 为例。 (Blood Genome)
全基因组测序对人类血型基因分型和新等位基因遗传定义的适用性,以参考文献和两个 MNS 变体为例:U- 和 Stones(a)+
没有研究健康状况。 研究了血型的遗传背景。 U- 和 Stones(a)+(“高加索类型”)用作原理验证样本。 所有研究的血型基因的疾病关联都非常罕见,例如 在 1'000 名瑞士人中 < 1 人(见表 1),并且预计不会出现在本研究的过程中。
2 个 U-样本的基因组 DNA 均作为盲参考材料分别从纽约和维也纳血液中心提供。 两位捐助者都没有跟进,虽然没有书面证据表明各自的捐助者拒绝在研究项目中使用他们的材料,但样本仍然缺乏知情同意。
研究概览
详细说明
所有 34 种人类血型系统都有至少两种对立抗原,并且在怀孕和输血期间具有潜在相关性。 幸运的是,对于每天的常规实践,对外来抗原的免疫接种很少见。 尽管如此,所有血型系统都可能出现不相容性,然后需要对各自的血型抗原进行分型。
血液基因分型演变为一种选择方法,以防商业上无法获得分型试剂或无法获得血液(胎儿)。 在数据库中,大多数血型基因条目缺乏代表性的多态性(例如 等位基因的数量)。 此外,许多血型抗原在其内含子和基因间序列中的描述不充分。 对于高度同源基因之间的不等交叉、基因转换和大插入/缺失的结果,尤其是在恒河猴的血型系统中,例如 分别为 RhD/RhCE 和 MN/Ss。 只有全基因组测序 (WGS) 可以解决这两个问题:它提供个体的全血型基因组,同时识别新的血型等位基因或单倍型。 这个伦理批准请求想要检验这个假设。
血型系统 MNSs 的抗原决定簇 U- 和 Stones(a)+ 仍然缺乏完整的遗传描述,将作为描述两个高度同源基因的大 ins/del 突变引起的新等位基因(单倍型)的具有挑战性的例子GYPA 和 B. 2 个 U 样本的基因组 DNA 均作为盲参考材料分别从纽约和维也纳血液中心提供。 两位捐助者都没有跟进,虽然没有书面证据表明各自的捐助者拒绝在研究项目中使用他们的材料,但样本仍然缺乏知情同意。 额外的参考样本 (n max=4) 和疑似 Stones(a)+ (n max=4) 的样本仅在知情同意的情况下从苏黎世献血者中招募。
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名:Christoph Gassner, PhD
- 电话号码:+41 58 272 5195
- 邮箱:c.gassner@zhbsd.ch
学习地点
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Zürich
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Schlieren、Zürich、瑞士、8952
- 招聘中
- Blutpende Zürich, Dienstleistungszentrum
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接触:
- Christoph Gassner, PhD
- 电话号码:+41 58 272 5195
- 邮箱:c.gassner@zhbsd.ch
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
- 现有的生物材料 (gDNA),或
- 血型 U- (n max=2) 的现有健康相关数据并且符合 20 mL(静脉)血液采样的条件,或
- 现有血型表型和基因分型数据表明 St(a)+ 并且符合 20 mL(n max = 2)(静脉)血液采样的条件,或
- 充分的血型概况作为参考(n max = 4 & n max = 4'000)并且有资格进行 20 mL(静脉)血液采样。
排除标准:
- 不符合静脉血采样的条件。 20 毫升。
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
- 观测模型:病例对照
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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bg MNSs 抗原 U 呈阴性的人
血型 (bg) 系统 MNS。
表型为“U-”的个体。
可以考虑纯合子和杂合子个体。
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对于计划作为标本或参考样本纳入研究的 10 人中的 8 人,在常规献血(450 毫升血液)过程中,除了采血(20 毫升血液)外,不需要任何干预措施。
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bg MNSs 抗原 St(a) 呈阳性的人
血型 (bg) 系统 MNS。
表型为“St(a)+”的个体。
可以考虑纯合子和杂合子个体。
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对于计划作为标本或参考样本纳入研究的 10 人中的 8 人,在常规献血(450 毫升血液)过程中,除了采血(20 毫升血液)外,不需要任何干预措施。
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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全基因组测序,用于定义血型抗原 U-、St(a)+ 的遗传背景
大体时间:2年期间
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在 2 年的时间段内,全基因组测序数据的生成和分析将用于分析和描述血型抗原 U 阴性和 St(a) 的遗传背景。
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2年期间
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员:Christoph Gassner, PhD、Blutspende Zürich, Dienstleistungszentrum
研究记录日期
研究主要日期
学习开始
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (估计)
研究记录更新
最后更新发布 (估计)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
与本研究相关的术语
其他研究编号
- KEK-ZH-Nr. 2014-0408
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