Sequentiebepaling van het hele genoom voor genotypering en definitie van bloedgroepen zoals geïllustreerd op U- en St(a)+. (Blood Genome)
Toepasbaarheid van sequentiebepaling van het hele genoom voor genotypering van menselijke bloedgroepen en genetische definitie van nieuwe allelen zoals toegelicht in referenties en de twee MNS-varianten: U- en Stones(a)+
Er worden geen gezondheidstoestand(en) bestudeerd. De genetische achtergrond van bloedgroepen wordt bestudeerd. U- en Stones(a)+ ("Kaukasisch type") worden gebruikt als proof-of-principle-voorbeelden. Ziekteassociaties van alle onderzochte bloedgroepgenen zijn zeer zeldzaam, b.v. < 1 onder 1.000 Zwitserse individuen (zie tabel 1), en zijn niet te verwachten in de loop van dit onderzoek.
Genomisch DNA van 2 U-monsters werd beide verstrekt als geblindeerd referentiemateriaal van respectievelijk bloedcentra in New York en Wenen. Beide donoren zijn verloren voor follow-up, en hoewel er geen gedocumenteerd bewijs is voor de weigering van de respectievelijke donoren om hun materiaal in onderzoeksprojecten te gebruiken, missen monsters nog steeds geïnformeerde toestemming.
Studie Overzicht
Toestand
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Alle 34 menselijke bloedgroepsystemen hebben ten minste twee antithetische antigenen en zijn mogelijk relevant tijdens zwangerschap en transfusie. Gelukkig zijn in de dagelijkse praktijk immunisaties tegen vreemde antigenen zeldzaam. Toch kunnen er onverenigbaarheden optreden in alle bloedgroepsystemen, waardoor typering van de respectieve bloedgroepantigenen nodig is.
Bloedgenotypering is geëvolueerd als de voorkeursmethode, in gevallen waarin reagentia voor typering commercieel niet beschikbaar zijn, of bloed niet toegankelijk is (foetus). In databases missen de meeste invoer van bloedgroepgenen representatief polymorfisme (bijv. aantal allelen). Bovendien zijn veel bloedgroepantigenen onvoldoende beschreven in hun intronische en intergenetische sequenties. Dit geldt voor resultaten van ongelijke kruisingen, genconversies en grote inserties/deleties tussen zeer homologe genen, vooral binnen de bloedgroepsystemen van Rhesus, b.v. respectievelijk RhD/RhCE en MN/Ss. Alleen Whole Genome Sequencing (WGS) maakt het mogelijk om beide problemen op te lossen: het levert het hele bloedgroepgenoom van een individu en herkent tegelijkertijd nieuwe bloedgroepallelen of haplotypes. Dit verzoek om ethische goedkeuring wil deze veronderstelling testen.
De antigene determinanten U- en Stones(a)+ van de MNS's van het bloedgroepsysteem missen nog steeds een volledige genetische beschrijving en zullen dienen als uitdagende voorbeelden voor de beschrijving van nieuwe allelen (haplotypes) veroorzaakt door grote ins/del-mutaties van de twee zeer homologe genen GYPA en B. Genomisch DNA van 2 U-monsters werden beide verstrekt als geblindeerd referentiemateriaal van respectievelijk bloedcentra in New York en Wenen. Beide donoren zijn verloren voor follow-up, en hoewel er geen gedocumenteerd bewijs is voor de weigering van de respectievelijke donoren om hun materiaal in onderzoeksprojecten te gebruiken, missen monsters nog steeds geïnformeerde toestemming. Aanvullende referentiemonsters (n max=4) en monsters met verdenking op Stones(a)+ (n max=4) zullen alleen met geïnformeerde toestemming worden gerekruteerd van bloeddonoren uit Zürich.
Studietype
Inschrijving (Verwacht)
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
Zürich
-
Schlieren, Zürich, Zwitserland, 8952
- Werving
- Blutpende Zürich, Dienstleistungszentrum
-
Contact:
- Christoph Gassner, PhD
- Telefoonnummer: +41 58 272 5195
- E-mail: c.gassner@zhbsd.ch
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Bestaand biomateriaal (gDNA), of
- Bestaande gezondheidsgerelateerde gegevens voor bloedgroep U- (n max=2) en in aanmerking komend voor (veneuze) bloedafname van 20 ml, of
- Bestaande feno- en genotyperingsgegevens van de bloedgroep die St(a)+ aangeven en in aanmerking komen voor (veneuze) bloedafname van 20 ml (n max=2), of
- Adequaat bloedgroepprofiel dient als referentie (n max =4 & n max =4'000) en komt in aanmerking voor (veneuze) bloedafname van 20 ml.
Uitsluitingscriteria:
- Komt niet in aanmerking voor veneuze bloedafname van ca. 20 ml.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Case-control
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
mensen negatief in bg MNSs antigeen U
Bloedgroep (bg) systeem MZS'en.
Individuen met fenotype "U-".
Homo- en heterozygote personen kunnen worden overwogen.
|
Er zijn geen andere interventies nodig dan bloedafname (20 ml bloed) tijdens routinematige bloeddonatie (450 ml bloed) voor 8 van de 10 personen die gepland zijn om als monster of referentiemonsters in het onderzoek te worden opgenomen.
|
|
mensen positief in bg MNSs antigeen St(a)
Bloedgroep (bg) systeem MZS'en.
Individuen met fenotype "St(a)+".
Homo- en heterozygote personen kunnen worden overwogen.
|
Er zijn geen andere interventies nodig dan bloedafname (20 ml bloed) tijdens routinematige bloeddonatie (450 ml bloed) voor 8 van de 10 personen die gepland zijn om als monster of referentiemonsters in het onderzoek te worden opgenomen.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Whole Genome Sequencing voor de definitie van genetische achtergrond voor bloedgroepantigenen U-, St(a)+
Tijdsspanne: Periode van 2 jaar
|
Gedurende een periode van 2 jaar zullen de generatie en analyse van de sequentiegegevens van het hele genoom worden gebruikt voor de analyse en beschrijving van de genetische achtergrond voor de bloedgroepantigenen U negativiteit, en voor St(a).
|
Periode van 2 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Christoph Gassner, PhD, Blutspende Zürich, Dienstleistungszentrum
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start
Primaire voltooiing (Verwacht)
Studie voltooiing (Verwacht)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Schatting)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Schatting)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Andere studie-ID-nummers
- KEK-ZH-Nr. 2014-0408
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .