Sequenzierung des gesamten Genoms zur Blutgruppen-Genotypisierung und -Definition am Beispiel von U- und St(a)+. (Blood Genome)

Alle 34 menschlichen Blutgruppensysteme haben mindestens zwei antithetische Antigene und sind von potenzieller Relevanz während Schwangerschaft und Transfusion. Zum Glück für die tägliche Routinepraxis sind Immunisierungen gegen fremde Antigene selten. Dennoch können bei allen Blutgruppensystemen Inkompatibilitäten auftreten, die dann eine Typisierung der jeweiligen Blutgruppenantigene erforderlich machen.

Die Blut-Genotypisierung hat sich als Methode der Wahl entwickelt, wenn Typisierungsreagenzien kommerziell nicht erhältlich sind oder Blut nicht zugänglich ist (Fötus). In Datenbanken fehlen den meisten Einträgen von Blutgruppengenen repräsentative Polymorphismen (z. Anzahl Allele). Darüber hinaus sind viele Blutgruppenantigene in ihren intronischen und intergenetischen Sequenzen unzureichend beschrieben. Dies gilt für Ergebnisse von ungleichen Kreuzungen, Genumwandlungen und großen Insertionen/Deletionen zwischen hochgradig homologen Genen, insbesondere innerhalb der Blutgruppensysteme von Rhesus, z. RhD/RhCE bzw. MN/Ss. Nur die Gesamtgenomsequenzierung (WGS) ermöglicht die Lösung beider Probleme: Sie liefert das gesamte Blutgruppengenom eines Individuums und erkennt gleichzeitig neue Blutgruppenallele oder Haplotypen. Dieser Antrag auf ethische Zustimmung will diese Annahme überprüfen.

Die antigenen Determinanten U- und Stones(a)+ des Blutgruppensystems MNSs sind noch nicht vollständig genetisch beschrieben und werden als herausfordernde Beispiele für die Beschreibung neuer Allele (Haplotypen) dienen, die durch große ins/del-Mutationen der beiden hochgradig homologen Gene verursacht werden GYPA und B. Genomische DNA von 2 U-Proben wurden beide als verblindetes Referenzmaterial von Blutzentren in New York bzw. Wien bereitgestellt. Beide Spender gehen für die Nachsorge verloren, und obwohl es keine dokumentierten Beweise für die Weigerung der jeweiligen Spender gibt, ihr Material in Forschungsprojekten zu verwenden, fehlt den Proben immer noch die Einverständniserklärung. Zusätzliche Referenzproben (n max=4) und Proben mit Verdacht auf Stones(a)+ (n max=4) werden nur mit informierter Einwilligung von Zürcher Blutspendern rekrutiert.